More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_0518 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_1243  diguanylate cyclase  67.75 
 
 		 510 aa  637    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.624606  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0518  diguanylate cyclase  100 
 
 		 506 aa  994    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2420  diguanylate cyclase  66.46 
 
 		 532 aa  649    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.499921  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2597  diguanylate cyclase  69.52 
 
 		 506 aa  659    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.938839 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0175  diguanylate cyclase  84.65 
 
 		 516 aa  840    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2715  diguanylate cyclase  64.89 
 
 		 508 aa  634  1e-180  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.271597  normal  0.533444 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2492  diguanylate cyclase  65.61 
 
 		 474 aa  626  1e-178  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.379327 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0410  diguanylate cyclase  42.97 
 
 		 516 aa  402  9.999999999999999e-111  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4297  diguanylate cyclase  42.51 
 
 		 522 aa  396  1e-109  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0491288  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS04801  hypothetical protein  43.67 
 
 		 505 aa  385  1e-106  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0299872 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4104  diguanylate cyclase  44.69 
 
 		 505 aa  384  1e-105  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.340706 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3991  diguanylate cyclase  44.69 
 
 		 505 aa  384  1e-105  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.613369 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1025  diguanylate cyclase  44.03 
 
 		 492 aa  383  1e-105  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1021  diguanylate cyclase  43.83 
 
 		 492 aa  380  1e-104  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0128107  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1924  diguanylate cyclase  43.37 
 
 		 492 aa  375  1e-102  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.268801  normal  0.495061 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1901  diguanylate cyclase  43.58 
 
 		 492 aa  373  1e-102  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2397  diguanylate cyclase  41.8 
 
 		 510 aa  373  1e-102  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6178  diguanylate cyclase  43.58 
 
 		 492 aa  373  1e-102  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.837587  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5454  diguanylate cyclase  42.86 
 
 		 510 aa  372  1e-102  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.488047  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3807  diguanylate cyclase  42.92 
 
 		 510 aa  372  1e-101  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.417307 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3714  diguanylate cyclase  42.65 
 
 		 510 aa  372  1e-101  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.28391  normal  0.0412955 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4649  diguanylate cyclase  42.65 
 
 		 510 aa  372  1e-101  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4694  diguanylate cyclase  44.07 
 
 		 492 aa  372  1e-101  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4503  diguanylate cyclase  42.56 
 
 		 492 aa  364  2e-99  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3598  diguanylate cyclase  42.24 
 
 		 510 aa  365  2e-99  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5012  diguanylate cyclase  44.33 
 
 		 510 aa  362  1e-98  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4045  diguanylate cyclase  42.56 
 
 		 492 aa  362  1e-98  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1598  diguanylate cyclase  41.68 
 
 		 492 aa  357  2.9999999999999997e-97  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0273825  normal  0.888834 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5084  diguanylate cyclase  44.03 
 
 		 503 aa  355  1e-96  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.494089  normal  0.0445442 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6347  diguanylate cyclase  42.24 
 
 		 507 aa  353  2.9999999999999997e-96  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.197089 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1125  GGDEF  40.64 
 
 		 509 aa  350  3e-95  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.394023  normal  0.376452 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1077  GGDEF domain-containing protein  41.63 
 
 		 528 aa  349  5e-95  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.918636  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2678  diguanylate cyclase  42.59 
 
 		 487 aa  348  2e-94  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0097  GGDEF domain-containing protein  42.62 
 
 		 487 aa  347  3e-94  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1535  diguanylate cyclase  42.62 
 
 		 487 aa  347  3e-94  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0115  diguanylate cyclase  42.62 
 
 		 487 aa  347  3e-94  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.418458  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1257  diguanylate cyclase  42.62 
 
 		 487 aa  347  3e-94  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4666  diguanylate cyclase  40.13 
 
 		 501 aa  347  4e-94  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0421428  normal  0.479047 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2825  GGDEF domain-containing protein  42.42 
 
 		 487 aa  345  8e-94  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.819973  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0401  GGDEF domain-containing protein  41.39 
 
 		 507 aa  345  1e-93  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5496  diguanylate cyclase  41.39 
 
 		 520 aa  342  5.999999999999999e-93  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.414779  hitchhiker  0.000876281 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4944  diguanylate cyclase  41.39 
 
 		 520 aa  339  5.9999999999999996e-92  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0582678 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0028  diguanylate cyclase  41.91 
 
 		 527 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.789293 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0638  diguanylate cyclase  43.28 
 
 		 524 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0484455 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3188  diguanylate cyclase  41.61 
 
 		 529 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.210299 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5670  diguanylate cyclase  41.24 
 
 		 521 aa  337  2.9999999999999997e-91  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0236259 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5189  diguanylate cyclase  41.24 
 
 		 521 aa  337  2.9999999999999997e-91  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4565  diguanylate cyclase  40.58 
 
 		 521 aa  332  1e-89  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.267028  normal  0.0465187 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1305  GGDEF domain protein  40.29 
 
 		 502 aa  331  2e-89  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.620212  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00826  putative transmembrane protein  40.09 
 
 		 488 aa  330  4e-89  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.61367  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0985  diguanylate cyclase  38.87 
 
 		 508 aa  327  3e-88  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6958  diguanylate cyclase  41 
 
 		 502 aa  323  7e-87  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4536  diguanylate cyclase  38.59 
 
 		 503 aa  315  9.999999999999999e-85  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.221207  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0868  GGDEF domain-containing protein  39.58 
 
 		 494 aa  315  1.9999999999999998e-84  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.796056  normal  0.69001 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3174  diguanylate cyclase  41.48 
 
 		 530 aa  314  2.9999999999999996e-84  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.258431  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00828  putative transmembrane protein  38.82 
 
 		 512 aa  312  6.999999999999999e-84  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.33694  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1840  putative transmembrane transcriptional sensor regulator  39.08 
 
 		 506 aa  312  6.999999999999999e-84  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0399375  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1346  GGDEF domain-containing protein  39.08 
 
 		 499 aa  311  2e-83  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0669442  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5179  diguanylate cyclase  40.08 
 
 		 504 aa  311  2e-83  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.466605 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0390  GGDEF domain-containing protein  39.08 
 
 		 499 aa  311  2e-83  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.817676  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1755  diguanylate cyclase  39.08 
 
 		 499 aa  311  2e-83  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0250  GGDEF domain-containing protein  39.08 
 
 		 489 aa  311  2e-83  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.164767  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0315  GGDEF domain-containing protein  39.08 
 
 		 484 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.237701  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0984  GGDEF domain-containing protein  39.08 
 
 		 489 aa  310  4e-83  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.184695  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4395  diguanylate cyclase  40.42 
 
 		 498 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0798  GGDEF domain-containing protein  41.53 
 
 		 496 aa  308  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.412232  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0821  diguanylate cyclase  41.26 
 
 		 496 aa  306  4.0000000000000004e-82  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.605291  normal  0.227561 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0832  diguanylate cyclase  42.11 
 
 		 496 aa  304  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0954  diguanylate cyclase  38.65 
 
 		 502 aa  301  2e-80  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0641916  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0766  diguanylate cyclase  36.92 
 
 		 501 aa  297  3e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1122  GGDEF domain-containing protein  38.03 
 
 		 506 aa  291  2e-77  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.014859  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0546  diguanylate cyclase  39.96 
 
 		 499 aa  290  3e-77  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0533  diguanylate cyclase  39.61 
 
 		 480 aa  280  5e-74  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6666  diguanylate cyclase  37.34 
 
 		 502 aa  273  5.000000000000001e-72  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6431  diguanylate cyclase  37.34 
 
 		 502 aa  273  5.000000000000001e-72  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6264  diguanylate cyclase  36.74 
 
 		 502 aa  271  1e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.291677  normal  0.150603 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1127  GGDEF domain-containing protein  38.78 
 
 		 572 aa  267  2.9999999999999995e-70  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00567617  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6345  diguanylate cyclase  36.34 
 
 		 506 aa  264  3e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.155718  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6048  diguanylate cyclase  36.13 
 
 		 506 aa  260  4e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.423069 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5514  diguanylate cyclase  36.38 
 
 		 493 aa  260  5.0000000000000005e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.333875  normal  0.197216 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2297  diguanylate cyclase  32.7 
 
 		 533 aa  258  2e-67  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.777078  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3068  diguanylate cyclase  31.76 
 
 		 516 aa  254  3e-66  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.608977 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2295  diguanylate cyclase  37.16 
 
 		 503 aa  253  6e-66  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5691  diguanylate cyclase  32.86 
 
 		 512 aa  248  2e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3800  diguanylate cyclase  32.98 
 
 		 553 aa  246  4.9999999999999997e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.223141 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2519  diguanylate cyclase  34.36 
 
 		 522 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.926429  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3242  GGDEF domain-containing protein  34.77 
 
 		 522 aa  243  5e-63  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.564089  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2667  diguanylate cyclase  33.26 
 
 		 522 aa  240  4e-62  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.548675  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02019  Putative signal protein with GGDEF domain  33.47 
 
 		 494 aa  238  2e-61  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4491  diguanylate cyclase  37.53 
 
 		 531 aa  231  3e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1348  diguanylate cyclase  30.91 
 
 		 515 aa  228  1e-58  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2930  diguanylate cyclase  30.6 
 
 		 515 aa  223  7e-57  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.827018  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4321  diguanylate cyclase  32.21 
 
 		 534 aa  220  5e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3328  GGDEF  32.46 
 
 		 548 aa  219  7e-56  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00921167 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3172  diguanylate cyclase  36.63 
 
 		 518 aa  219  8.999999999999998e-56  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.211888 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2281  GGDEF  32.94 
 
 		 555 aa  209  1e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000303682  normal  0.0271008 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2591  GGDEF domain protein  31.61 
 
 		 528 aa  198  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.200767  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3250  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  38.31 
 
 		 768 aa  197  5.000000000000001e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2785  diguanylate cyclase  31.34 
 
 		 519 aa  193  5e-48  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1149  diguanylate cyclase  33.33 
 
 		 495 aa  160  5e-38  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>