27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pars_0384 on replicon NC_009376
Organism: Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009376  Pars_0384  ATPase  100 
 
 
361 aa  729    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  unclonable  0.000000176931  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2379  ATPase  45.81 
 
 
356 aa  337  1.9999999999999998e-91  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0433  ATPase  40.44 
 
 
359 aa  224  1e-57  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.520428  hitchhiker  0.00910824 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0150  ATPase  40.44 
 
 
360 aa  218  8.999999999999998e-56  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0503  ATPase  40.11 
 
 
377 aa  207  3e-52  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.241974 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1933  ATPase  37.06 
 
 
356 aa  201  1.9999999999999998e-50  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0359991  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1739  ATPase  36.67 
 
 
383 aa  197  3e-49  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1267  ATPase  38.94 
 
 
342 aa  191  2e-47  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1794  ATPase  36.11 
 
 
365 aa  191  2e-47  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0171546  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1319  ATPase  43.44 
 
 
312 aa  187  2e-46  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1584  ATPase  35.39 
 
 
356 aa  185  8e-46  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1486  ATPase  34.25 
 
 
350 aa  179  7e-44  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.659076  normal  0.220459 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2746  ATPase  28.33 
 
 
387 aa  152  1e-35  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0705142  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2867  ATPase  27.37 
 
 
386 aa  89  1e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2817  ATPase  26.22 
 
 
360 aa  80.1  0.00000000000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0177  ATPase  25.59 
 
 
368 aa  80.1  0.00000000000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.335522 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1172  ATPase  24.08 
 
 
374 aa  68.9  0.0000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.0968898 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0542  ATPase  23.59 
 
 
377 aa  61.6  0.00000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1767  ATPase  25 
 
 
456 aa  56.2  0.0000009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.53247  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1683  ATPase  25.63 
 
 
456 aa  52.4  0.00001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0421559  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2078  hypothetical protein  20.83 
 
 
390 aa  50.4  0.00005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4044  ATPase  24.5 
 
 
463 aa  49.7  0.00008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2684  ATPase  24.29 
 
 
463 aa  47.8  0.0003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1345  ATPase  21.04 
 
 
456 aa  46.6  0.0007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1415  hypothetical protein  25.95 
 
 
195 aa  44.7  0.003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2641  ATPase  23.71 
 
 
458 aa  43.1  0.007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.337326  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2275  ATPase  26.11 
 
 
496 aa  42.7  0.009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>