60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_5742 on replicon NC_011738
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011738  PCC7424_5742  hypothetical protein  100 
 
 		 470 aa  973    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3060  hypothetical protein  62.08 
 
 		 405 aa  432  1e-120  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.232176 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2208  serine/threonine protein kinase  51.84 
 
 		 877 aa  348  1e-94  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.177654 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4878  hypothetical protein  41.39 
 
 		 457 aa  345  1e-93  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4264  Toll-interleukin receptor  47.53 
 
 		 627 aa  323  5e-87  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3861  hypothetical protein  38.84 
 
 		 450 aa  310  4e-83  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.124994 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2972  hypothetical protein  45.73 
 
 		 537 aa  299  7e-80  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3808  hypothetical protein  46.67 
 
 		 456 aa  298  9e-80  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2158  hypothetical protein  43.8 
 
 		 456 aa  298  1e-79  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.621981 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2114  hypothetical protein  43.8 
 
 		 456 aa  298  1e-79  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1328  diguanylate cyclase  39.19 
 
 		 648 aa  291  1e-77  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1420  hypothetical protein  46.3 
 
 		 456 aa  288  1e-76  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1449  hypothetical protein  46.3 
 
 		 456 aa  288  2e-76  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3032  diguanylate cyclase  46.01 
 
 		 547 aa  287  2e-76  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5745  hypothetical protein  44.82 
 
 		 384 aa  287  2.9999999999999996e-76  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3967  hypothetical protein  45.54 
 
 		 446 aa  284  2.0000000000000002e-75  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.286064 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1625  hypothetical protein  43.79 
 
 		 466 aa  282  1e-74  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.236851 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1512  TIR protein  44.89 
 
 		 638 aa  277  4e-73  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00867702 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4253  serine/threonine protein kinase  41.29 
 
 		 662 aa  272  7e-72  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.340258  normal  0.0204039 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3077  toll-interleukin receptor  41.95 
 
 		 623 aa  271  2e-71  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.783629 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4407  hypothetical protein  40.41 
 
 		 475 aa  266  4e-70  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.684073 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4814  hypothetical protein  42.52 
 
 		 534 aa  246  6.999999999999999e-64  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.592191  normal  0.650141 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1168  TIR protein  38.18 
 
 		 520 aa  245  9.999999999999999e-64  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0227  hypothetical protein  39.88 
 
 		 438 aa  235  1.0000000000000001e-60  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0813  hypothetical protein  34.93 
 
 		 491 aa  213  7e-54  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1814  hypothetical protein  27.66 
 
 		 511 aa  133  6e-30  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.191783  hitchhiker  0.000537026 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1808  TIR protein  27.91 
 
 		 500 aa  121  3e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000211372 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1234  WD-40 repeat protein  39.33 
 
 		 1188 aa  80.9  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.593825 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0027  WD-40 repeat protein  41.76 
 
 		 1213 aa  77.8  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2507  putative Chase2 sensor protein  25.2 
 
 		 902 aa  73.9  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.476468  normal  0.563168 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3607  putative Chase2 sensor protein  25.2 
 
 		 902 aa  74.3  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1446  hypothetical protein  44 
 
 		 117 aa  72  0.00000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.712743  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2971  WD-40 repeat-containing protein  23.3 
 
 		 1367 aa  71.6  0.00000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2588  WD-40 repeat protein  29.38 
 
 		 1188 aa  69.7  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.994241 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4983  WD-40 repeat-containing protein  23.62 
 
 		 891 aa  69.3  0.0000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.709938 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5741  serine/threonine protein kinase  23.08 
 
 		 1914 aa  68.6  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4252  WD-40 repeat protein  26.49 
 
 		 1209 aa  67.8  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.23422  hitchhiker  0.00156947 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3863  serine/threonine protein kinase  23.45 
 
 		 1932 aa  67.8  0.0000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.16281 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4475  WD-40 repeat protein  27.08 
 
 		 1161 aa  67  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.416267 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4412  WD-40 repeat protein  27.08 
 
 		 1161 aa  66.6  0.0000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1807  WD-40 repeat-containing protein  23.99 
 
 		 1214 aa  66.2  0.000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000135295 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1624  WD-40 repeat-containing protein  22.27 
 
 		 1176 aa  66.2  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.228401 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4408  WD-40 repeat protein  24.55 
 
 		 1177 aa  65.5  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.760311 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3968  serine/threonine protein kinase  23.53 
 
 		 1908 aa  63.5  0.000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.221286 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0703  WD-40 repeat protein  23.94 
 
 		 1190 aa  62.8  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4813  WD-40 repeat-containing protein  25.81 
 
 		 1477 aa  62  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.974814 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3594  WD-40 repeat protein  26.45 
 
 		 1164 aa  60.5  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0139951 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0010  hypothetical protein  30.39 
 
 		 513 aa  59.7  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1440  WD repeat-containing protein  26.5 
 
 		 464 aa  59.3  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4055  ATPase  23.19 
 
 		 460 aa  58.2  0.0000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.583039  normal  0.0382097 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2738  putative PAS/PAC sensor protein  23.53 
 
 		 2077 aa  57.4  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3059  putative Chase2 sensor protein  21.98 
 
 		 781 aa  57  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.321518 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2292  ATPase  29.76 
 
 		 471 aa  55.1  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.786667 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0590  hypothetical protein  26.48 
 
 		 462 aa  54.3  0.000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.401741  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1167  WD-40 repeat protein  23.85 
 
 		 1163 aa  53.9  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0228  putative Chase2 sensor protein  24.24 
 
 		 787 aa  52  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.433927 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5743  TPR repeat-containing protein  21.89 
 
 		 335 aa  52  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4789  WD-40 repeat protein  35.71 
 
 		 1193 aa  49.3  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00121677  normal  0.726129 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3413  TPR repeat-containing protein  23.26 
 
 		 783 aa  47.4  0.0006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.335652  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2114  WD repeat-containing protein  25 
 
 		 477 aa  43.5  0.009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.485038  normal  0.942485 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>