31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TRQ2_1794 on replicon NC_010483
Organism: Thermotoga sp. RQ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010483  TRQ2_1794  ATPase  100 
 
 
365 aa  724    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0171546  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1739  ATPase  97.26 
 
 
383 aa  709    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0503  ATPase  36.6 
 
 
377 aa  198  2.0000000000000003e-49  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.241974 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1933  ATPase  37.05 
 
 
356 aa  191  2e-47  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0359991  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0384  ATPase  36.11 
 
 
361 aa  191  2e-47  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  unclonable  0.000000176931  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2379  ATPase  35.81 
 
 
356 aa  188  1e-46  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1267  ATPase  37.57 
 
 
342 aa  184  3e-45  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1584  ATPase  36.74 
 
 
356 aa  184  3e-45  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1486  ATPase  33.15 
 
 
350 aa  176  4e-43  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.659076  normal  0.220459 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0150  ATPase  32.88 
 
 
360 aa  155  8e-37  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0433  ATPase  31.78 
 
 
359 aa  152  8.999999999999999e-36  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.520428  hitchhiker  0.00910824 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2746  ATPase  26.83 
 
 
387 aa  128  2.0000000000000002e-28  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0705142  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1319  ATPase  32.63 
 
 
312 aa  126  7e-28  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0177  ATPase  25.81 
 
 
368 aa  73.6  0.000000000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.335522 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1172  ATPase  25.2 
 
 
374 aa  71.2  0.00000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.0968898 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2867  ATPase  25.51 
 
 
386 aa  64.7  0.000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0542  ATPase  26.12 
 
 
377 aa  63.9  0.000000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2817  ATPase  24.59 
 
 
360 aa  58.5  0.0000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0840  ribosome assembly protein 4 (RSA4)  24.8 
 
 
1868 aa  55.1  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1429  putative AAA+ superfamily ATPase  26.78 
 
 
473 aa  54.7  0.000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.541066  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0133  DUF234 DEXX-box ATPase  23.58 
 
 
462 aa  49.7  0.00008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0812652  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2684  ATPase  25.12 
 
 
463 aa  49.3  0.0001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0485  ATPase  30.41 
 
 
454 aa  48.5  0.0002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1537  ATPase  27.36 
 
 
464 aa  48.1  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.479678  normal  0.0536722 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1093  ATPase  24.12 
 
 
457 aa  47.8  0.0003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1821  ATPase  26.51 
 
 
450 aa  46.6  0.0007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4044  ATPase  23.86 
 
 
463 aa  46.2  0.0008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2557  ATPase  27.45 
 
 
485 aa  45.1  0.002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.928709  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2436  ATPase  23.88 
 
 
460 aa  45.1  0.002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2063  ATPase  23.68 
 
 
464 aa  45.1  0.002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2218  ATPase  24.84 
 
 
463 aa  44.7  0.003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.747327 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>