109 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_54547 on replicon NC_011677
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011677  PHATRDRAFT_54547  protein kinase  100 
 
 
900 aa  1858    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4503  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  25.31 
 
 
1797 aa  261  3e-68  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.194827  normal  0.137244 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2845  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF and PAS/PAC sensor  26.85 
 
 
1934 aa  252  2e-65  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.218586  normal  0.818872 
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_48535  predicted protein  25.79 
 
 
1112 aa  246  1.9999999999999999e-63  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.12643  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0791  ATP-binding region ATPase domain protein  26.07 
 
 
2051 aa  241  2.9999999999999997e-62  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.417988  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4489  serine/threonine protein kinase and signal transduction histidine kinase with GAF sensor  25.53 
 
 
1850 aa  233  1e-59  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.613962  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4716  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  23.66 
 
 
1808 aa  230  8e-59  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.230197  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3535  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  23.33 
 
 
1804 aa  225  2e-57  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.655347 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1980  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  24.14 
 
 
1901 aa  223  1.9999999999999999e-56  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0349147  normal  0.535824 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2738  putative PAS/PAC sensor protein  23.06 
 
 
2077 aa  222  1.9999999999999999e-56  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3596  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  24.83 
 
 
2017 aa  219  1e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.107255 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0117  serine/threonine protein kinase and signal transduction histidine kinase with GAF and PAS/PAC sensor  26.09 
 
 
2361 aa  215  2.9999999999999995e-54  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_49028  predicted protein  23.47 
 
 
1064 aa  211  4e-53  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2803  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  23.2 
 
 
1805 aa  211  6e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.70885 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3863  serine/threonine protein kinase  23.61 
 
 
1932 aa  211  7e-53  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.16281 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3968  serine/threonine protein kinase  22.26 
 
 
1908 aa  210  1e-52  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.221286 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2978  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.06 
 
 
1942 aa  208  4e-52  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2181  ATP-binding region ATPase domain protein  24.38 
 
 
1922 aa  208  4e-52  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.116239 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2556  ATP-binding region, ATPase-like  24.7 
 
 
1811 aa  201  3.9999999999999996e-50  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2857  adenylate/guanylate cyclase  23.59 
 
 
1805 aa  199  2.0000000000000003e-49  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011700  PHATRDRAFT_50614  predicted protein  24.45 
 
 
1123 aa  199  2.0000000000000003e-49  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3295  multi-sensor signal transduction multi-kinase  24.47 
 
 
1774 aa  198  4.0000000000000005e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0083  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  23.78 
 
 
1780 aa  190  9e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.000111107  normal  0.0603915 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4504  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  22.59 
 
 
1795 aa  189  3e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.575028 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4622  multi-sensor signal transduction multi-kinase  22.54 
 
 
1780 aa  187  7e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.701325  normal  0.952257 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0854  ATP-binding region ATPase domain protein  23.4 
 
 
1871 aa  186  1.0000000000000001e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45780  predicted protein  23.2 
 
 
1060 aa  186  2.0000000000000003e-45  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0183  protein kinase  23.17 
 
 
1697 aa  184  8.000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5741  serine/threonine protein kinase  23.19 
 
 
1914 aa  183  1e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1629  hypothetical protein  24.83 
 
 
2279 aa  182  2e-44  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00385433 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3995  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  22.89 
 
 
1794 aa  181  8e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1234  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  21.37 
 
 
1663 aa  180  1e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.745042  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4528  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  22.34 
 
 
1668 aa  179  2e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2984  PAS sensor protein  26.78 
 
 
2109 aa  174  6.999999999999999e-42  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.591507  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0999  hypothetical protein  23.32 
 
 
2272 aa  166  2.0000000000000002e-39  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.715869 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1683  PAS sensor protein  23.28 
 
 
1833 aa  164  9e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.725143 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7756  PAS sensor protein  21.44 
 
 
1809 aa  156  2e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0230  ATPase domain-containing protein  25 
 
 
1685 aa  154  5e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.59916  normal  0.455487 
 
 
-
 
NC_011700  PHATRDRAFT_50602  predicted protein  23.43 
 
 
1255 aa  152  3e-35  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.94407  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2398  ATP-binding region ATPase domain protein  22.69 
 
 
1712 aa  149  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.623096  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6208  ATP-binding region ATPase domain protein  23.19 
 
 
1885 aa  148  6e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1160  hypothetical protein  22.48 
 
 
2303 aa  147  1e-33  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1563  multi-sensor signal transduction multi-kinase  21.95 
 
 
1822 aa  147  1e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0557891 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0030  ATPase domain-containing protein  22.21 
 
 
1739 aa  144  5e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011700  PHATRDRAFT_50616  predicted protein  21.93 
 
 
1015 aa  144  8e-33  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00719688  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5744  multi-sensor signal transduction multi-kinase  23.99 
 
 
1845 aa  143  1.9999999999999998e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2428  PAS sensor protein  20.84 
 
 
1837 aa  140  8.999999999999999e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.787008  normal  0.842881 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0645  serine/threonine protein kinase  21.38 
 
 
1644 aa  129  2.0000000000000002e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0171562  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5152  ATPase domain-containing protein  23.11 
 
 
1682 aa  129  3e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.198047  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5242  sensor histidine kinase/GAF domain-containing protein  23.42 
 
 
1682 aa  127  1e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.59114  normal 
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_49156  predicted protein  20.33 
 
 
1086 aa  122  1.9999999999999998e-26  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.402458  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4616  PAS sensor protein  20.77 
 
 
1836 aa  122  3.9999999999999996e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2277  multi-sensor signal transduction multi-kinase  23.68 
 
 
1797 aa  119  3e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.947046 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1544  ATP-binding region ATPase domain protein  23.25 
 
 
1710 aa  117  6.9999999999999995e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2107  serine/threonine protein kinase  35.27 
 
 
670 aa  115  5e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.568575 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5309  sensor histidine kinase  22.7 
 
 
1744 aa  112  2.0000000000000002e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0910571 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2108  GAF sensor signal transduction histidine kinase  23.5 
 
 
1123 aa  113  2.0000000000000002e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6696  multi-sensor signal transduction multi-kinase  22.46 
 
 
1885 aa  110  2e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5743  ATPase domain-containing protein  19.85 
 
 
1685 aa  93.2  2e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2314  adenylate/guanylate cyclase  20.84 
 
 
1473 aa  91.3  7e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2361  adenylate/guanylate cyclase  20.84 
 
 
1473 aa  91.3  7e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2353  adenylate/guanylate cyclase  20.84 
 
 
1473 aa  91.3  7e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.525231 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6496  ATPase domain-containing protein  19.83 
 
 
1685 aa  90.5  1e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.53789  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1945  multi-sensor signal transduction multi-kinase  19.76 
 
 
1832 aa  84  0.00000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0187004 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4054  ATPase domain-containing protein  22.4 
 
 
1756 aa  82.8  0.00000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.892687 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3410  PAS sensor protein  25 
 
 
1788 aa  80.1  0.0000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6170  multi-sensor signal transduction multi-kinase  23.03 
 
 
1748 aa  73.9  0.00000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7079  serine/threonine protein kinase  26.53 
 
 
1643 aa  68.6  0.0000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4360  serine/threonine protein kinase  19.67 
 
 
1636 aa  66.6  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4550  serine/threonine protein kinase  28.65 
 
 
1649 aa  65.9  0.000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.773527  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6308  serine/threonine protein kinase  26.48 
 
 
1235 aa  65.5  0.000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6796  transcriptional regulator  25.33 
 
 
1118 aa  64.7  0.000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2931  ATPase-like protein  31.77 
 
 
1051 aa  64.7  0.000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.111498  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1593  serine/threonine protein kinase  26.26 
 
 
1377 aa  63.5  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4642  serine/threonine protein kinase  24.59 
 
 
1629 aa  62.8  0.00000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7631  ATPase-like protein  28.84 
 
 
1123 aa  61.6  0.00000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.289533  normal  0.197233 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03102  sensor histidine kinase/response regulator, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G12550)  19.85 
 
 
2312 aa  60.1  0.0000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.461392  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1960  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  25.2 
 
 
1080 aa  58.9  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3855  serine/threonine protein kinase  26.63 
 
 
1726 aa  58.2  0.0000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.993945  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2669  winged helix family transcriptional regulator ATPase  27.32 
 
 
1123 aa  57.8  0.0000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.940937  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6794  transcriptional regulator  27.14 
 
 
723 aa  57.4  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4935  tetratricopeptide TPR_4  25.74 
 
 
1029 aa  57.4  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.179334 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0744  ATPase-like protein  27.78 
 
 
1054 aa  55.8  0.000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1786  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  26.46 
 
 
1081 aa  55.8  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.145933 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5445  transcriptional regulator  25.98 
 
 
1161 aa  54.7  0.000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.202606 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3011  serine/threonine protein kinase  26.49 
 
 
1637 aa  51.6  0.00006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.15444  normal 
 
 
-
 
NC_011700  PHATRDRAFT_50617  predicted protein  21.59 
 
 
859 aa  51.2  0.00008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00889588  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1559  ATPase-like protein  27.1 
 
 
916 aa  49.7  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1771  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  23.42 
 
 
1403 aa  49.3  0.0003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00900617  normal  0.173635 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6020  multi-sensor signal transduction multi-kinase  25.17 
 
 
1666 aa  49.7  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2685  adenylate/guanylate cyclase  23.53 
 
 
1093 aa  48.9  0.0004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.111623 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4797  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  26.67 
 
 
1468 aa  49.3  0.0004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2227  XRE family transcriptional regulator  24.3 
 
 
1015 aa  47.4  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5349  transcriptional regulator, LuxR family  28.45 
 
 
900 aa  47.4  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0835513  normal  0.0775284 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3193  LuxR family transcriptional regulator  25.75 
 
 
895 aa  46.6  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1904  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  23.64 
 
 
1014 aa  45.8  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3612  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  24.18 
 
 
1089 aa  46.2  0.003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.758157  normal 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43378  predicted protein  26.11 
 
 
1934 aa  46.2  0.003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4285  ATPase-like protein  22.57 
 
 
1114 aa  46.2  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.660299  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2785  transcriptional regulator, LuxR family  28.57 
 
 
1013 aa  46.2  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>