23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_0542 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001800  Ssol_0542  ATPase  100 
 
 		 377 aa  759    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1172  ATPase  61.46 
 
 		 374 aa  481  1e-135  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0968898 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2867  ATPase  40.78 
 
 		 386 aa  277  2e-73  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0177  ATPase  35.51 
 
 		 368 aa  194  3e-48  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.335522 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2817  ATPase  32.2 
 
 		 360 aa  144  2e-33  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1746  hypothetical protein  27.89 
 
 		 373 aa  103  4e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000207576  normal  0.634791 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1584  ATPase  28.68 
 
 		 356 aa  88.2  2e-16  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0503  ATPase  25.27 
 
 		 377 aa  87  5e-16  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.241974 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1933  ATPase  26.11 
 
 		 356 aa  81.3  0.00000000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0359991  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0840  ribosome assembly protein 4 (RSA4)  23.88 
 
 		 1868 aa  77.4  0.0000000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1486  ATPase  28.81 
 
 		 350 aa  76.3  0.0000000000009  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.659076  normal  0.220459 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1267  ATPase  28.09 
 
 		 342 aa  71.6  0.00000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2379  ATPase  23.18 
 
 		 356 aa  70.1  0.00000000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0150  ATPase  26.35 
 
 		 360 aa  70.1  0.00000000007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0433  ATPase  26.12 
 
 		 359 aa  69.7  0.00000000009  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.520428  hitchhiker  0.00910824 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2746  ATPase  26.04 
 
 		 387 aa  65.5  0.000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0705142  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1739  ATPase  26.12 
 
 		 383 aa  65.5  0.000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1794  ATPase  26.12 
 
 		 365 aa  63.9  0.000000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0171546  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1319  ATPase  29.46 
 
 		 312 aa  63.5  0.000000006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0384  ATPase  23.59 
 
 		 361 aa  61.6  0.00000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  unclonable  0.000000176931  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG2078  hypothetical protein  24.5 
 
 		 390 aa  53.1  0.000007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0128  ATPase family protein  24.09 
 
 		 463 aa  48.5  0.0002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000122266 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2362  ATPase  31.46 
 
 		 464 aa  48.5  0.0002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>