More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BTH_II1122 on replicon NC_007650
Organism: Burkholderia thailandensis E264



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006349  BMAA0984  GGDEF domain-containing protein  91.17 
 
 
489 aa  883    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.184695  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1346  GGDEF domain-containing protein  91.35 
 
 
499 aa  906    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0669442  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0315  GGDEF domain-containing protein  91.29 
 
 
484 aa  875    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.237701  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1122  GGDEF domain-containing protein  100 
 
 
506 aa  1004    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.014859  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0390  GGDEF domain-containing protein  91.35 
 
 
499 aa  906    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.817676  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1755  diguanylate cyclase  91.35 
 
 
499 aa  906    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1840  putative transmembrane transcriptional sensor regulator  91.67 
 
 
506 aa  922    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0399375  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0250  GGDEF domain-containing protein  91.38 
 
 
489 aa  886    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.164767  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1901  diguanylate cyclase  43.92 
 
 
492 aa  410  1e-113  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1924  diguanylate cyclase  43.71 
 
 
492 aa  410  1e-113  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.268801  normal  0.495061 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6178  diguanylate cyclase  43.92 
 
 
492 aa  410  1e-113  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.837587  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6347  diguanylate cyclase  45.42 
 
 
507 aa  398  1e-109  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.197089 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1021  diguanylate cyclase  42.36 
 
 
492 aa  398  1e-109  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0128107  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1025  diguanylate cyclase  42.36 
 
 
492 aa  397  1e-109  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4045  diguanylate cyclase  43.18 
 
 
492 aa  392  1e-108  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3188  diguanylate cyclase  44.71 
 
 
529 aa  390  1e-107  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.210299 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1598  diguanylate cyclase  42.8 
 
 
492 aa  385  1e-106  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0273825  normal  0.888834 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4694  diguanylate cyclase  44.35 
 
 
492 aa  388  1e-106  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4503  diguanylate cyclase  42.77 
 
 
492 aa  387  1e-106  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5084  diguanylate cyclase  43.22 
 
 
503 aa  378  1e-103  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.494089  normal  0.0445442 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0401  GGDEF domain-containing protein  43.42 
 
 
507 aa  374  1e-102  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2825  GGDEF domain-containing protein  43.83 
 
 
487 aa  372  1e-102  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.819973  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0097  GGDEF domain-containing protein  43.51 
 
 
487 aa  369  1e-101  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4565  diguanylate cyclase  43.33 
 
 
521 aa  370  1e-101  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.267028  normal  0.0465187 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1257  diguanylate cyclase  43.51 
 
 
487 aa  369  1e-101  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0115  diguanylate cyclase  43.51 
 
 
487 aa  369  1e-101  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.418458  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5496  diguanylate cyclase  42.55 
 
 
520 aa  369  1e-101  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.414779  hitchhiker  0.000876281 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5189  diguanylate cyclase  43.11 
 
 
521 aa  369  1e-101  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1535  diguanylate cyclase  43.51 
 
 
487 aa  369  1e-101  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5670  diguanylate cyclase  43.11 
 
 
521 aa  369  1e-101  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0236259 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1077  GGDEF domain-containing protein  43.51 
 
 
528 aa  368  1e-100  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.918636  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2678  diguanylate cyclase  43.45 
 
 
487 aa  368  1e-100  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3714  diguanylate cyclase  43.01 
 
 
510 aa  367  1e-100  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.28391  normal  0.0412955 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3807  diguanylate cyclase  43.01 
 
 
510 aa  367  1e-100  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.417307 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4649  diguanylate cyclase  43.01 
 
 
510 aa  367  1e-100  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2397  diguanylate cyclase  42.03 
 
 
510 aa  364  2e-99  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4944  diguanylate cyclase  42.12 
 
 
520 aa  364  2e-99  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0582678 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0410  diguanylate cyclase  39.67 
 
 
516 aa  362  6e-99  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0028  diguanylate cyclase  41.79 
 
 
527 aa  359  6e-98  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.789293 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5454  diguanylate cyclase  42.38 
 
 
510 aa  356  5.999999999999999e-97  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.488047  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4297  diguanylate cyclase  39.96 
 
 
522 aa  353  2.9999999999999997e-96  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0491288  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5012  diguanylate cyclase  43.4 
 
 
510 aa  353  5e-96  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3598  diguanylate cyclase  42.17 
 
 
510 aa  347  3e-94  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS04801  hypothetical protein  39.04 
 
 
505 aa  328  2.0000000000000001e-88  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0299872 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0638  diguanylate cyclase  40.83 
 
 
524 aa  325  1e-87  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0484455 
 
 
-
 
NC_003296  RS00826  putative transmembrane protein  40.35 
 
 
488 aa  322  9.999999999999999e-87  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.61367  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3991  diguanylate cyclase  38 
 
 
505 aa  317  5e-85  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.613369 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4104  diguanylate cyclase  38 
 
 
505 aa  317  5e-85  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.340706 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5514  diguanylate cyclase  39.7 
 
 
493 aa  309  8e-83  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.333875  normal  0.197216 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0175  diguanylate cyclase  36.91 
 
 
516 aa  308  2.0000000000000002e-82  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6345  diguanylate cyclase  40.21 
 
 
506 aa  301  2e-80  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.155718  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4536  diguanylate cyclase  37.5 
 
 
503 aa  301  2e-80  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.221207  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0518  diguanylate cyclase  38.03 
 
 
506 aa  301  3e-80  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5179  diguanylate cyclase  38.66 
 
 
504 aa  299  8e-80  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.466605 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6048  diguanylate cyclase  40.08 
 
 
506 aa  299  9e-80  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.423069 
 
 
-
 
NC_003296  RS00828  putative transmembrane protein  37.68 
 
 
512 aa  298  1e-79  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.33694  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6666  diguanylate cyclase  39.31 
 
 
502 aa  292  1e-77  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6431  diguanylate cyclase  39.31 
 
 
502 aa  292  1e-77  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1305  GGDEF domain protein  37.19 
 
 
502 aa  291  3e-77  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.620212  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6264  diguanylate cyclase  39.23 
 
 
502 aa  290  3e-77  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.291677  normal  0.150603 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1125  GGDEF  36.78 
 
 
509 aa  290  4e-77  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.394023  normal  0.376452 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2420  diguanylate cyclase  35.85 
 
 
532 aa  288  1e-76  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.499921  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0533  diguanylate cyclase  38.13 
 
 
480 aa  284  3.0000000000000004e-75  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0546  diguanylate cyclase  36.53 
 
 
499 aa  283  7.000000000000001e-75  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1127  GGDEF domain-containing protein  38.52 
 
 
572 aa  281  2e-74  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00567617  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6958  diguanylate cyclase  37.55 
 
 
502 aa  280  4e-74  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0954  diguanylate cyclase  36.88 
 
 
502 aa  279  9e-74  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0641916  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0868  GGDEF domain-containing protein  36.36 
 
 
494 aa  278  2e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.796056  normal  0.69001 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0766  diguanylate cyclase  36.47 
 
 
501 aa  277  3e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4395  diguanylate cyclase  36.44 
 
 
498 aa  276  6e-73  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2492  diguanylate cyclase  35.38 
 
 
474 aa  271  2.9999999999999997e-71  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.379327 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2715  diguanylate cyclase  35.85 
 
 
508 aa  271  2.9999999999999997e-71  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.271597  normal  0.533444 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1243  diguanylate cyclase  34.3 
 
 
510 aa  267  4e-70  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.624606  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4666  diguanylate cyclase  34.72 
 
 
501 aa  265  2e-69  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0421428  normal  0.479047 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0832  diguanylate cyclase  34.42 
 
 
496 aa  265  2e-69  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0798  GGDEF domain-containing protein  33.61 
 
 
496 aa  258  1e-67  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.412232  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0821  diguanylate cyclase  33.61 
 
 
496 aa  258  2e-67  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.605291  normal  0.227561 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2597  diguanylate cyclase  36.34 
 
 
506 aa  258  2e-67  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.938839 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0985  diguanylate cyclase  34.58 
 
 
508 aa  256  9e-67  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3174  diguanylate cyclase  36.94 
 
 
530 aa  236  7e-61  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.258431  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4491  diguanylate cyclase  40.19 
 
 
531 aa  230  5e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3328  GGDEF  35.46 
 
 
548 aa  229  1e-58  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00921167 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5691  diguanylate cyclase  33.13 
 
 
512 aa  228  2e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3800  diguanylate cyclase  30.23 
 
 
553 aa  225  1e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.223141 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02019  Putative signal protein with GGDEF domain  32.61 
 
 
494 aa  224  2e-57  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2295  diguanylate cyclase  33.54 
 
 
503 aa  223  9e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3068  diguanylate cyclase  29.84 
 
 
516 aa  221  1.9999999999999999e-56  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.608977 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4321  diguanylate cyclase  31.95 
 
 
534 aa  214  2.9999999999999995e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3172  diguanylate cyclase  36.82 
 
 
518 aa  211  3e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.211888 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2297  diguanylate cyclase  32.92 
 
 
533 aa  206  1e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.777078  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1348  diguanylate cyclase  27.31 
 
 
515 aa  203  6e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2930  diguanylate cyclase  26.97 
 
 
515 aa  199  9e-50  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.827018  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2281  GGDEF  35.12 
 
 
555 aa  198  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000303682  normal  0.0271008 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3242  GGDEF domain-containing protein  32.53 
 
 
522 aa  197  3e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.564089  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2519  diguanylate cyclase  36.02 
 
 
522 aa  195  1e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.926429  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2591  GGDEF domain protein  35.31 
 
 
528 aa  194  4e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.200767  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2667  diguanylate cyclase  34.47 
 
 
522 aa  186  6e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.548675  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2785  diguanylate cyclase  30.67 
 
 
519 aa  173  5.999999999999999e-42  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3673  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with GAF sensor  48.85 
 
 
1262 aa  170  7e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1597  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  46.56 
 
 
313 aa  167  4e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>