51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_0415 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007796  Mhun_0415  ATPase  100 
 
 
476 aa  977    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.336627  normal  0.189156 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2667  DUF234 DEXX-box ATPase  36 
 
 
478 aa  235  1.0000000000000001e-60  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.578936 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0133  DUF234 DEXX-box ATPase  33.69 
 
 
462 aa  226  5.0000000000000005e-58  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0812652  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1025  ATPase  33.95 
 
 
454 aa  223  4.9999999999999996e-57  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.656086  normal  0.0180232 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1177  ATPase  33 
 
 
407 aa  201  3e-50  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.0919322 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1767  ATPase  30.91 
 
 
456 aa  175  1.9999999999999998e-42  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.53247  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1683  ATPase  31.86 
 
 
456 aa  171  3e-41  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0421559  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2684  ATPase  31.28 
 
 
463 aa  149  1.0000000000000001e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1512  putative AAA+ superfamily ATPase  27.46 
 
 
470 aa  148  2.0000000000000003e-34  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.406409  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0485  ATPase  28.44 
 
 
454 aa  141  1.9999999999999998e-32  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1345  ATPase  28.34 
 
 
456 aa  141  3e-32  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1429  putative AAA+ superfamily ATPase  28.89 
 
 
473 aa  139  8.999999999999999e-32  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.541066  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4199  ATPase  28.77 
 
 
471 aa  139  1e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.593601  n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4809  ATPase  28.11 
 
 
460 aa  138  2e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0175  ATPase  26.35 
 
 
469 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.231845 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1821  ATPase  29.7 
 
 
450 aa  136  7.000000000000001e-31  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2275  ATPase  28 
 
 
496 aa  136  8e-31  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0736  ATPase  29.44 
 
 
443 aa  132  9e-30  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.299447  normal  0.251724 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2649  ATPase  30.02 
 
 
461 aa  128  2.0000000000000002e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2804  ATPase  28.36 
 
 
463 aa  129  2.0000000000000002e-28  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4501  ATPase  27.74 
 
 
462 aa  128  2.0000000000000002e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2821  ATPase  28.16 
 
 
474 aa  126  7e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.000929757  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0874  ATPase  27.8 
 
 
456 aa  126  1e-27  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0559719  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2218  ATPase  27.91 
 
 
463 aa  125  2e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.747327 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1537  ATPase  27.19 
 
 
464 aa  123  6e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.479678  normal  0.0536722 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2436  ATPase  26.01 
 
 
460 aa  115  1.0000000000000001e-24  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1083  ATPase  26.73 
 
 
469 aa  115  2.0000000000000002e-24  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2063  ATPase  26.63 
 
 
464 aa  112  1.0000000000000001e-23  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1051  ATPase  27.89 
 
 
431 aa  109  1e-22  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.709814  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2641  ATPase  27.93 
 
 
458 aa  106  8e-22  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.337326  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2362  ATPase  27.6 
 
 
464 aa  100  4e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2620  ATPase  26.29 
 
 
487 aa  99.4  1e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.186456 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4044  ATPase  28 
 
 
463 aa  99  2e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1193  ATPase  24.49 
 
 
457 aa  97.1  7e-19  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.460644  normal  0.228765 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2719  ATPase  29.32 
 
 
420 aa  96.7  9e-19  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0484066  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1446  ATPase  28.76 
 
 
439 aa  95.9  1e-18  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.239907 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0533  ATPase  26.17 
 
 
439 aa  95.5  2e-18  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.543241  normal  0.111274 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2329  hypothetical protein  24.27 
 
 
472 aa  94.7  3e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1093  ATPase  26.68 
 
 
457 aa  87.8  3e-16  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1424  ATPase  25.54 
 
 
472 aa  84.3  0.000000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.846928  normal  0.285417 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4522  ATPase  24.3 
 
 
480 aa  84  0.000000000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2879  ATPase  23.57 
 
 
470 aa  82.8  0.00000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0310  ATPase  25.12 
 
 
472 aa  79.7  0.0000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.568965  hitchhiker  0.000284685 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2557  ATPase  27.25 
 
 
485 aa  73.9  0.000000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.928709  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1281  hypothetical protein  21.98 
 
 
475 aa  62.4  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3408  ATPase  23.7 
 
 
498 aa  61.6  0.00000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10540  predicted ATPase (AAA+ superfamily)  19.89 
 
 
509 aa  56.2  0.000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.0000147633  hitchhiker  0.0000000237286 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02740  predicted ATPase (AAA+ superfamily)  22.85 
 
 
474 aa  53.1  0.00001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2867  ATPase  25.11 
 
 
386 aa  48.5  0.0002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1584  ATPase  26.14 
 
 
356 aa  47.8  0.0005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0081  ATPase  27.18 
 
 
307 aa  44.7  0.003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.00107547  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>