22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_2867 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001800  Ssol_2867  ATPase  100 
 
 
386 aa  767    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0542  ATPase  40.78 
 
 
377 aa  288  1e-76  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1172  ATPase  38.64 
 
 
374 aa  281  2e-74  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.0968898 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0177  ATPase  33.85 
 
 
368 aa  196  6e-49  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.335522 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2817  ATPase  33.68 
 
 
360 aa  154  2e-36  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0433  ATPase  27.55 
 
 
359 aa  103  6e-21  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.520428  hitchhiker  0.00910824 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1933  ATPase  27.82 
 
 
356 aa  101  2e-20  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0359991  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1584  ATPase  26.77 
 
 
356 aa  94.7  2e-18  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0384  ATPase  26.8 
 
 
361 aa  91.3  3e-17  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  unclonable  0.000000176931  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0150  ATPase  25.13 
 
 
360 aa  86.3  8e-16  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2379  ATPase  26.49 
 
 
356 aa  83.2  0.000000000000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1267  ATPase  27.33 
 
 
342 aa  82  0.00000000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0503  ATPase  25.65 
 
 
377 aa  80.5  0.00000000000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.241974 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2746  ATPase  28.21 
 
 
387 aa  77.8  0.0000000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0705142  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1746  hypothetical protein  28.7 
 
 
373 aa  69.3  0.0000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000207576  normal  0.634791 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1319  ATPase  28.01 
 
 
312 aa  68.6  0.0000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1739  ATPase  26.46 
 
 
383 aa  67.4  0.0000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1794  ATPase  26.52 
 
 
365 aa  67  0.0000000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0171546  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1486  ATPase  28.76 
 
 
350 aa  63.5  0.000000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.659076  normal  0.220459 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0840  ribosome assembly protein 4 (RSA4)  22.76 
 
 
1868 aa  53.5  0.000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0415  ATPase  25.11 
 
 
476 aa  48.5  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.336627  normal  0.189156 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4454  hypothetical protein  28.28 
 
 
917 aa  45.1  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>