112 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_50602 on replicon NC_011700
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011686  PHATRDRAFT_48535  predicted protein  39.59 
 
 
1112 aa  796    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.12643  n/a   
 
 
-
 
NC_011700  PHATRDRAFT_50602  predicted protein  100 
 
 
1255 aa  2604    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.94407  n/a   
 
 
-
 
NC_011700  PHATRDRAFT_50614  predicted protein  40.47 
 
 
1123 aa  825    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1980  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  25.02 
 
 
1901 aa  328  3e-88  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0349147  normal  0.535824 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3968  serine/threonine protein kinase  25.23 
 
 
1908 aa  309  2.0000000000000002e-82  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.221286 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2978  multi-sensor signal transduction histidine kinase  24.93 
 
 
1942 aa  300  1e-79  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4503  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  25.46 
 
 
1797 aa  298  3e-79  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.194827  normal  0.137244 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0117  serine/threonine protein kinase and signal transduction histidine kinase with GAF and PAS/PAC sensor  25.78 
 
 
2361 aa  296  2e-78  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4489  serine/threonine protein kinase and signal transduction histidine kinase with GAF sensor  24.15 
 
 
1850 aa  293  2e-77  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.613962  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0083  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  25.16 
 
 
1780 aa  287  9e-76  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.000111107  normal  0.0603915 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0791  ATP-binding region ATPase domain protein  25.41 
 
 
2051 aa  273  1e-71  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.417988  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1683  PAS sensor protein  25.4 
 
 
1833 aa  273  2e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.725143 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2845  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF and PAS/PAC sensor  25.13 
 
 
1934 aa  268  5e-70  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.218586  normal  0.818872 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3535  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  22.9 
 
 
1804 aa  268  5e-70  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.655347 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4504  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  24.12 
 
 
1795 aa  264  6e-69  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.575028 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2857  adenylate/guanylate cyclase  23.92 
 
 
1805 aa  256  2.0000000000000002e-66  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3863  serine/threonine protein kinase  24.17 
 
 
1932 aa  254  5.000000000000001e-66  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.16281 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2738  putative PAS/PAC sensor protein  24.38 
 
 
2077 aa  254  6e-66  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45780  predicted protein  24.03 
 
 
1060 aa  250  1e-64  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0854  ATP-binding region ATPase domain protein  24.96 
 
 
1871 aa  249  3e-64  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3995  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  22.96 
 
 
1794 aa  247  9.999999999999999e-64  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2984  PAS sensor protein  25.18 
 
 
2109 aa  246  1.9999999999999999e-63  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.591507  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2181  ATP-binding region ATPase domain protein  27.27 
 
 
1922 aa  246  1.9999999999999999e-63  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.116239 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4716  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  23.18 
 
 
1808 aa  246  3e-63  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.230197  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2803  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  24.41 
 
 
1805 aa  242  2.9999999999999997e-62  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.70885 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0645  serine/threonine protein kinase  23.84 
 
 
1644 aa  241  8e-62  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0171562  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4622  multi-sensor signal transduction multi-kinase  24.68 
 
 
1780 aa  241  8e-62  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.701325  normal  0.952257 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3596  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  23.34 
 
 
2017 aa  240  1e-61  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.107255 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_49028  predicted protein  23.69 
 
 
1064 aa  240  1e-61  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3295  multi-sensor signal transduction multi-kinase  22.78 
 
 
1774 aa  236  3e-60  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7756  PAS sensor protein  24.45 
 
 
1809 aa  231  5e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1563  multi-sensor signal transduction multi-kinase  24.47 
 
 
1822 aa  231  7e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0557891 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4528  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  24.15 
 
 
1668 aa  227  1e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0999  hypothetical protein  23.91 
 
 
2272 aa  227  1e-57  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.715869 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5741  serine/threonine protein kinase  23.75 
 
 
1914 aa  223  1.9999999999999999e-56  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2556  ATP-binding region, ATPase-like  23.48 
 
 
1811 aa  220  1e-55  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2398  ATP-binding region ATPase domain protein  24.36 
 
 
1712 aa  217  9.999999999999999e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.623096  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0183  protein kinase  22.42 
 
 
1697 aa  214  5.999999999999999e-54  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1234  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  24.37 
 
 
1663 aa  211  5e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.745042  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1160  hypothetical protein  23.63 
 
 
2303 aa  211  5e-53  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6208  ATP-binding region ATPase domain protein  24.24 
 
 
1885 aa  206  2e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1629  hypothetical protein  23.06 
 
 
2279 aa  206  2e-51  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00385433 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4616  PAS sensor protein  23.65 
 
 
1836 aa  201  9e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5744  multi-sensor signal transduction multi-kinase  25.31 
 
 
1845 aa  190  1e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2428  PAS sensor protein  25.61 
 
 
1837 aa  186  2.0000000000000003e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.787008  normal  0.842881 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0030  ATPase domain-containing protein  24.29 
 
 
1739 aa  183  2e-44  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_54547  protein kinase  23.93 
 
 
900 aa  165  5.0000000000000005e-39  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_49156  predicted protein  24.67 
 
 
1086 aa  153  2e-35  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.402458  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6496  ATPase domain-containing protein  21.88 
 
 
1685 aa  147  2e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.53789  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2277  multi-sensor signal transduction multi-kinase  23.75 
 
 
1797 aa  145  4e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.947046 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5743  ATPase domain-containing protein  21.61 
 
 
1685 aa  144  9e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5309  sensor histidine kinase  23.29 
 
 
1744 aa  137  9.999999999999999e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0910571 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2314  adenylate/guanylate cyclase  22.79 
 
 
1473 aa  137  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2361  adenylate/guanylate cyclase  22.79 
 
 
1473 aa  137  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2353  adenylate/guanylate cyclase  22.54 
 
 
1473 aa  134  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.525231 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2108  GAF sensor signal transduction histidine kinase  21.16 
 
 
1123 aa  127  2e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011700  PHATRDRAFT_50616  predicted protein  21.96 
 
 
1015 aa  123  1.9999999999999998e-26  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00719688  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6696  multi-sensor signal transduction multi-kinase  22.39 
 
 
1885 aa  118  6e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2107  serine/threonine protein kinase  24.76 
 
 
670 aa  114  1.0000000000000001e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.568575 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4360  serine/threonine protein kinase  22.25 
 
 
1636 aa  108  6e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1544  ATP-binding region ATPase domain protein  21.77 
 
 
1710 aa  103  3e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6170  multi-sensor signal transduction multi-kinase  22.53 
 
 
1748 aa  100  2e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4054  ATPase domain-containing protein  21.55 
 
 
1756 aa  99  6e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.892687 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7079  serine/threonine protein kinase  24.42 
 
 
1643 aa  94.4  1e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3011  serine/threonine protein kinase  21.88 
 
 
1637 aa  90.1  2e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.15444  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1945  multi-sensor signal transduction multi-kinase  21.59 
 
 
1832 aa  89.7  3e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0187004 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0230  ATPase domain-containing protein  22.2 
 
 
1685 aa  88.2  0.000000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.59916  normal  0.455487 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4642  serine/threonine protein kinase  23.75 
 
 
1629 aa  86.7  0.000000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011700  PHATRDRAFT_50617  predicted protein  19.82 
 
 
859 aa  85.5  0.000000000000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00889588  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3410  PAS sensor protein  26.01 
 
 
1788 aa  84.7  0.00000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4550  serine/threonine protein kinase  22.03 
 
 
1649 aa  80.5  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.773527  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5242  sensor histidine kinase/GAF domain-containing protein  24.92 
 
 
1682 aa  72  0.00000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.59114  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5152  ATPase domain-containing protein  27.08 
 
 
1682 aa  70.9  0.0000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.198047  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1600  ATPase-like protein  22.79 
 
 
1071 aa  68.6  0.0000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3549  transcriptional regulator, LuxR family  24.09 
 
 
1022 aa  67.4  0.000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.642921  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3855  serine/threonine protein kinase  23.9 
 
 
1726 aa  66.2  0.000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.993945  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1786  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  22.51 
 
 
1081 aa  63.9  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.145933 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03102  sensor histidine kinase/response regulator, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G12550)  24.89 
 
 
2312 aa  62  0.00000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.461392  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8304  transcriptional regulator, LuxR family  24.88 
 
 
1084 aa  60.1  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3612  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  22.52 
 
 
1089 aa  59.7  0.0000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.758157  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1406  transcriptional activator domain-containing protein  22.48 
 
 
1067 aa  58.5  0.0000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1960  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  20.69 
 
 
1080 aa  58.5  0.0000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5617  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  20.08 
 
 
1151 aa  57  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.413675 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0761  LuxR family transcriptional regulator  26.26 
 
 
881 aa  56.6  0.000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5834  adenylate/guanylate cyclase  20.63 
 
 
1151 aa  57  0.000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2227  XRE family transcriptional regulator  22.16 
 
 
1015 aa  56.2  0.000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6723  adenylate/guanylate cyclase  20.87 
 
 
1148 aa  55.8  0.000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4074  serine/threonine protein kinase  33.91 
 
 
1297 aa  55.1  0.000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0173368 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4593  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  20.47 
 
 
1141 aa  54.3  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0063  transcriptional regulator  27.96 
 
 
1190 aa  54.3  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.82825  normal  0.766346 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6166  adenylate/guanylate cyclase  20.18 
 
 
1139 aa  53.9  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0338  transcriptional regulator  25.45 
 
 
1193 aa  53.9  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.497277  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6796  transcriptional regulator  23.32 
 
 
1118 aa  53.1  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3641  adenylate/guanylate cyclase  20.61 
 
 
1138 aa  53.1  0.00004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.595732  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0817  diguanylate cyclase  20.9 
 
 
1826 aa  52.4  0.00005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1771  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  22.93 
 
 
1403 aa  52.4  0.00006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00900617  normal  0.173635 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1998  transcriptional regulator, LuxR family  28.08 
 
 
956 aa  52  0.00007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0120259  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0848  transcriptional regulator, LuxR family  21.86 
 
 
954 aa  49.3  0.0005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1430  adenylate/guanylate cyclase  22.43 
 
 
1160 aa  48.5  0.0008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0380252  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1929  regulatory protein, LuxR  24.83 
 
 
862 aa  48.1  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>