More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_4565 on replicon NC_010515
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008543  Bcen2424_5670  diguanylate cyclase  97.89 
 
 		 521 aa  995    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0236259 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5496  diguanylate cyclase  85.74 
 
 		 520 aa  872    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.414779  hitchhiker  0.000876281 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0028  diguanylate cyclase  92.9 
 
 		 527 aa  949    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.789293 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3188  diguanylate cyclase  83.14 
 
 		 529 aa  822    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.210299 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4944  diguanylate cyclase  86.32 
 
 		 520 aa  876    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0582678 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4565  diguanylate cyclase  100 
 
 		 521 aa  1050    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.267028  normal  0.0465187 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5189  diguanylate cyclase  97.89 
 
 		 521 aa  995    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1598  diguanylate cyclase  56.07 
 
 		 492 aa  545  1e-154  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0273825  normal  0.888834 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1021  diguanylate cyclase  57 
 
 		 492 aa  546  1e-154  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0128107  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1025  diguanylate cyclase  56.8 
 
 		 492 aa  544  1e-153  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6347  diguanylate cyclase  55.71 
 
 		 507 aa  541  9.999999999999999e-153  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.197089 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1924  diguanylate cyclase  55.78 
 
 		 492 aa  539  9.999999999999999e-153  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.268801  normal  0.495061 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1901  diguanylate cyclase  55.78 
 
 		 492 aa  537  1e-151  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6178  diguanylate cyclase  55.78 
 
 		 492 aa  537  1e-151  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.837587  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4694  diguanylate cyclase  57.95 
 
 		 492 aa  533  1e-150  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4045  diguanylate cyclase  55.86 
 
 		 492 aa  522  1e-147  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4503  diguanylate cyclase  55.44 
 
 		 492 aa  517  1.0000000000000001e-145  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5084  diguanylate cyclase  51.77 
 
 		 503 aa  474  1e-132  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.494089  normal  0.0445442 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3807  diguanylate cyclase  47.24 
 
 		 510 aa  444  1e-123  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.417307 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4649  diguanylate cyclase  47.24 
 
 		 510 aa  444  1e-123  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3714  diguanylate cyclase  47.24 
 
 		 510 aa  444  1e-123  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.28391  normal  0.0412955 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2397  diguanylate cyclase  46.27 
 
 		 510 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0410  diguanylate cyclase  47.6 
 
 		 516 aa  437  1e-121  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2825  GGDEF domain-containing protein  48.54 
 
 		 487 aa  436  1e-121  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.819973  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0401  GGDEF domain-containing protein  47.8 
 
 		 507 aa  436  1e-121  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0097  GGDEF domain-containing protein  48.12 
 
 		 487 aa  432  1e-120  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5012  diguanylate cyclase  49.29 
 
 		 510 aa  433  1e-120  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1077  GGDEF domain-containing protein  48.03 
 
 		 528 aa  434  1e-120  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.918636  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2678  diguanylate cyclase  48.33 
 
 		 487 aa  434  1e-120  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0115  diguanylate cyclase  48.12 
 
 		 487 aa  432  1e-120  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.418458  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1257  diguanylate cyclase  48.12 
 
 		 487 aa  432  1e-120  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1535  diguanylate cyclase  48.12 
 
 		 487 aa  432  1e-120  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5454  diguanylate cyclase  46.64 
 
 		 510 aa  431  1e-119  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.488047  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3598  diguanylate cyclase  46.65 
 
 		 510 aa  422  1e-117  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4297  diguanylate cyclase  45.15 
 
 		 522 aa  410  1e-113  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0491288  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS04801  hypothetical protein  44.53 
 
 		 505 aa  401  9.999999999999999e-111  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0299872 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4104  diguanylate cyclase  44.85 
 
 		 505 aa  400  9.999999999999999e-111  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.340706 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3991  diguanylate cyclase  44.85 
 
 		 505 aa  400  9.999999999999999e-111  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.613369 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0638  diguanylate cyclase  44.77 
 
 		 524 aa  398  1e-109  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0484455 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1122  GGDEF domain-containing protein  41.86 
 
 		 506 aa  377  1e-103  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.014859  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1305  GGDEF domain protein  41.87 
 
 		 502 aa  372  1e-102  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.620212  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1125  GGDEF  42.27 
 
 		 509 aa  372  1e-102  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.394023  normal  0.376452 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4536  diguanylate cyclase  40.36 
 
 		 503 aa  374  1e-102  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.221207  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1755  diguanylate cyclase  41.24 
 
 		 499 aa  373  1e-102  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1346  GGDEF domain-containing protein  41.24 
 
 		 499 aa  373  1e-102  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0669442  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0250  GGDEF domain-containing protein  41.29 
 
 		 489 aa  373  1e-102  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.164767  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0390  GGDEF domain-containing protein  41.24 
 
 		 499 aa  373  1e-102  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.817676  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0984  GGDEF domain-containing protein  41.29 
 
 		 489 aa  371  1e-101  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.184695  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0315  GGDEF domain-containing protein  41.34 
 
 		 484 aa  371  1e-101  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.237701  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1840  putative transmembrane transcriptional sensor regulator  41.03 
 
 		 506 aa  371  1e-101  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0399375  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0175  diguanylate cyclase  39.21 
 
 		 516 aa  350  5e-95  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6958  diguanylate cyclase  41.58 
 
 		 502 aa  346  6e-94  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0518  diguanylate cyclase  39.83 
 
 		 506 aa  342  8e-93  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0868  GGDEF domain-containing protein  39.06 
 
 		 494 aa  340  4e-92  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.796056  normal  0.69001 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1127  GGDEF domain-containing protein  41.94 
 
 		 572 aa  340  5e-92  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00567617  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0766  diguanylate cyclase  38.67 
 
 		 501 aa  338  1.9999999999999998e-91  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00826  putative transmembrane protein  43.38 
 
 		 488 aa  337  3.9999999999999995e-91  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.61367  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2492  diguanylate cyclase  41.06 
 
 		 474 aa  336  5e-91  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.379327 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0546  diguanylate cyclase  40.08 
 
 		 499 aa  336  7e-91  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0832  diguanylate cyclase  41.39 
 
 		 496 aa  333  4e-90  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0821  diguanylate cyclase  40.55 
 
 		 496 aa  333  4e-90  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.605291  normal  0.227561 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4395  diguanylate cyclase  41.6 
 
 		 498 aa  333  5e-90  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6264  diguanylate cyclase  40.54 
 
 		 502 aa  333  5e-90  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.291677  normal  0.150603 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2715  diguanylate cyclase  41.06 
 
 		 508 aa  333  5e-90  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.271597  normal  0.533444 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6666  diguanylate cyclase  40.54 
 
 		 502 aa  333  6e-90  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6431  diguanylate cyclase  40.54 
 
 		 502 aa  333  6e-90  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0798  GGDEF domain-containing protein  40.75 
 
 		 496 aa  332  9e-90  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.412232  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2420  diguanylate cyclase  40.8 
 
 		 532 aa  327  3e-88  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.499921  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0954  diguanylate cyclase  38.83 
 
 		 502 aa  326  8.000000000000001e-88  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0641916  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0533  diguanylate cyclase  40.71 
 
 		 480 aa  324  3e-87  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6048  diguanylate cyclase  40.58 
 
 		 506 aa  321  1.9999999999999998e-86  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.423069 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1243  diguanylate cyclase  39.92 
 
 		 510 aa  320  3e-86  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.624606  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6345  diguanylate cyclase  40.58 
 
 		 506 aa  320  3.9999999999999996e-86  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.155718  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4666  diguanylate cyclase  38.74 
 
 		 501 aa  320  5e-86  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0421428  normal  0.479047 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5514  diguanylate cyclase  39.41 
 
 		 493 aa  318  1e-85  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.333875  normal  0.197216 
 
 
-
 
NC_003296  RS00828  putative transmembrane protein  38.93 
 
 		 512 aa  317  5e-85  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.33694  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5179  diguanylate cyclase  38.88 
 
 		 504 aa  316  5e-85  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.466605 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2597  diguanylate cyclase  41.9 
 
 		 506 aa  315  9.999999999999999e-85  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.938839 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0985  diguanylate cyclase  39.17 
 
 		 508 aa  307  3e-82  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5691  diguanylate cyclase  36.04 
 
 		 512 aa  281  2e-74  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2295  diguanylate cyclase  39.21 
 
 		 503 aa  274  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3174  diguanylate cyclase  37.12 
 
 		 530 aa  266  5.999999999999999e-70  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.258431  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3800  diguanylate cyclase  35.07 
 
 		 553 aa  263  8e-69  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.223141 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2297  diguanylate cyclase  34.63 
 
 		 533 aa  262  1e-68  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.777078  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02019  Putative signal protein with GGDEF domain  35.92 
 
 		 494 aa  262  1e-68  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3328  GGDEF  33.2 
 
 		 548 aa  259  1e-67  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00921167 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3068  diguanylate cyclase  33.64 
 
 		 516 aa  247  3e-64  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.608977 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2667  diguanylate cyclase  33.13 
 
 		 522 aa  238  1e-61  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.548675  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4491  diguanylate cyclase  37.86 
 
 		 531 aa  236  5.0000000000000005e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3172  diguanylate cyclase  34.84 
 
 		 518 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.211888 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3242  GGDEF domain-containing protein  33.06 
 
 		 522 aa  231  3e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.564089  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2519  diguanylate cyclase  32.32 
 
 		 522 aa  231  3e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.926429  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4321  diguanylate cyclase  32.26 
 
 		 534 aa  223  4e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1348  diguanylate cyclase  28.88 
 
 		 515 aa  219  1e-55  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2930  diguanylate cyclase  29.84 
 
 		 515 aa  213  7.999999999999999e-54  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.827018  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2281  GGDEF  34.52 
 
 		 555 aa  212  1e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000303682  normal  0.0271008 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2591  GGDEF domain protein  34.3 
 
 		 528 aa  207  4e-52  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.200767  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2785  diguanylate cyclase  32.43 
 
 		 519 aa  176  8e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1516  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  47.98 
 
 		 352 aa  169  8e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.0065858  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3973  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  50.3 
 
 		 362 aa  167  5e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.415221  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>