28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpen_1267 on replicon NC_008698
Organism: Thermofilum pendens Hrk 5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008698  Tpen_1267  ATPase  100 
 
 
342 aa  660    Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1584  ATPase  38.76 
 
 
356 aa  194  1e-48  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0503  ATPase  37.74 
 
 
377 aa  193  3e-48  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.241974 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0384  ATPase  38.94 
 
 
361 aa  191  2e-47  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  unclonable  0.000000176931  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1933  ATPase  36.91 
 
 
356 aa  190  4e-47  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0359991  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1739  ATPase  37.57 
 
 
383 aa  186  4e-46  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1794  ATPase  37.57 
 
 
365 aa  184  2.0000000000000003e-45  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0171546  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0433  ATPase  39.12 
 
 
359 aa  178  1e-43  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.520428  hitchhiker  0.00910824 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1486  ATPase  35.39 
 
 
350 aa  166  6.9999999999999995e-40  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.659076  normal  0.220459 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2379  ATPase  31.59 
 
 
356 aa  162  8.000000000000001e-39  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0150  ATPase  35.38 
 
 
360 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1319  ATPase  39.75 
 
 
312 aa  135  9.999999999999999e-31  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2746  ATPase  30.66 
 
 
387 aa  131  2.0000000000000002e-29  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0705142  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2867  ATPase  26.14 
 
 
386 aa  80.5  0.00000000000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1172  ATPase  27.15 
 
 
374 aa  72.4  0.00000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.0968898 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0542  ATPase  28.09 
 
 
377 aa  71.6  0.00000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0177  ATPase  27.63 
 
 
368 aa  68.6  0.0000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.335522 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2817  ATPase  23.71 
 
 
360 aa  55.1  0.000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2684  ATPase  25.74 
 
 
463 aa  52  0.00001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2218  ATPase  30.81 
 
 
463 aa  49.3  0.00009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.747327 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4501  ATPase  25.11 
 
 
462 aa  48.9  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1767  ATPase  24.66 
 
 
456 aa  48.1  0.0002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.53247  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2362  ATPase  32.62 
 
 
464 aa  47.8  0.0003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1821  ATPase  29.28 
 
 
450 aa  46.2  0.0009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0533  ATPase  24.84 
 
 
439 aa  44.7  0.002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.543241  normal  0.111274 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2804  ATPase  23.65 
 
 
463 aa  44.7  0.002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1051  ATPase  28.48 
 
 
431 aa  43.9  0.004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.709814  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0736  ATPase  29.39 
 
 
443 aa  43.5  0.006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.299447  normal  0.251724 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>