57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_3861 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008312  Tery_3861  hypothetical protein  100 
 
 
450 aa  921    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.124994 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4878  hypothetical protein  52.48 
 
 
457 aa  460  9.999999999999999e-129  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5745  hypothetical protein  53.67 
 
 
384 aa  391  1e-107  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3032  diguanylate cyclase  50.3 
 
 
547 aa  355  6.999999999999999e-97  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1328  diguanylate cyclase  40.79 
 
 
648 aa  326  4.0000000000000003e-88  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1625  hypothetical protein  43.07 
 
 
466 aa  315  9.999999999999999e-85  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.236851 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2208  serine/threonine protein kinase  45.95 
 
 
877 aa  313  3.9999999999999997e-84  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.177654 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1512  TIR protein  45.95 
 
 
638 aa  313  4.999999999999999e-84  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00867702 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5742  hypothetical protein  38.84 
 
 
470 aa  310  4e-83  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4264  Toll-interleukin receptor  43.88 
 
 
627 aa  309  5e-83  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3808  hypothetical protein  46.65 
 
 
456 aa  307  2.0000000000000002e-82  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4407  hypothetical protein  41.28 
 
 
475 aa  308  2.0000000000000002e-82  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.684073 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4253  serine/threonine protein kinase  43.75 
 
 
662 aa  307  3e-82  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.340258  normal  0.0204039 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2114  hypothetical protein  44.29 
 
 
456 aa  298  1e-79  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2158  hypothetical protein  44.29 
 
 
456 aa  298  1e-79  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.621981 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3077  toll-interleukin receptor  46.91 
 
 
623 aa  291  2e-77  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.783629 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1449  hypothetical protein  44.44 
 
 
456 aa  289  9e-77  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1420  hypothetical protein  44.44 
 
 
456 aa  288  9e-77  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3967  hypothetical protein  41.79 
 
 
446 aa  288  1e-76  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.286064 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2972  hypothetical protein  41.52 
 
 
537 aa  287  2.9999999999999996e-76  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3060  hypothetical protein  41.61 
 
 
405 aa  259  9e-68  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.232176 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1168  TIR protein  40.18 
 
 
520 aa  252  8.000000000000001e-66  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4814  hypothetical protein  37.62 
 
 
534 aa  243  3.9999999999999997e-63  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.592191  normal  0.650141 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0813  hypothetical protein  34.33 
 
 
491 aa  226  5.0000000000000005e-58  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0227  hypothetical protein  34.72 
 
 
438 aa  190  5e-47  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1814  hypothetical protein  30.53 
 
 
511 aa  138  2e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.191783  hitchhiker  0.000537026 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1808  TIR protein  25.62 
 
 
500 aa  112  2.0000000000000002e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000211372 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3863  serine/threonine protein kinase  25.57 
 
 
1932 aa  78.2  0.0000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.16281 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1446  hypothetical protein  42.72 
 
 
117 aa  77  0.0000000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.712743  normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5741  serine/threonine protein kinase  27.15 
 
 
1914 aa  71.6  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3968  serine/threonine protein kinase  26.34 
 
 
1908 aa  68.6  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.221286 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3607  putative Chase2 sensor protein  25.71 
 
 
902 aa  64.3  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2507  putative Chase2 sensor protein  25.71 
 
 
902 aa  63.9  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.476468  normal  0.563168 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4475  WD-40 repeat protein  26.02 
 
 
1161 aa  63.5  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.416267 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4412  WD-40 repeat protein  26.02 
 
 
1161 aa  63.5  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0027  WD-40 repeat protein  28.95 
 
 
1213 aa  62.4  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4252  WD-40 repeat protein  26.07 
 
 
1209 aa  62.8  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.23422  hitchhiker  0.00156947 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3059  putative Chase2 sensor protein  22.98 
 
 
781 aa  57.8  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.321518 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0937  WD repeat-containing protein  28.83 
 
 
566 aa  57.8  0.0000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1167  WD-40 repeat protein  24.49 
 
 
1163 aa  57  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5743  TPR repeat-containing protein  25.19 
 
 
335 aa  55.1  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1234  WD-40 repeat protein  35.23 
 
 
1188 aa  54.3  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.593825 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4983  WD-40 repeat-containing protein  24.07 
 
 
891 aa  53.9  0.000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.709938 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4789  WD-40 repeat protein  26.23 
 
 
1193 aa  50.8  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00121677  normal  0.726129 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1447  hypothetical protein  35.78 
 
 
129 aa  50.8  0.00005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.388571  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2588  WD-40 repeat protein  27.71 
 
 
1188 aa  50.4  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.994241 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1624  WD-40 repeat-containing protein  23.98 
 
 
1176 aa  50.1  0.00009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.228401 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2971  WD-40 repeat-containing protein  20.88 
 
 
1367 aa  49.3  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0703  WD-40 repeat protein  24.43 
 
 
1190 aa  49.3  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0010  hypothetical protein  42.19 
 
 
513 aa  48.5  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2738  putative PAS/PAC sensor protein  23.77 
 
 
2077 aa  48.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0735  diguanylate cyclase  39.44 
 
 
303 aa  45.8  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0940176 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3594  WD-40 repeat protein  25.81 
 
 
1164 aa  45.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0139951 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4813  WD-40 repeat-containing protein  22.13 
 
 
1477 aa  44.7  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.974814 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3478  WD-40 repeat protein  28.12 
 
 
1208 aa  44.7  0.004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.590785 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3462  TPR repeat-containing protein  23.53 
 
 
791 aa  43.5  0.007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1807  WD-40 repeat-containing protein  20.87 
 
 
1214 aa  43.5  0.007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000135295 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>