28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cmaq_1933 on replicon NC_009954
Organism: Caldivirga maquilingensis IC-167



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009954  Cmaq_1933  ATPase  100 
 
 
356 aa  706    Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0359991  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1486  ATPase  38.66 
 
 
350 aa  225  8e-58  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.659076  normal  0.220459 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0503  ATPase  37.03 
 
 
377 aa  216  5.9999999999999996e-55  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.241974 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0384  ATPase  37.06 
 
 
361 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  unclonable  0.000000176931  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2379  ATPase  34.62 
 
 
356 aa  198  1.0000000000000001e-49  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0433  ATPase  37.57 
 
 
359 aa  192  1e-47  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.520428  hitchhiker  0.00910824 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1794  ATPase  37.05 
 
 
365 aa  191  2e-47  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0171546  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1739  ATPase  36.49 
 
 
383 aa  191  2e-47  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1267  ATPase  36.91 
 
 
342 aa  190  4e-47  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0150  ATPase  37.53 
 
 
360 aa  178  1e-43  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1584  ATPase  32.8 
 
 
356 aa  175  9.999999999999999e-43  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2746  ATPase  31.22 
 
 
387 aa  144  3e-33  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0705142  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1319  ATPase  39.06 
 
 
312 aa  140  3e-32  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2867  ATPase  27.32 
 
 
386 aa  100  4e-20  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0542  ATPase  26.11 
 
 
377 aa  81.3  0.00000000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0177  ATPase  25.81 
 
 
368 aa  77  0.0000000000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.335522 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1172  ATPase  24.93 
 
 
374 aa  72.4  0.00000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.0968898 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2817  ATPase  24.57 
 
 
360 aa  58.9  0.0000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1429  putative AAA+ superfamily ATPase  27.66 
 
 
473 aa  54.3  0.000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.541066  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1821  ATPase  25.22 
 
 
450 aa  48.9  0.0001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1512  putative AAA+ superfamily ATPase  25.97 
 
 
470 aa  48.9  0.0001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.406409  n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4809  ATPase  24.11 
 
 
460 aa  48.1  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2275  ATPase  27.22 
 
 
496 aa  43.9  0.004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4199  ATPase  31.4 
 
 
471 aa  43.5  0.005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.593601  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1683  ATPase  25 
 
 
456 aa  43.5  0.005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0421559  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1025  ATPase  25.41 
 
 
454 aa  43.1  0.007  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.656086  normal  0.0180232 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2684  ATPase  27.08 
 
 
463 aa  43.1  0.008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1537  ATPase  29.21 
 
 
464 aa  42.7  0.009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.479678  normal  0.0536722 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>