28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pars_0503 on replicon NC_009376
Organism: Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009376  Pars_0503  ATPase  100 
 
 
377 aa  736    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.241974 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1584  ATPase  41.37 
 
 
356 aa  228  1e-58  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1486  ATPase  36.59 
 
 
350 aa  219  7e-56  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.659076  normal  0.220459 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1933  ATPase  37.03 
 
 
356 aa  216  5.9999999999999996e-55  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0359991  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0384  ATPase  40.11 
 
 
361 aa  207  3e-52  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  unclonable  0.000000176931  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0433  ATPase  40.11 
 
 
359 aa  204  2e-51  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.520428  hitchhiker  0.00910824 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0150  ATPase  40.21 
 
 
360 aa  202  9e-51  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1794  ATPase  36.6 
 
 
365 aa  198  2.0000000000000003e-49  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0171546  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1739  ATPase  36.07 
 
 
383 aa  194  2e-48  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1267  ATPase  37.74 
 
 
342 aa  193  4e-48  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2379  ATPase  32.88 
 
 
356 aa  189  9e-47  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2746  ATPase  28.37 
 
 
387 aa  148  2.0000000000000003e-34  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0705142  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1319  ATPase  38.15 
 
 
312 aa  142  9.999999999999999e-33  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0542  ATPase  25.27 
 
 
377 aa  87  5e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2867  ATPase  25.39 
 
 
386 aa  80.1  0.00000000000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1172  ATPase  24.66 
 
 
374 aa  79.7  0.00000000000007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.0968898 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0177  ATPase  25.81 
 
 
368 aa  67  0.0000000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.335522 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0840  ribosome assembly protein 4 (RSA4)  24.47 
 
 
1868 aa  54.7  0.000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4501  ATPase  23.78 
 
 
462 aa  52  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2821  ATPase  25.41 
 
 
474 aa  51.6  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.000929757  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2817  ATPase  22.89 
 
 
360 aa  51.2  0.00003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2684  ATPase  22.9 
 
 
463 aa  50.1  0.00006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2063  ATPase  26.37 
 
 
464 aa  48.5  0.0002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0485  ATPase  25.12 
 
 
454 aa  48.1  0.0003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2804  ATPase  22.46 
 
 
463 aa  44.7  0.002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2641  ATPase  25.07 
 
 
458 aa  43.9  0.004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.337326  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2218  ATPase  25 
 
 
463 aa  43.5  0.007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.747327 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1025  ATPase  25.91 
 
 
454 aa  43.1  0.007  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.656086  normal  0.0180232 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>