49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_5743 on replicon NC_011738
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011738  PCC7424_5743  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 335 aa  688    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3059  putative Chase2 sensor protein  64.53 
 
 		 781 aa  432  1e-120  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.321518 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5741  serine/threonine protein kinase  55.52 
 
 		 1914 aa  377  1e-103  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3968  serine/threonine protein kinase  55.18 
 
 		 1908 aa  372  1e-102  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.221286 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2507  putative Chase2 sensor protein  54.85 
 
 		 902 aa  363  2e-99  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.476468  normal  0.563168 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3607  putative Chase2 sensor protein  54.85 
 
 		 902 aa  363  2e-99  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2971  WD-40 repeat-containing protein  53.61 
 
 		 1367 aa  358  5e-98  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3863  serine/threonine protein kinase  53.47 
 
 		 1932 aa  358  9e-98  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.16281 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1167  WD-40 repeat protein  51.07 
 
 		 1163 aa  353  2.9999999999999997e-96  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0703  WD-40 repeat protein  52.69 
 
 		 1190 aa  350  2e-95  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2738  putative PAS/PAC sensor protein  53.19 
 
 		 2077 aa  348  9e-95  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3594  WD-40 repeat protein  52.42 
 
 		 1164 aa  343  2.9999999999999997e-93  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0139951 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4983  WD-40 repeat-containing protein  51.93 
 
 		 891 aa  342  5.999999999999999e-93  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.709938 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1624  WD-40 repeat-containing protein  52.63 
 
 		 1176 aa  340  2.9999999999999998e-92  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.228401 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4475  WD-40 repeat protein  52.4 
 
 		 1161 aa  337  9.999999999999999e-92  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.416267 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4412  WD-40 repeat protein  52.4 
 
 		 1161 aa  337  9.999999999999999e-92  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4408  WD-40 repeat protein  51.35 
 
 		 1177 aa  335  5.999999999999999e-91  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.760311 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4813  WD-40 repeat-containing protein  51.81 
 
 		 1477 aa  319  3.9999999999999996e-86  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.974814 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4252  WD-40 repeat protein  48.92 
 
 		 1209 aa  318  7.999999999999999e-86  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.23422  hitchhiker  0.00156947 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0228  putative Chase2 sensor protein  41.25 
 
 		 787 aa  235  7e-61  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.433927 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1807  WD-40 repeat-containing protein  44.26 
 
 		 1214 aa  211  1e-53  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000135295 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3213  WD-40 repeat-containing protein  35.6 
 
 		 1304 aa  205  8e-52  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.297689  normal  0.929062 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1813  WD repeat-containing protein  36.92 
 
 		 376 aa  162  1e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0550116  hitchhiker  0.000537026 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1847  hypothetical protein  29.86 
 
 		 870 aa  97.1  3e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.277811  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4022  hypothetical protein  29.11 
 
 		 854 aa  92  1e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.864107  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1353  TPR repeat-containing protein  29.34 
 
 		 864 aa  78.2  0.0000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5745  hypothetical protein  22.63 
 
 		 384 aa  63.5  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3032  diguanylate cyclase  22.89 
 
 		 547 aa  60.8  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4253  serine/threonine protein kinase  23.67 
 
 		 662 aa  60.8  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.340258  normal  0.0204039 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1808  TIR protein  24.08 
 
 		 500 aa  59.3  0.00000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000211372 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4878  hypothetical protein  22.9 
 
 		 457 aa  59.3  0.00000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1168  TIR protein  21.58 
 
 		 520 aa  55.8  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3077  toll-interleukin receptor  23.9 
 
 		 623 aa  54.7  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.783629 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3967  hypothetical protein  24.47 
 
 		 446 aa  54.7  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.286064 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3861  hypothetical protein  25.19 
 
 		 450 aa  55.1  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.124994 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4264  Toll-interleukin receptor  23.32 
 
 		 627 aa  55.1  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0227  hypothetical protein  24.22 
 
 		 438 aa  54.3  0.000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1328  diguanylate cyclase  20.85 
 
 		 648 aa  53.1  0.000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5742  hypothetical protein  21.89 
 
 		 470 aa  52  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1512  TIR protein  22.45 
 
 		 638 aa  52.4  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00867702 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1625  hypothetical protein  22.83 
 
 		 466 aa  52  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.236851 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2208  serine/threonine protein kinase  23.26 
 
 		 877 aa  51.6  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.177654 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2972  hypothetical protein  23.44 
 
 		 537 aa  48.9  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3060  hypothetical protein  22.37 
 
 		 405 aa  48.1  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.232176 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1420  hypothetical protein  24.1 
 
 		 456 aa  48.5  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4814  hypothetical protein  23.21 
 
 		 534 aa  48.1  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.592191  normal  0.650141 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1449  hypothetical protein  24.1 
 
 		 456 aa  48.1  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3808  hypothetical protein  22.81 
 
 		 456 aa  44.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4407  hypothetical protein  22.54 
 
 		 475 aa  43.5  0.006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.684073 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>