65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_1512 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010816  BLD_1512  putative AAA+ superfamily ATPase  100 
 
 
470 aa  969    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.406409  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2649  ATPase  39.13 
 
 
461 aa  338  9.999999999999999e-92  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2821  ATPase  40.34 
 
 
474 aa  327  2.0000000000000001e-88  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.000929757  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4501  ATPase  34.44 
 
 
462 aa  294  2e-78  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2436  ATPase  36.8 
 
 
460 aa  283  5.000000000000001e-75  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2275  ATPase  35.55 
 
 
496 aa  281  2e-74  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2684  ATPase  31.89 
 
 
463 aa  274  2.0000000000000002e-72  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1429  putative AAA+ superfamily ATPase  35.33 
 
 
473 aa  271  2e-71  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.541066  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4044  ATPase  35.79 
 
 
463 aa  270  2.9999999999999997e-71  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4809  ATPase  33.89 
 
 
460 aa  267  2e-70  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1537  ATPase  36.41 
 
 
464 aa  262  8.999999999999999e-69  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.479678  normal  0.0536722 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2063  ATPase  36.3 
 
 
464 aa  260  4e-68  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2804  ATPase  34.38 
 
 
463 aa  259  6e-68  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2362  ATPase  32.68 
 
 
464 aa  259  9e-68  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2641  ATPase  36.34 
 
 
458 aa  247  3e-64  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.337326  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1193  ATPase  35.06 
 
 
457 aa  241  1e-62  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.460644  normal  0.228765 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0175  ATPase  34.41 
 
 
469 aa  241  2.9999999999999997e-62  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.231845 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4199  ATPase  32.29 
 
 
471 aa  238  2e-61  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.593601  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10540  predicted ATPase (AAA+ superfamily)  30.79 
 
 
509 aa  234  2.0000000000000002e-60  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.0000147633  hitchhiker  0.0000000237286 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2218  ATPase  31.71 
 
 
463 aa  228  2e-58  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.747327 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1093  ATPase  30.6 
 
 
457 aa  224  3e-57  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1821  ATPase  31.32 
 
 
450 aa  221  1.9999999999999999e-56  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0874  ATPase  32.85 
 
 
456 aa  218  2e-55  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0559719  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1083  ATPase  29.58 
 
 
469 aa  218  2.9999999999999998e-55  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0736  ATPase  37.69 
 
 
443 aa  212  1e-53  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.299447  normal  0.251724 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0485  ATPase  29.84 
 
 
454 aa  207  3e-52  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1051  ATPase  31.97 
 
 
431 aa  192  9e-48  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.709814  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0533  ATPase  29.98 
 
 
439 aa  187  3e-46  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.543241  normal  0.111274 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1446  ATPase  31.81 
 
 
439 aa  185  2.0000000000000003e-45  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.239907 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2719  ATPase  29.12 
 
 
420 aa  173  5e-42  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0484066  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2620  ATPase  31.7 
 
 
487 aa  173  5.999999999999999e-42  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.186456 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0133  DUF234 DEXX-box ATPase  28.17 
 
 
462 aa  164  4.0000000000000004e-39  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0812652  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2667  DUF234 DEXX-box ATPase  28.26 
 
 
478 aa  158  2e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.578936 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1767  ATPase  28.17 
 
 
456 aa  152  1e-35  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.53247  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1683  ATPase  28.14 
 
 
456 aa  152  1e-35  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0421559  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0415  ATPase  27.46 
 
 
476 aa  148  2.0000000000000003e-34  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.336627  normal  0.189156 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1281  hypothetical protein  28.22 
 
 
475 aa  135  1.9999999999999998e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1345  ATPase  25.43 
 
 
456 aa  133  9e-30  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1424  ATPase  27.35 
 
 
472 aa  129  9.000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.846928  normal  0.285417 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2879  ATPase  26.85 
 
 
470 aa  125  2e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0310  ATPase  27.47 
 
 
472 aa  124  4e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.568965  hitchhiker  0.000284685 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3408  ATPase  29.67 
 
 
498 aa  118  1.9999999999999998e-25  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8891  hypothetical protein  28.08 
 
 
501 aa  116  6.9999999999999995e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2329  hypothetical protein  26.03 
 
 
472 aa  116  1.0000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2557  ATPase  25.67 
 
 
485 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.928709  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1025  ATPase  28.85 
 
 
454 aa  111  3e-23  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.656086  normal  0.0180232 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02740  predicted ATPase (AAA+ superfamily)  27.02 
 
 
474 aa  110  8.000000000000001e-23  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1177  ATPase  26.43 
 
 
407 aa  96.7  8e-19  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.0919322 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4522  ATPase  23.43 
 
 
480 aa  84  0.000000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0081  ATPase  31.36 
 
 
307 aa  81.6  0.00000000000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.00107547  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1237  ATPase  27.72 
 
 
261 aa  77.4  0.0000000000005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0500  ATPase  26.92 
 
 
279 aa  73.6  0.000000000008  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2114  DUF234 DEXX-box ATPase  23.48 
 
 
304 aa  70.5  0.00000000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0397  ATPase  27.01 
 
 
277 aa  68.9  0.0000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0594  conserved hypothetical protein (DUF234 domain protein)  23.5 
 
 
283 aa  66.6  0.0000000009  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.000231419  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0813  hypothetical protein  26.26 
 
 
292 aa  66.6  0.0000000009  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.287694  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1219  hypothetical protein  23.37 
 
 
273 aa  65.1  0.000000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1841  DUF234 DEXX-box ATPase  23.22 
 
 
313 aa  64.7  0.000000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0883  hypothetical protein  25.7 
 
 
292 aa  64.7  0.000000004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0136  hypothetical protein  20.61 
 
 
304 aa  56.6  0.000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1486  ATPase  22.39 
 
 
350 aa  51.2  0.00004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.659076  normal  0.220459 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1933  ATPase  25.97 
 
 
356 aa  48.9  0.0002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0359991  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0498  hypothetical protein  33.85 
 
 
105 aa  48.5  0.0003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1207  ATPase  24.69 
 
 
408 aa  46.6  0.0009  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5276  ATPase  46.51 
 
 
949 aa  43.5  0.009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.089004 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>