29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_1847 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_1847  hypothetical protein  100 
 
 		 870 aa  1751    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.277811  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4022  hypothetical protein  48 
 
 		 854 aa  323  9.999999999999999e-87  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.864107  normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5741  serine/threonine protein kinase  29.13 
 
 		 1914 aa  119  3e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2738  putative PAS/PAC sensor protein  28.17 
 
 		 2077 aa  115  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1807  WD-40 repeat-containing protein  30 
 
 		 1214 aa  113  2.0000000000000002e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000135295 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1167  WD-40 repeat protein  31.6 
 
 		 1163 aa  112  4.0000000000000004e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2971  WD-40 repeat-containing protein  28.53 
 
 		 1367 aa  102  2e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4983  WD-40 repeat-containing protein  31.32 
 
 		 891 aa  102  2e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.709938 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2507  putative Chase2 sensor protein  30.22 
 
 		 902 aa  102  3e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.476468  normal  0.563168 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3607  putative Chase2 sensor protein  30.22 
 
 		 902 aa  102  3e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3059  putative Chase2 sensor protein  26.35 
 
 		 781 aa  101  5e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.321518 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1624  WD-40 repeat-containing protein  31.48 
 
 		 1176 aa  99.8  2e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.228401 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3968  serine/threonine protein kinase  26.22 
 
 		 1908 aa  98.6  4e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.221286 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5743  TPR repeat-containing protein  29.86 
 
 		 335 aa  97.4  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4408  WD-40 repeat protein  28.88 
 
 		 1177 aa  96.7  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.760311 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1813  WD repeat-containing protein  29.83 
 
 		 376 aa  95.1  5e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0550116  hitchhiker  0.000537026 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4252  WD-40 repeat protein  28.13 
 
 		 1209 aa  94.4  9e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.23422  hitchhiker  0.00156947 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4475  WD-40 repeat protein  30.64 
 
 		 1161 aa  93.6  1e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.416267 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4412  WD-40 repeat protein  30.64 
 
 		 1161 aa  94  1e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0703  WD-40 repeat protein  28.93 
 
 		 1190 aa  91.3  6e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3594  WD-40 repeat protein  27.27 
 
 		 1164 aa  89.4  3e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0139951 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4813  WD-40 repeat-containing protein  26.88 
 
 		 1477 aa  88.2  6e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.974814 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3863  serine/threonine protein kinase  27.46 
 
 		 1932 aa  87.8  8e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.16281 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0228  putative Chase2 sensor protein  27.87 
 
 		 787 aa  83.2  0.00000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.433927 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3213  WD-40 repeat-containing protein  24.73 
 
 		 1304 aa  49.3  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.297689  normal  0.929062 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1168  TIR protein  23.46 
 
 		 520 aa  47.4  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1808  TIR protein  27.27 
 
 		 500 aa  47.4  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000211372 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0533  TPR repeat-containing protein  25.71 
 
 		 418 aa  44.7  0.007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00172679  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3967  hypothetical protein  23 
 
 		 446 aa  44.3  0.009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.286064 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>