More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_1901 on replicon NC_008542
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010551  BamMC406_1025  diguanylate cyclase  84.69 
 
 
492 aa  858    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4503  diguanylate cyclase  85.51 
 
 
492 aa  844    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1901  diguanylate cyclase  100 
 
 
492 aa  998    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1598  diguanylate cyclase  79.88 
 
 
492 aa  813    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0273825  normal  0.888834 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1021  diguanylate cyclase  84.49 
 
 
492 aa  856    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0128107  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6178  diguanylate cyclase  100 
 
 
492 aa  998    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.837587  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1924  diguanylate cyclase  99.19 
 
 
492 aa  993    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.268801  normal  0.495061 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4045  diguanylate cyclase  84.08 
 
 
492 aa  830    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6347  diguanylate cyclase  65.22 
 
 
507 aa  653    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.197089 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4694  diguanylate cyclase  79.59 
 
 
492 aa  789    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3188  diguanylate cyclase  59.31 
 
 
529 aa  541  1e-153  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.210299 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4944  diguanylate cyclase  58.75 
 
 
520 aa  537  1e-151  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0582678 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5496  diguanylate cyclase  58.32 
 
 
520 aa  533  1e-150  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.414779  hitchhiker  0.000876281 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5670  diguanylate cyclase  57.79 
 
 
521 aa  527  1e-148  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0236259 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5189  diguanylate cyclase  57.79 
 
 
521 aa  527  1e-148  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0028  diguanylate cyclase  57.49 
 
 
527 aa  522  1e-147  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.789293 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4565  diguanylate cyclase  57.14 
 
 
521 aa  522  1e-147  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.267028  normal  0.0465187 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0410  diguanylate cyclase  51.67 
 
 
516 aa  498  1e-139  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5084  diguanylate cyclase  52.7 
 
 
503 aa  484  1e-135  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.494089  normal  0.0445442 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4297  diguanylate cyclase  49.79 
 
 
522 aa  482  1e-135  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0491288  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3807  diguanylate cyclase  52.16 
 
 
510 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.417307 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2397  diguanylate cyclase  51.62 
 
 
510 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3714  diguanylate cyclase  52.16 
 
 
510 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.28391  normal  0.0412955 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4649  diguanylate cyclase  52.16 
 
 
510 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5454  diguanylate cyclase  52.62 
 
 
510 aa  443  1e-123  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.488047  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0401  GGDEF domain-containing protein  47.33 
 
 
507 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3598  diguanylate cyclase  52.84 
 
 
510 aa  433  1e-120  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS04801  hypothetical protein  46.2 
 
 
505 aa  431  1e-119  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0299872 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0115  diguanylate cyclase  46.41 
 
 
487 aa  426  1e-118  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.418458  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0097  GGDEF domain-containing protein  46.41 
 
 
487 aa  426  1e-118  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1257  diguanylate cyclase  46.41 
 
 
487 aa  426  1e-118  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1077  GGDEF domain-containing protein  46.41 
 
 
528 aa  426  1e-118  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.918636  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2825  GGDEF domain-containing protein  46.61 
 
 
487 aa  427  1e-118  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.819973  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2678  diguanylate cyclase  47.31 
 
 
487 aa  427  1e-118  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1535  diguanylate cyclase  46.41 
 
 
487 aa  426  1e-118  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5012  diguanylate cyclase  49.07 
 
 
510 aa  420  1e-116  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3991  diguanylate cyclase  46.25 
 
 
505 aa  417  9.999999999999999e-116  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.613369 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4104  diguanylate cyclase  46.25 
 
 
505 aa  417  9.999999999999999e-116  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.340706 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1755  diguanylate cyclase  44.19 
 
 
499 aa  409  1e-113  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1346  GGDEF domain-containing protein  44.19 
 
 
499 aa  409  1e-113  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0669442  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0390  GGDEF domain-containing protein  44.19 
 
 
499 aa  409  1e-113  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.817676  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0250  GGDEF domain-containing protein  44.19 
 
 
489 aa  409  1e-113  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.164767  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1840  putative transmembrane transcriptional sensor regulator  44.19 
 
 
506 aa  410  1e-113  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0399375  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0984  GGDEF domain-containing protein  44.19 
 
 
489 aa  408  1.0000000000000001e-112  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.184695  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0315  GGDEF domain-containing protein  44.07 
 
 
484 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.237701  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1122  GGDEF domain-containing protein  43.92 
 
 
506 aa  404  1e-111  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.014859  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0638  diguanylate cyclase  43.54 
 
 
524 aa  395  1e-108  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0484455 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0175  diguanylate cyclase  43.61 
 
 
516 aa  388  1e-106  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2715  diguanylate cyclase  43.69 
 
 
508 aa  376  1e-103  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.271597  normal  0.533444 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2492  diguanylate cyclase  44.52 
 
 
474 aa  374  1e-102  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.379327 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0518  diguanylate cyclase  43.58 
 
 
506 aa  373  1e-102  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2420  diguanylate cyclase  43.7 
 
 
532 aa  374  1e-102  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.499921  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2597  diguanylate cyclase  45.67 
 
 
506 aa  366  1e-100  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.938839 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1243  diguanylate cyclase  43.64 
 
 
510 aa  368  1e-100  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.624606  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS00826  putative transmembrane protein  44.83 
 
 
488 aa  364  2e-99  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.61367  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1125  GGDEF  42.33 
 
 
509 aa  360  3e-98  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.394023  normal  0.376452 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1305  GGDEF domain protein  41.44 
 
 
502 aa  359  5e-98  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.620212  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4666  diguanylate cyclase  40.55 
 
 
501 aa  359  6e-98  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0421428  normal  0.479047 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4536  diguanylate cyclase  38.88 
 
 
503 aa  358  1.9999999999999998e-97  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.221207  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0766  diguanylate cyclase  38.41 
 
 
501 aa  352  1e-95  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5179  diguanylate cyclase  40.79 
 
 
504 aa  351  2e-95  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.466605 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6958  diguanylate cyclase  39.39 
 
 
502 aa  347  4e-94  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4395  diguanylate cyclase  42.15 
 
 
498 aa  344  2e-93  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5514  diguanylate cyclase  39.92 
 
 
493 aa  344  2e-93  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.333875  normal  0.197216 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0868  GGDEF domain-containing protein  39.38 
 
 
494 aa  340  4e-92  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.796056  normal  0.69001 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0546  diguanylate cyclase  39.96 
 
 
499 aa  339  5.9999999999999996e-92  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0821  diguanylate cyclase  42.06 
 
 
496 aa  336  5.999999999999999e-91  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.605291  normal  0.227561 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0954  diguanylate cyclase  39.42 
 
 
502 aa  335  9e-91  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0641916  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0798  GGDEF domain-containing protein  42.06 
 
 
496 aa  334  3e-90  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.412232  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0832  diguanylate cyclase  42.36 
 
 
496 aa  333  6e-90  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1127  GGDEF domain-containing protein  40.62 
 
 
572 aa  332  7.000000000000001e-90  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00567617  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6666  diguanylate cyclase  40.08 
 
 
502 aa  332  7.000000000000001e-90  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6431  diguanylate cyclase  40.08 
 
 
502 aa  332  7.000000000000001e-90  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6264  diguanylate cyclase  39.96 
 
 
502 aa  330  4e-89  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.291677  normal  0.150603 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0533  diguanylate cyclase  41.28 
 
 
480 aa  330  4e-89  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0985  diguanylate cyclase  37.96 
 
 
508 aa  330  5.0000000000000004e-89  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00828  putative transmembrane protein  39.67 
 
 
512 aa  327  3e-88  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.33694  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6345  diguanylate cyclase  39.25 
 
 
506 aa  317  2e-85  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.155718  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6048  diguanylate cyclase  39.25 
 
 
506 aa  316  6e-85  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.423069 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3174  diguanylate cyclase  38.55 
 
 
530 aa  286  5e-76  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.258431  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5691  diguanylate cyclase  35.96 
 
 
512 aa  282  7.000000000000001e-75  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3328  GGDEF  32.85 
 
 
548 aa  268  2e-70  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00921167 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4491  diguanylate cyclase  34.82 
 
 
531 aa  266  5e-70  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2295  diguanylate cyclase  35.41 
 
 
503 aa  265  1e-69  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4321  diguanylate cyclase  32.09 
 
 
534 aa  259  7e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3800  diguanylate cyclase  34.01 
 
 
553 aa  256  5e-67  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.223141 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3172  diguanylate cyclase  36.04 
 
 
518 aa  255  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.211888 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3068  diguanylate cyclase  33.2 
 
 
516 aa  254  2.0000000000000002e-66  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.608977 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2297  diguanylate cyclase  33 
 
 
533 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.777078  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02019  Putative signal protein with GGDEF domain  34.03 
 
 
494 aa  252  1e-65  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2281  GGDEF  33.07 
 
 
555 aa  245  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000303682  normal  0.0271008 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2667  diguanylate cyclase  36.2 
 
 
522 aa  244  3.9999999999999997e-63  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.548675  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2591  GGDEF domain protein  31.85 
 
 
528 aa  236  7e-61  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.200767  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2519  diguanylate cyclase  35.71 
 
 
522 aa  226  7e-58  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.926429  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3242  GGDEF domain-containing protein  36.22 
 
 
522 aa  226  8e-58  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.564089  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2930  diguanylate cyclase  31.08 
 
 
515 aa  219  7e-56  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.827018  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1348  diguanylate cyclase  28.78 
 
 
515 aa  213  9e-54  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1597  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  52.94 
 
 
313 aa  182  1e-44  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2096  diguanylate cyclase with GAF sensor  51.74 
 
 
664 aa  181  2e-44  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.76184 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3250  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  33.14 
 
 
768 aa  177  4e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>