21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_1322 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_1322  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 627 aa  1234    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.993956  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2961  Tetratricopeptide domain protein  88.07 
 
 		 635 aa  1008    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.445649 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2071  TPR repeat-containing protein  61 
 
 		 757 aa  252  1e-65  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1698  TPR domain-containing protein  51.52 
 
 		 626 aa  215  1.9999999999999998e-54  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1635  TPR repeat-containing protein  47 
 
 		 665 aa  203  8e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0192476  normal  0.892457 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0646  TPR repeat-containing protein  48.23 
 
 		 611 aa  195  3e-48  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0665559  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1260  TPR repeat-containing protein  46.46 
 
 		 616 aa  167  4e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.126899  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1302  TPR domain-containing protein  40.83 
 
 		 846 aa  145  2e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0258  TPR repeat-containing protein  39.9 
 
 		 974 aa  142  1.9999999999999998e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0685  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.16 
 
 		 883 aa  114  7.000000000000001e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0651  TPR repeat-containing protein  34.16 
 
 		 878 aa  111  4.0000000000000004e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.10746  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0696  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 893 aa  110  7.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4380  TPR repeat-containing protein  31.79 
 
 		 900 aa  108  3e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2406  tetratricopeptide TPR_2  24.04 
 
 		 436 aa  50.1  0.0001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4803  tetratricopeptide TPR_3  28.7 
 
 		 340 aa  48.9  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1146  TPR repeat-containing protein  26.14 
 
 		 1091 aa  48.1  0.0005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000383652 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  21.53 
 
 		 1737 aa  46.2  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3295  TPR repeat-containing protein  27.43 
 
 		 311 aa  45.1  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1443  hypothetical protein  25.64 
 
 		 460 aa  44.7  0.006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.113493  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1501  TPR repeat-containing protein  25 
 
 		 629 aa  43.9  0.01  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.961258  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1780  hypothetical protein  36.76 
 
 		 443 aa  43.9  0.01  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>