26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_1319 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009073  Pcal_1319  ATPase  100 
 
 
312 aa  605  9.999999999999999e-173  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0433  ATPase  55.77 
 
 
359 aa  327  1.0000000000000001e-88  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.520428  hitchhiker  0.00910824 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0150  ATPase  55.45 
 
 
360 aa  316  4e-85  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2379  ATPase  39.38 
 
 
356 aa  231  1e-59  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0384  ATPase  44.06 
 
 
361 aa  211  1e-53  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  unclonable  0.000000176931  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1584  ATPase  41.88 
 
 
356 aa  178  1e-43  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1486  ATPase  35.71 
 
 
350 aa  173  2.9999999999999996e-42  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.659076  normal  0.220459 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0503  ATPase  40 
 
 
377 aa  169  4e-41  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.241974 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1933  ATPase  35.22 
 
 
356 aa  160  2e-38  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0359991  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1267  ATPase  41.4 
 
 
342 aa  160  2e-38  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1739  ATPase  33.84 
 
 
383 aa  157  3e-37  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1794  ATPase  33.53 
 
 
365 aa  155  1e-36  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0171546  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2746  ATPase  28.92 
 
 
387 aa  134  1.9999999999999998e-30  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0705142  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2867  ATPase  28.01 
 
 
386 aa  86.7  4e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1172  ATPase  30.07 
 
 
374 aa  82.8  0.000000000000007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.0968898 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0177  ATPase  27.27 
 
 
368 aa  70.1  0.00000000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.335522 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0542  ATPase  25.24 
 
 
377 aa  67.8  0.0000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2817  ATPase  22.59 
 
 
360 aa  55.5  0.000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0133  DUF234 DEXX-box ATPase  26.86 
 
 
462 aa  47  0.0004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0812652  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0840  ribosome assembly protein 4 (RSA4)  21.26 
 
 
1868 aa  46.6  0.0005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0533  ATPase  30 
 
 
439 aa  45.4  0.001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.543241  normal  0.111274 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1512  putative AAA+ superfamily ATPase  26.94 
 
 
470 aa  44.3  0.003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.406409  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1093  ATPase  23.88 
 
 
457 aa  43.5  0.004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1746  hypothetical protein  21.22 
 
 
373 aa  43.5  0.004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000207576  normal  0.634791 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1821  ATPase  23.75 
 
 
450 aa  42.7  0.007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5401  transcriptional regulator, winged helix family  37.35 
 
 
906 aa  42.7  0.008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>