More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_3863 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_0791  ATP-binding region ATPase domain protein  43.97 
 
 
2051 aa  1266    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.417988  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1160  hypothetical protein  34.89 
 
 
2303 aa  859    Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0117  serine/threonine protein kinase and signal transduction histidine kinase with GAF and PAS/PAC sensor  43.75 
 
 
2361 aa  1202    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0083  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  46.95 
 
 
1780 aa  1338    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.000111107  normal  0.0603915 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1980  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  41.74 
 
 
1901 aa  1195    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0349147  normal  0.535824 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2803  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  39.91 
 
 
1805 aa  1095    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.70885 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2845  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF and PAS/PAC sensor  42.44 
 
 
1934 aa  1231    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.218586  normal  0.818872 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3535  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  41.09 
 
 
1804 aa  1164    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.655347 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3596  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  39.86 
 
 
2017 aa  1090    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.107255 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3995  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  39.73 
 
 
1794 aa  1085    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4489  serine/threonine protein kinase and signal transduction histidine kinase with GAF sensor  43.07 
 
 
1850 aa  1232    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.613962  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4503  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  40.13 
 
 
1797 aa  1133    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.194827  normal  0.137244 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4504  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  41.83 
 
 
1795 aa  1157    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.575028 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4716  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  42.24 
 
 
1808 aa  1167    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.230197  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2978  multi-sensor signal transduction histidine kinase  42.94 
 
 
1942 aa  1184    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2398  ATP-binding region ATPase domain protein  30.39 
 
 
1712 aa  694    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.623096  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0183  protein kinase  29.44 
 
 
1697 aa  721    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1234  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  30.94 
 
 
1663 aa  798    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.745042  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3968  serine/threonine protein kinase  45.52 
 
 
1908 aa  1672    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.221286 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4616  PAS sensor protein  31.03 
 
 
1836 aa  763    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1683  PAS sensor protein  34.11 
 
 
1833 aa  944    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.725143 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3295  multi-sensor signal transduction multi-kinase  36.25 
 
 
1774 aa  946    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2738  putative PAS/PAC sensor protein  41.46 
 
 
2077 aa  1100    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4622  multi-sensor signal transduction multi-kinase  34.02 
 
 
1780 aa  938    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.701325  normal  0.952257 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1563  multi-sensor signal transduction multi-kinase  32.41 
 
 
1822 aa  821    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0557891 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1629  hypothetical protein  35.91 
 
 
2279 aa  901    Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00385433 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0999  hypothetical protein  36.07 
 
 
2272 aa  899    Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.715869 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2181  ATP-binding region ATPase domain protein  37.14 
 
 
1922 aa  1056    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.116239 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2984  PAS sensor protein  31.37 
 
 
2109 aa  774    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.591507  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5744  multi-sensor signal transduction multi-kinase  36.91 
 
 
1845 aa  982    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2277  multi-sensor signal transduction multi-kinase  29.61 
 
 
1797 aa  770    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.947046 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2107  serine/threonine protein kinase  50.3 
 
 
670 aa  692    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.568575 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2556  ATP-binding region, ATPase-like  40.01 
 
 
1811 aa  1072    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2857  adenylate/guanylate cyclase  94.76 
 
 
1805 aa  2915    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3863  serine/threonine protein kinase  100 
 
 
1932 aa  3936    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.16281 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0645  serine/threonine protein kinase  33.03 
 
 
1644 aa  835    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0171562  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0854  ATP-binding region ATPase domain protein  31.45 
 
 
1871 aa  748    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4528  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  31.54 
 
 
1668 aa  807    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6208  ATP-binding region ATPase domain protein  34.4 
 
 
1885 aa  870    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2428  PAS sensor protein  35.51 
 
 
1837 aa  950    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.787008  normal  0.842881 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0030  ATPase domain-containing protein  28.99 
 
 
1739 aa  665    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5741  serine/threonine protein kinase  47.95 
 
 
1914 aa  1769    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7756  PAS sensor protein  35.7 
 
 
1809 aa  952    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3410  PAS sensor protein  26.8 
 
 
1788 aa  561  1e-158  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6696  multi-sensor signal transduction multi-kinase  25.53 
 
 
1885 aa  550  1e-155  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6496  ATPase domain-containing protein  26.41 
 
 
1685 aa  548  1e-154  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.53789  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5743  ATPase domain-containing protein  26.36 
 
 
1685 aa  547  1e-154  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2108  GAF sensor signal transduction histidine kinase  38.14 
 
 
1123 aa  514  1e-144  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6170  multi-sensor signal transduction multi-kinase  26.33 
 
 
1748 aa  490  1e-137  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1945  multi-sensor signal transduction multi-kinase  24.89 
 
 
1832 aa  483  1e-134  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0187004 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4054  ATPase domain-containing protein  27.52 
 
 
1756 aa  480  1e-134  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.892687 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3011  serine/threonine protein kinase  24.75 
 
 
1637 aa  474  1e-132  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.15444  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5309  sensor histidine kinase  24.88 
 
 
1744 aa  470  9.999999999999999e-131  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0910571 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7079  serine/threonine protein kinase  25.87 
 
 
1643 aa  465  1e-129  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4360  serine/threonine protein kinase  24.85 
 
 
1636 aa  457  1e-127  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0230  ATPase domain-containing protein  26.08 
 
 
1685 aa  451  1e-125  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.59916  normal  0.455487 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4642  serine/threonine protein kinase  25.2 
 
 
1629 aa  446  1e-123  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5242  sensor histidine kinase/GAF domain-containing protein  25.16 
 
 
1682 aa  422  1e-116  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.59114  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5152  ATPase domain-containing protein  24.82 
 
 
1682 aa  421  1e-116  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.198047  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1544  ATP-binding region ATPase domain protein  25.12 
 
 
1710 aa  424  1e-116  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3855  serine/threonine protein kinase  24.01 
 
 
1726 aa  407  1e-111  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.993945  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4408  WD-40 repeat protein  51.46 
 
 
1177 aa  401  9.999999999999999e-111  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.760311 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2971  WD-40 repeat-containing protein  49.74 
 
 
1367 aa  395  1e-108  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1624  WD-40 repeat-containing protein  49.6 
 
 
1176 aa  393  1e-107  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.228401 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0703  WD-40 repeat protein  48.41 
 
 
1190 aa  392  1e-107  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4252  WD-40 repeat protein  47.44 
 
 
1209 aa  386  1e-105  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.23422  hitchhiker  0.00156947 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2507  putative Chase2 sensor protein  49.73 
 
 
902 aa  378  1e-103  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.476468  normal  0.563168 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_49028  predicted protein  26.94 
 
 
1064 aa  377  1e-103  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3607  putative Chase2 sensor protein  49.73 
 
 
902 aa  378  1e-103  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_48535  predicted protein  26.71 
 
 
1112 aa  377  1e-102  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.12643  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3594  WD-40 repeat protein  47.7 
 
 
1164 aa  368  1e-100  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0139951 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4412  WD-40 repeat protein  48.77 
 
 
1161 aa  365  4e-99  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4475  WD-40 repeat protein  48.77 
 
 
1161 aa  365  5.0000000000000005e-99  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.416267 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4983  WD-40 repeat-containing protein  48.53 
 
 
891 aa  362  3e-98  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.709938 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3059  putative Chase2 sensor protein  48.52 
 
 
781 aa  359  2.9999999999999997e-97  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.321518 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5743  TPR repeat-containing protein  53.47 
 
 
335 aa  358  6.999999999999999e-97  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45780  predicted protein  26.29 
 
 
1060 aa  353  2e-95  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1167  WD-40 repeat protein  46.07 
 
 
1163 aa  345  5e-93  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4813  WD-40 repeat-containing protein  46.51 
 
 
1477 aa  342  5.9999999999999996e-92  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.974814 
 
 
-
 
NC_011700  PHATRDRAFT_50614  predicted protein  26.54 
 
 
1123 aa  325  5e-87  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4550  serine/threonine protein kinase  25.17 
 
 
1649 aa  315  5.999999999999999e-84  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.773527  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2353  adenylate/guanylate cyclase  23.02 
 
 
1473 aa  306  2.0000000000000002e-81  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.525231 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2314  adenylate/guanylate cyclase  22.69 
 
 
1473 aa  302  5e-80  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2361  adenylate/guanylate cyclase  22.69 
 
 
1473 aa  302  5e-80  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0228  putative Chase2 sensor protein  38.07 
 
 
787 aa  272  4e-71  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.433927 
 
 
-
 
NC_011700  PHATRDRAFT_50602  predicted protein  24.02 
 
 
1255 aa  243  2.9999999999999997e-62  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.94407  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1807  WD-40 repeat-containing protein  34.22 
 
 
1214 aa  229  4e-58  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000135295 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_54547  protein kinase  23.61 
 
 
900 aa  209  4e-52  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3213  WD-40 repeat-containing protein  33.85 
 
 
1304 aa  208  7e-52  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.297689  normal  0.929062 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1813  WD repeat-containing protein  35.98 
 
 
376 aa  201  1.0000000000000001e-49  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0550116  hitchhiker  0.000537026 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1450  diguanylate cyclase  26.56 
 
 
1774 aa  200  2.0000000000000003e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03102  sensor histidine kinase/response regulator, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G12550)  20.78 
 
 
2312 aa  160  2e-37  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.461392  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3575  GAF sensor signal transduction histidine kinase  42.58 
 
 
494 aa  160  2e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.242306  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6308  serine/threonine protein kinase  23.44 
 
 
1235 aa  155  5.9999999999999996e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011700  PHATRDRAFT_50616  predicted protein  21.65 
 
 
1015 aa  152  7e-35  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00719688  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6020  multi-sensor signal transduction multi-kinase  22.58 
 
 
1666 aa  151  1.0000000000000001e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1311  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  31.7 
 
 
584 aa  145  9.999999999999999e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.760538  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3369  serine/threonine protein kinase  30.34 
 
 
455 aa  144  1.9999999999999998e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5519  serine/threonine protein kinase  25.61 
 
 
1188 aa  144  1.9999999999999998e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1052  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  30.45 
 
 
798 aa  142  3.9999999999999997e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.687735 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>