27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_1353 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_1353  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 864 aa  1716    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4022  hypothetical protein  41.32 
 
 		 854 aa  360  6e-98  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.864107  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1807  WD-40 repeat-containing protein  25.85 
 
 		 1214 aa  105  4e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000135295 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2507  putative Chase2 sensor protein  27.1 
 
 		 902 aa  99.8  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.476468  normal  0.563168 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3059  putative Chase2 sensor protein  27.27 
 
 		 781 aa  99.4  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.321518 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2738  putative PAS/PAC sensor protein  28.25 
 
 		 2077 aa  99.4  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3607  putative Chase2 sensor protein  27.1 
 
 		 902 aa  99.8  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4408  WD-40 repeat protein  26.94 
 
 		 1177 aa  99.4  3e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.760311 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1624  WD-40 repeat-containing protein  26.82 
 
 		 1176 aa  98.6  4e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.228401 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5741  serine/threonine protein kinase  26.89 
 
 		 1914 aa  90.9  8e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3863  serine/threonine protein kinase  30.08 
 
 		 1932 aa  90.9  9e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.16281 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1813  WD repeat-containing protein  29.41 
 
 		 376 aa  90.5  1e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0550116  hitchhiker  0.000537026 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2971  WD-40 repeat-containing protein  25.95 
 
 		 1367 aa  89.4  3e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1167  WD-40 repeat protein  28.81 
 
 		 1163 aa  87.4  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3968  serine/threonine protein kinase  24.79 
 
 		 1908 aa  86.3  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.221286 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4412  WD-40 repeat protein  26.5 
 
 		 1161 aa  84  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4475  WD-40 repeat protein  26.5 
 
 		 1161 aa  83.6  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.416267 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3594  WD-40 repeat protein  26.99 
 
 		 1164 aa  80.9  0.00000000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0139951 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4813  WD-40 repeat-containing protein  22.75 
 
 		 1477 aa  80.9  0.0000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.974814 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4252  WD-40 repeat protein  23.73 
 
 		 1209 aa  80.1  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.23422  hitchhiker  0.00156947 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0228  putative Chase2 sensor protein  27.5 
 
 		 787 aa  78.2  0.0000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.433927 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0703  WD-40 repeat protein  26.06 
 
 		 1190 aa  78.2  0.0000000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5743  TPR repeat-containing protein  29.34 
 
 		 335 aa  77.8  0.0000000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4983  WD-40 repeat-containing protein  28.94 
 
 		 891 aa  72.4  0.00000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.709938 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1808  TIR protein  22.86 
 
 		 500 aa  53.1  0.00002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000211372 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0306  hypothetical protein  28.35 
 
 		 526 aa  49.3  0.0003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.203895 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3213  WD-40 repeat-containing protein  24.49 
 
 		 1304 aa  48.9  0.0004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.297689  normal  0.929062 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>