More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_2357 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013223  Dret_2357  diguanylate cyclase  100 
 
 
252 aa  521  1e-147  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1341  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  49.74 
 
 
319 aa  191  9e-48  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1471  diguanylate cyclase  45.88 
 
 
339 aa  187  1e-46  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.435801  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0362  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  48.42 
 
 
890 aa  187  2e-46  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.190279  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0371  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  47.89 
 
 
890 aa  186  3e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3528  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  50 
 
 
310 aa  186  3e-46  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0709  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  45.16 
 
 
322 aa  185  5e-46  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.169559 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2955  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  47.43 
 
 
308 aa  177  1e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2076  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  45.64 
 
 
481 aa  177  1e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00773841  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2052  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  45.64 
 
 
481 aa  177  2e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1561  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  48.55 
 
 
455 aa  175  5e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000734361  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1805  diguanylate cyclase with PAS/PAC and GAF sensors  48.02 
 
 
960 aa  175  5e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5086  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  49.4 
 
 
465 aa  175  6e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3032  diguanylate cyclase  49.12 
 
 
547 aa  175  7e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0218  diguanylate cyclase  49.38 
 
 
304 aa  175  7e-43  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2812  diguanylate cyclase  43.41 
 
 
315 aa  175  8e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1684  GGDEF domain-containing protein  45.45 
 
 
323 aa  174  9.999999999999999e-43  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1622  response regulator receiver protein  46.59 
 
 
641 aa  172  2.9999999999999996e-42  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.923164  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0984  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  45.26 
 
 
353 aa  172  3.9999999999999995e-42  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.194443 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2380  diguanylate cyclase  42.18 
 
 
410 aa  172  6.999999999999999e-42  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1713  diguanylate cyclase  44.97 
 
 
462 aa  171  7.999999999999999e-42  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4132  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  47.73 
 
 
310 aa  171  7.999999999999999e-42  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1192  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  46.86 
 
 
316 aa  171  9e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1738  diguanylate cyclase  44.97 
 
 
462 aa  171  1e-41  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4336  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  47.73 
 
 
310 aa  170  2e-41  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4204  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  47.16 
 
 
310 aa  169  3e-41  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1949  sensory box/GGDEF family protein  45.71 
 
 
579 aa  169  4e-41  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.773832  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0314  diguanylate cyclase  49.7 
 
 
340 aa  169  4e-41  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1420  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  45.56 
 
 
314 aa  169  5e-41  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4149  diguanylate cyclase  45.64 
 
 
591 aa  168  6e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0015025  normal  0.169582 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1597  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  41.01 
 
 
313 aa  168  7e-41  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0252  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  48.17 
 
 
310 aa  168  8e-41  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.555837  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0095  putative sensory transduction system, regulatory protein  48.57 
 
 
536 aa  168  8e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.348008  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0133  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  40 
 
 
461 aa  167  1e-40  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4407  GGDEF family protein  48.55 
 
 
344 aa  167  1e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0257  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  48.17 
 
 
310 aa  167  1e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.929741  normal  0.0241212 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0414  diguanylate cyclase  48.55 
 
 
346 aa  167  2e-40  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2495  diguanylate cyclase  40.57 
 
 
422 aa  166  2e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0411  PAS:GGDEF  46.24 
 
 
317 aa  166  2.9999999999999998e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.320308 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5066  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  45.51 
 
 
338 aa  166  4e-40  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0310  diguanylate cyclase  49.09 
 
 
340 aa  166  4e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0847  two component diguanylate cyclase  44.67 
 
 
327 aa  165  5e-40  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0313  diguanylate cyclase  49.09 
 
 
340 aa  165  5e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3068  diguanylate cyclase  43.32 
 
 
516 aa  165  5.9999999999999996e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.608977 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2914  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  44.32 
 
 
312 aa  165  6.9999999999999995e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0116  diguanylate cyclase  47.09 
 
 
398 aa  165  6.9999999999999995e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.864855  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0019  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  47.22 
 
 
341 aa  165  8e-40  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0416556  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3170  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  43.75 
 
 
344 aa  164  1.0000000000000001e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.103544 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2096  diguanylate cyclase with GAF sensor  44.38 
 
 
664 aa  163  2.0000000000000002e-39  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.76184 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3673  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with GAF sensor  47.19 
 
 
1262 aa  164  2.0000000000000002e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2062  diguanylate cyclase  46.11 
 
 
620 aa  163  3e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.502085 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1516  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  41.94 
 
 
352 aa  162  4.0000000000000004e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.0065858  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3210  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  45.65 
 
 
337 aa  162  4.0000000000000004e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.32327  normal  0.712325 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3123  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  46.24 
 
 
312 aa  162  4.0000000000000004e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3669  diguanylate cyclase  46.28 
 
 
300 aa  162  4.0000000000000004e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0119902  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3800  diguanylate cyclase  43.16 
 
 
553 aa  162  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.223141 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2534  diguanylate cyclase with GAF sensor  51.57 
 
 
421 aa  162  5.0000000000000005e-39  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.657544  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3544  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  46.11 
 
 
322 aa  162  5.0000000000000005e-39  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0106122 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0799  diguanylate cyclase  42 
 
 
538 aa  162  5.0000000000000005e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0186826  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0225  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  43.5 
 
 
325 aa  162  6e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3819  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  42.7 
 
 
660 aa  160  1e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1030  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  42.86 
 
 
330 aa  161  1e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.33399 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3770  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  42.7 
 
 
660 aa  161  1e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3671  putative signaling protein  47.9 
 
 
480 aa  160  2e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0308  diguanylate cyclase  47.88 
 
 
340 aa  160  2e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3770  PAS:GGDEF  46.06 
 
 
328 aa  160  3e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0223226 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3787  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  42.16 
 
 
344 aa  159  3e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.919533  normal  0.90313 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2194  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  46.89 
 
 
636 aa  159  3e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1122  GGDEF domain-containing protein  46.75 
 
 
506 aa  159  4e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.014859  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3783  sensory transduction system, regulatory protein  42.71 
 
 
546 aa  159  4e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4015  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  44.32 
 
 
315 aa  159  5e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4360  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  45.45 
 
 
338 aa  159  6e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2499  GGDEF domain-containing protein  46.71 
 
 
367 aa  158  7e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2032  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  44.94 
 
 
310 aa  158  1e-37  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0275  diguanylate cyclase  46.11 
 
 
630 aa  157  1e-37  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.0339591 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1121  diguanylate cyclase  44.02 
 
 
305 aa  157  1e-37  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.323017 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3566  diguanylate cyclase  44.12 
 
 
561 aa  156  2e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0665818  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4228  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  40.19 
 
 
334 aa  156  3e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0828  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with GAF sensor  44.91 
 
 
734 aa  156  3e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.84548  normal  0.140102 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2297  diguanylate cyclase  43.26 
 
 
533 aa  156  3e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.777078  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1974  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  42.11 
 
 
340 aa  156  3e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.098619 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2222  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  40.74 
 
 
732 aa  156  3e-37  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.513474  normal  0.0596169 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0437  GGDEF domain-containing protein  45.31 
 
 
558 aa  155  4e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4321  diguanylate cyclase  42.93 
 
 
534 aa  155  5.0000000000000005e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0058  diguanylate cyclase  45.81 
 
 
565 aa  155  5.0000000000000005e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.714624  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1099  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  40.47 
 
 
334 aa  155  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2160  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  41.4 
 
 
732 aa  155  6e-37  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3784  putative sensory transduction system, regulatory protein  39.8 
 
 
549 aa  155  7e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3967  putative response regulator of a two-component system  41.59 
 
 
335 aa  155  7e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000645274  normal  0.0110626 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3843  diguanylate cyclase  44.05 
 
 
472 aa  155  8e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5111  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  44.38 
 
 
479 aa  155  9e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0250  GGDEF domain-containing protein  45.56 
 
 
489 aa  154  1e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.164767  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0984  GGDEF domain-containing protein  45.56 
 
 
489 aa  154  1e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.184695  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1309  GGDEF  40.19 
 
 
334 aa  154  1e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00365402 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0315  GGDEF domain-containing protein  45.56 
 
 
484 aa  154  1e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.237701  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1346  GGDEF domain-containing protein  45.56 
 
 
499 aa  154  1e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0669442  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2667  diguanylate cyclase  46.07 
 
 
522 aa  154  1e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.548675  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1840  putative transmembrane transcriptional sensor regulator  45.56 
 
 
506 aa  154  1e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0399375  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1755  diguanylate cyclase  45.56 
 
 
499 aa  154  1e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0390  GGDEF domain-containing protein  45.56 
 
 
499 aa  154  1e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.817676  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>