More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_6666 on replicon NC_008544
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010512  Bcenmc03_6264  diguanylate cyclase  99.2 
 
 		 502 aa  1015    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.291677  normal  0.150603 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6666  diguanylate cyclase  100 
 
 		 502 aa  1021    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6048  diguanylate cyclase  83.07 
 
 		 506 aa  847    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.423069 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6431  diguanylate cyclase  100 
 
 		 502 aa  1021    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5514  diguanylate cyclase  63.97 
 
 		 493 aa  639    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.333875  normal  0.197216 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6345  diguanylate cyclase  83.9 
 
 		 506 aa  847    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.155718  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0546  diguanylate cyclase  63.04 
 
 		 499 aa  611  9.999999999999999e-175  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5179  diguanylate cyclase  60.32 
 
 		 504 aa  582  1.0000000000000001e-165  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.466605 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0533  diguanylate cyclase  63.94 
 
 		 480 aa  573  1.0000000000000001e-162  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1127  GGDEF domain-containing protein  57.64 
 
 		 572 aa  549  1e-155  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00567617  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0638  diguanylate cyclase  46 
 
 		 524 aa  395  1e-108  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0484455 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4694  diguanylate cyclase  40.95 
 
 		 492 aa  339  5.9999999999999996e-92  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1924  diguanylate cyclase  40.08 
 
 		 492 aa  335  1e-90  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.268801  normal  0.495061 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6178  diguanylate cyclase  40.08 
 
 		 492 aa  332  7.000000000000001e-90  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.837587  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1901  diguanylate cyclase  40.08 
 
 		 492 aa  332  7.000000000000001e-90  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1025  diguanylate cyclase  39.05 
 
 		 492 aa  325  9e-88  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4565  diguanylate cyclase  41.27 
 
 		 521 aa  323  6e-87  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.267028  normal  0.0465187 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1021  diguanylate cyclase  38.84 
 
 		 492 aa  322  9.999999999999999e-87  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0128107  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5670  diguanylate cyclase  41.05 
 
 		 521 aa  321  1.9999999999999998e-86  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0236259 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5189  diguanylate cyclase  41.05 
 
 		 521 aa  321  1.9999999999999998e-86  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1598  diguanylate cyclase  37.53 
 
 		 492 aa  320  3.9999999999999996e-86  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0273825  normal  0.888834 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3188  diguanylate cyclase  40.91 
 
 		 529 aa  320  5e-86  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.210299 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4944  diguanylate cyclase  40.9 
 
 		 520 aa  318  1e-85  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0582678 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5496  diguanylate cyclase  40.6 
 
 		 520 aa  317  2e-85  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.414779  hitchhiker  0.000876281 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4503  diguanylate cyclase  38.48 
 
 		 492 aa  314  2.9999999999999996e-84  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4045  diguanylate cyclase  38.27 
 
 		 492 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0028  diguanylate cyclase  41.31 
 
 		 527 aa  311  1e-83  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.789293 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6347  diguanylate cyclase  39.21 
 
 		 507 aa  310  5e-83  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.197089 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0410  diguanylate cyclase  38.64 
 
 		 516 aa  310  5.9999999999999995e-83  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5084  diguanylate cyclase  39.67 
 
 		 503 aa  307  3e-82  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.494089  normal  0.0445442 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3807  diguanylate cyclase  41.74 
 
 		 510 aa  301  1e-80  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.417307 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2397  diguanylate cyclase  41.03 
 
 		 510 aa  301  2e-80  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4649  diguanylate cyclase  41.53 
 
 		 510 aa  301  2e-80  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3714  diguanylate cyclase  41.53 
 
 		 510 aa  301  2e-80  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.28391  normal  0.0412955 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4104  diguanylate cyclase  38.88 
 
 		 505 aa  291  2e-77  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.340706 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3991  diguanylate cyclase  38.88 
 
 		 505 aa  291  2e-77  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.613369 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5454  diguanylate cyclase  40.5 
 
 		 510 aa  290  5.0000000000000004e-77  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.488047  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5012  diguanylate cyclase  41.08 
 
 		 510 aa  289  7e-77  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1125  GGDEF  38.84 
 
 		 509 aa  288  1e-76  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.394023  normal  0.376452 
 
 
-
 
NC_003296  RS00826  putative transmembrane protein  40.04 
 
 		 488 aa  288  2e-76  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.61367  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1305  GGDEF domain protein  37.71 
 
 		 502 aa  287  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.620212  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1122  GGDEF domain-containing protein  39.11 
 
 		 506 aa  287  4e-76  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.014859  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2825  GGDEF domain-containing protein  37.81 
 
 		 487 aa  286  7e-76  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.819973  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS04801  hypothetical protein  38.02 
 
 		 505 aa  285  1.0000000000000001e-75  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0299872 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2678  diguanylate cyclase  37.6 
 
 		 487 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0097  GGDEF domain-containing protein  37.6 
 
 		 487 aa  285  2.0000000000000002e-75  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1077  GGDEF domain-containing protein  37.6 
 
 		 528 aa  285  2.0000000000000002e-75  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.918636  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1535  diguanylate cyclase  37.6 
 
 		 487 aa  285  2.0000000000000002e-75  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0115  diguanylate cyclase  37.6 
 
 		 487 aa  285  2.0000000000000002e-75  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.418458  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1257  diguanylate cyclase  37.6 
 
 		 487 aa  285  2.0000000000000002e-75  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0401  GGDEF domain-containing protein  38.49 
 
 		 507 aa  283  4.0000000000000003e-75  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4297  diguanylate cyclase  37.27 
 
 		 522 aa  283  4.0000000000000003e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0491288  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0250  GGDEF domain-containing protein  38.4 
 
 		 489 aa  283  6.000000000000001e-75  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.164767  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1346  GGDEF domain-containing protein  38.4 
 
 		 499 aa  282  8.000000000000001e-75  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0669442  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0390  GGDEF domain-containing protein  38.4 
 
 		 499 aa  282  8.000000000000001e-75  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.817676  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1755  diguanylate cyclase  38.4 
 
 		 499 aa  282  8.000000000000001e-75  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0984  GGDEF domain-containing protein  38.4 
 
 		 489 aa  281  1e-74  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.184695  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0315  GGDEF domain-containing protein  38.7 
 
 		 484 aa  282  1e-74  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.237701  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1840  putative transmembrane transcriptional sensor regulator  38.19 
 
 		 506 aa  281  3e-74  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0399375  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0175  diguanylate cyclase  36.34 
 
 		 516 aa  280  6e-74  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3598  diguanylate cyclase  39.88 
 
 		 510 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4666  diguanylate cyclase  38.74 
 
 		 501 aa  275  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0421428  normal  0.479047 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0518  diguanylate cyclase  37.34 
 
 		 506 aa  273  5.000000000000001e-72  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2420  diguanylate cyclase  38.76 
 
 		 532 aa  268  2e-70  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.499921  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4395  diguanylate cyclase  37.47 
 
 		 498 aa  265  1e-69  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2492  diguanylate cyclase  35.5 
 
 		 474 aa  263  4.999999999999999e-69  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.379327 
 
 
-
 
NC_003296  RS00828  putative transmembrane protein  36.84 
 
 		 512 aa  263  6e-69  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.33694  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2715  diguanylate cyclase  36.13 
 
 		 508 aa  261  3e-68  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.271597  normal  0.533444 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0798  GGDEF domain-containing protein  37.09 
 
 		 496 aa  258  2e-67  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.412232  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0832  diguanylate cyclase  37.81 
 
 		 496 aa  257  4e-67  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0821  diguanylate cyclase  36.68 
 
 		 496 aa  255  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.605291  normal  0.227561 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0985  diguanylate cyclase  35.46 
 
 		 508 aa  254  4.0000000000000004e-66  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1243  diguanylate cyclase  35.86 
 
 		 510 aa  247  4e-64  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.624606  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6958  diguanylate cyclase  35.48 
 
 		 502 aa  244  3.9999999999999997e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2597  diguanylate cyclase  36.04 
 
 		 506 aa  237  3e-61  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.938839 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4536  diguanylate cyclase  33.61 
 
 		 503 aa  229  7e-59  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.221207  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0954  diguanylate cyclase  32.98 
 
 		 502 aa  222  9.999999999999999e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0641916  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0766  diguanylate cyclase  32.85 
 
 		 501 aa  222  9.999999999999999e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0868  GGDEF domain-containing protein  33.61 
 
 		 494 aa  219  1e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.796056  normal  0.69001 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2297  diguanylate cyclase  32.02 
 
 		 533 aa  203  6e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.777078  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02019  Putative signal protein with GGDEF domain  33.2 
 
 		 494 aa  202  1.9999999999999998e-50  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3328  GGDEF  30.6 
 
 		 548 aa  200  5e-50  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00921167 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5691  diguanylate cyclase  30.42 
 
 		 512 aa  200  6e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3800  diguanylate cyclase  29.64 
 
 		 553 aa  197  5.000000000000001e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.223141 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4491  diguanylate cyclase  30.52 
 
 		 531 aa  191  2e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3068  diguanylate cyclase  29.37 
 
 		 516 aa  188  2e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.608977 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2295  diguanylate cyclase  29.96 
 
 		 503 aa  181  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2281  GGDEF  29.71 
 
 		 555 aa  177  3e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000303682  normal  0.0271008 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4321  diguanylate cyclase  31.37 
 
 		 534 aa  176  9.999999999999999e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2591  GGDEF domain protein  30.33 
 
 		 528 aa  173  5e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.200767  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1348  diguanylate cyclase  28.26 
 
 		 515 aa  173  7.999999999999999e-42  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2667  diguanylate cyclase  29.02 
 
 		 522 aa  169  1e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.548675  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3174  diguanylate cyclase  32.34 
 
 		 530 aa  168  2e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.258431  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2519  diguanylate cyclase  29.18 
 
 		 522 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.926429  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3242  GGDEF domain-containing protein  32.8 
 
 		 522 aa  166  6.9999999999999995e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.564089  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3172  diguanylate cyclase  30.16 
 
 		 518 aa  166  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.211888 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2930  diguanylate cyclase  30.21 
 
 		 515 aa  163  6e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.827018  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1471  diguanylate cyclase  48.5 
 
 		 339 aa  154  4e-36  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.435801  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0519  diguanylate cyclase  41.18 
 
 		 631 aa  144  4e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.447681 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5389  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  47.67 
 
 		 372 aa  143  6e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>