27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cmaq_1486 on replicon NC_009954
Organism: Caldivirga maquilingensis IC-167



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009954  Cmaq_1486  ATPase  100 
 
 
350 aa  705    Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.659076  normal  0.220459 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1933  ATPase  38.66 
 
 
356 aa  225  8e-58  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0359991  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0503  ATPase  36.59 
 
 
377 aa  219  6e-56  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.241974 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1584  ATPase  36.64 
 
 
356 aa  185  9e-46  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0384  ATPase  34.25 
 
 
361 aa  179  7e-44  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  unclonable  0.000000176931  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1739  ATPase  33.42 
 
 
383 aa  177  2e-43  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1794  ATPase  33.15 
 
 
365 aa  176  4e-43  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0171546  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0150  ATPase  31.22 
 
 
360 aa  171  2e-41  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0433  ATPase  30.94 
 
 
359 aa  167  2.9999999999999998e-40  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.520428  hitchhiker  0.00910824 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1267  ATPase  35.39 
 
 
342 aa  166  6.9999999999999995e-40  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2379  ATPase  30.98 
 
 
356 aa  159  6e-38  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1319  ATPase  35.4 
 
 
312 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2746  ATPase  31.36 
 
 
387 aa  114  2.0000000000000002e-24  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0705142  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1172  ATPase  25.41 
 
 
374 aa  79.3  0.00000000000009  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.0968898 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0542  ATPase  28.81 
 
 
377 aa  76.3  0.0000000000008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0177  ATPase  24.46 
 
 
368 aa  63.9  0.000000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.335522 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2867  ATPase  28.76 
 
 
386 aa  63.5  0.000000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2649  ATPase  26.28 
 
 
461 aa  59.7  0.00000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2817  ATPase  25 
 
 
360 aa  58.2  0.0000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2684  ATPase  25.55 
 
 
463 aa  54.3  0.000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4044  ATPase  24.39 
 
 
463 aa  51.6  0.00002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1512  putative AAA+ superfamily ATPase  22.39 
 
 
470 aa  51.2  0.00003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.406409  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0533  ATPase  22.8 
 
 
439 aa  48.1  0.0002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.543241  normal  0.111274 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2436  ATPase  24.64 
 
 
460 aa  45.8  0.001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1821  ATPase  25.26 
 
 
450 aa  44.3  0.003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2362  ATPase  34.07 
 
 
464 aa  43.9  0.004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1446  ATPase  22.8 
 
 
439 aa  43.1  0.007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.239907 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>