18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amuc_1443 on replicon NC_010655
Organism: Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010655  Amuc_1443  hypothetical protein  100 
 
 		 460 aa  955    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.113493  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0675  Tetratricopeptide domain protein  25.55 
 
 		 464 aa  125  1e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.682908  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1302  TPR domain-containing protein  27.03 
 
 		 846 aa  62.4  0.00000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0646  TPR repeat-containing protein  30.58 
 
 		 611 aa  59.3  0.0000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0665559  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3595  hypothetical protein  26.18 
 
 		 214 aa  53.9  0.000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4380  TPR repeat-containing protein  31.15 
 
 		 900 aa  53.1  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2961  Tetratricopeptide domain protein  27.35 
 
 		 635 aa  50.8  0.00005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.445649 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1260  TPR repeat-containing protein  27.27 
 
 		 616 aa  47.4  0.0006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.126899  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0122  TPR repeat-containing protein  22.82 
 
 		 660 aa  46.6  0.0009  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.142603  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1872  TPR repeat-containing protein  26.17 
 
 		 594 aa  46.2  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0261679  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  27.18 
 
 		 4079 aa  45.8  0.002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0927  TPR repeat-containing protein  28.81 
 
 		 291 aa  45.1  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1322  TPR repeat-containing protein  25.64 
 
 		 627 aa  44.7  0.004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.993956  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0732  TPR repeat-containing protein  28.93 
 
 		 235 aa  44.7  0.004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0097  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  23.71 
 
 		 329 aa  44.7  0.004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000120969  n/a   
 
 
-
 
NC_009047  PICST_63396  predicted protein  27.5 
 
 		 551 aa  43.9  0.006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.28283 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0632  tetratricopeptide TPR_2  27.45 
 
 		 541 aa  43.5  0.008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.598018  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  21.31 
 
 		 1737 aa  43.5  0.009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>