More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_4550 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_3855  serine/threonine protein kinase  61.01 
 
 
1726 aa  1873    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.993945  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4642  serine/threonine protein kinase  76.14 
 
 
1629 aa  2371    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3410  PAS sensor protein  46.04 
 
 
1788 aa  1106    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3011  serine/threonine protein kinase  68.26 
 
 
1637 aa  2120    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.15444  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4360  serine/threonine protein kinase  67.28 
 
 
1636 aa  2112    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4550  serine/threonine protein kinase  100 
 
 
1649 aa  3269    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.773527  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4054  ATPase domain-containing protein  46.26 
 
 
1756 aa  1119    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.892687 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7079  serine/threonine protein kinase  65.88 
 
 
1643 aa  2007    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0083  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  25 
 
 
1780 aa  491  1e-137  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.000111107  normal  0.0603915 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3863  serine/threonine protein kinase  25.13 
 
 
1932 aa  485  1e-135  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.16281 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5741  serine/threonine protein kinase  25.03 
 
 
1914 aa  479  1e-133  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0791  ATP-binding region ATPase domain protein  27.04 
 
 
2051 aa  479  1e-133  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.417988  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4716  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  25.21 
 
 
1808 aa  475  1e-132  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.230197  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2857  adenylate/guanylate cyclase  24.92 
 
 
1805 aa  470  1.0000000000000001e-131  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4622  multi-sensor signal transduction multi-kinase  29.66 
 
 
1780 aa  469  9.999999999999999e-131  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.701325  normal  0.952257 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3968  serine/threonine protein kinase  27.04 
 
 
1908 aa  470  9.999999999999999e-131  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.221286 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5744  multi-sensor signal transduction multi-kinase  30.77 
 
 
1845 aa  462  9.999999999999999e-129  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0117  serine/threonine protein kinase and signal transduction histidine kinase with GAF and PAS/PAC sensor  27.18 
 
 
2361 aa  459  1e-127  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1629  hypothetical protein  26.39 
 
 
2279 aa  448  1.0000000000000001e-124  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00385433 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2738  putative PAS/PAC sensor protein  24.95 
 
 
2077 aa  446  1e-123  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1683  PAS sensor protein  28.62 
 
 
1833 aa  442  9.999999999999999e-123  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.725143 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3535  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  25.41 
 
 
1804 aa  436  1e-120  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.655347 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4503  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  25.51 
 
 
1797 aa  432  1e-119  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.194827  normal  0.137244 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7756  PAS sensor protein  27.83 
 
 
1809 aa  429  1e-118  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0645  serine/threonine protein kinase  26.3 
 
 
1644 aa  426  1e-117  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0171562  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2428  PAS sensor protein  28.63 
 
 
1837 aa  424  1e-117  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.787008  normal  0.842881 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1980  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  23.71 
 
 
1901 aa  422  1e-116  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0349147  normal  0.535824 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4489  serine/threonine protein kinase and signal transduction histidine kinase with GAF sensor  23.55 
 
 
1850 aa  419  9.999999999999999e-116  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.613962  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2803  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  24.86 
 
 
1805 aa  413  1e-113  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.70885 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0999  hypothetical protein  25.59 
 
 
2272 aa  414  1e-113  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.715869 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2556  ATP-binding region, ATPase-like  24.9 
 
 
1811 aa  413  1e-113  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2845  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF and PAS/PAC sensor  23.88 
 
 
1934 aa  409  1.0000000000000001e-112  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.218586  normal  0.818872 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3596  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  25.08 
 
 
2017 aa  409  1.0000000000000001e-112  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.107255 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4616  PAS sensor protein  28.28 
 
 
1836 aa  404  1e-111  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1160  hypothetical protein  25.3 
 
 
2303 aa  404  1e-111  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4528  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  28.36 
 
 
1668 aa  401  9.999999999999999e-111  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1234  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  27.97 
 
 
1663 aa  400  1e-109  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.745042  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4504  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  24.42 
 
 
1795 aa  393  1e-107  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.575028 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1563  multi-sensor signal transduction multi-kinase  27.71 
 
 
1822 aa  386  1e-105  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0557891 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0183  protein kinase  27.56 
 
 
1697 aa  363  1e-98  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2398  ATP-binding region ATPase domain protein  26.94 
 
 
1712 aa  363  2e-98  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.623096  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3995  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  28.82 
 
 
1794 aa  339  1.9999999999999998e-91  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2181  ATP-binding region ATPase domain protein  29.15 
 
 
1922 aa  331  6e-89  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.116239 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3295  multi-sensor signal transduction multi-kinase  27.76 
 
 
1774 aa  328  6e-88  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2107  serine/threonine protein kinase  29.97 
 
 
670 aa  323  1.9999999999999998e-86  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.568575 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1945  multi-sensor signal transduction multi-kinase  27.83 
 
 
1832 aa  318  7e-85  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0187004 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6208  ATP-binding region ATPase domain protein  30.44 
 
 
1885 aa  317  8e-85  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2984  PAS sensor protein  32.66 
 
 
2109 aa  308  8.000000000000001e-82  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.591507  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2277  multi-sensor signal transduction multi-kinase  26.65 
 
 
1797 aa  303  2e-80  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.947046 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0030  ATPase domain-containing protein  25.45 
 
 
1739 aa  301  8e-80  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5242  sensor histidine kinase/GAF domain-containing protein  26.59 
 
 
1682 aa  289  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.59114  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5152  ATPase domain-containing protein  26.95 
 
 
1682 aa  288  5.999999999999999e-76  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.198047  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5743  ATPase domain-containing protein  28.31 
 
 
1685 aa  281  6e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6496  ATPase domain-containing protein  28.51 
 
 
1685 aa  281  7e-74  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.53789  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2978  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.67 
 
 
1942 aa  273  2e-71  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6696  multi-sensor signal transduction multi-kinase  27.97 
 
 
1885 aa  244  1e-62  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0854  ATP-binding region ATPase domain protein  26.13 
 
 
1871 aa  241  1e-61  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5309  sensor histidine kinase  32.87 
 
 
1744 aa  228  1e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0910571 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1544  ATP-binding region ATPase domain protein  24.86 
 
 
1710 aa  209  4e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0230  ATPase domain-containing protein  29.19 
 
 
1685 aa  193  2e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.59916  normal  0.455487 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6170  multi-sensor signal transduction multi-kinase  29.01 
 
 
1748 aa  191  1e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1471  diguanylate cyclase  44.65 
 
 
339 aa  165  6e-39  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.435801  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1450  diguanylate cyclase  27.71 
 
 
1774 aa  163  3e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6308  serine/threonine protein kinase  30.65 
 
 
1235 aa  158  7e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4407  GGDEF family protein  42.72 
 
 
344 aa  158  8e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0414  diguanylate cyclase  42.38 
 
 
346 aa  158  9e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2495  diguanylate cyclase  46.08 
 
 
422 aa  157  1e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0610  two component response regulator  48.07 
 
 
649 aa  157  2e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1597  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  42.86 
 
 
313 aa  155  8e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS00826  putative transmembrane protein  43.75 
 
 
488 aa  154  1e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.61367  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4681  GGDEF domain-containing protein  40.8 
 
 
1034 aa  152  5e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4535  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  46.91 
 
 
345 aa  152  7e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0387275  normal  0.636684 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0847  two component diguanylate cyclase  42 
 
 
327 aa  151  9e-35  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2634  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  48.13 
 
 
843 aa  150  2.0000000000000003e-34  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4149  diguanylate cyclase  34.46 
 
 
591 aa  150  2.0000000000000003e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0015025  normal  0.169582 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1738  diguanylate cyclase  38.81 
 
 
462 aa  150  2.0000000000000003e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3956  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  44.23 
 
 
357 aa  150  3e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.892783  normal  0.485051 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1713  diguanylate cyclase  38.81 
 
 
462 aa  149  3e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3673  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with GAF sensor  42.93 
 
 
1262 aa  149  4.0000000000000006e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3449  diguanylate cyclase  44.23 
 
 
357 aa  149  4.0000000000000006e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.103484 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0133  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  44.39 
 
 
461 aa  149  6e-34  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1516  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  44.33 
 
 
352 aa  149  6e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.0065858  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1622  response regulator receiver protein  37.62 
 
 
641 aa  149  6e-34  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.923164  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0310  diguanylate cyclase  41.18 
 
 
340 aa  148  9e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3068  diguanylate cyclase  39.81 
 
 
516 aa  147  2e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.608977 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0313  diguanylate cyclase  40.69 
 
 
340 aa  147  2e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3783  sensory transduction system, regulatory protein  42.92 
 
 
546 aa  146  3e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1305  GGDEF domain protein  44.86 
 
 
502 aa  146  3e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.620212  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3172  diguanylate cyclase  43.35 
 
 
518 aa  146  3e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.211888 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0095  putative sensory transduction system, regulatory protein  44.66 
 
 
536 aa  146  3e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.348008  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2018  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  44.22 
 
 
355 aa  146  3e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.414914  normal  0.602726 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0314  diguanylate cyclase  40.69 
 
 
340 aa  146  3e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1099  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  43.43 
 
 
334 aa  146  4e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0799  diguanylate cyclase  42.04 
 
 
538 aa  146  4e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0186826  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3470  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  43.5 
 
 
353 aa  145  5e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.843913  normal  0.949354 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0308  diguanylate cyclase  40.2 
 
 
340 aa  145  5e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4055  diguanylate cyclase  43.5 
 
 
354 aa  145  5e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.33875  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3973  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  42.27 
 
 
362 aa  145  5e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.415221  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4311  diguanylate cyclase  43.5 
 
 
354 aa  145  5e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.750548  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0954  diguanylate cyclase  45.74 
 
 
502 aa  145  7e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0641916  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>