242 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_0632 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008025  Dgeo_0632  tetratricopeptide TPR_2  100 
 
 		 541 aa  1035    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.598018  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1499  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  36.03 
 
 		 494 aa  195  2e-48  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0444923 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0396  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  35.48 
 
 		 479 aa  194  3e-48  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000000170755  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  27.29 
 
 		 878 aa  99  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  28.54 
 
 		 810 aa  93.2  1e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2383  TPR repeat-containing protein  21.85 
 
 		 1421 aa  84  0.000000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.823331 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  23.35 
 
 		 1737 aa  80.1  0.0000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1633  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.28 
 
 		 358 aa  76.3  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.000383939  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2367  TPR repeat-containing protein  24.86 
 
 		 860 aa  74.3  0.000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  22.86 
 
 		 927 aa  72.8  0.00000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1987  TPR domain-containing protein  26.77 
 
 		 864 aa  71.6  0.00000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.944233  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28691  hypothetical protein  29.63 
 
 		 306 aa  69.3  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1312  TPR repeat-containing protein  25.74 
 
 		 1069 aa  68.2  0.0000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.530092  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5131  TPR repeat-containing protein  25.42 
 
 		 361 aa  67.4  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000131061 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2491  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.53 
 
 		 689 aa  65.9  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2322  TPR repeat-containing protein  27.08 
 
 		 935 aa  65.9  0.000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0205826 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2349  TPR repeat-containing protein  26.33 
 
 		 649 aa  65.5  0.000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0186841  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  24.65 
 
 		 4079 aa  64.3  0.000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3643  TPR domain-containing protein  21.94 
 
 		 1979 aa  63.9  0.000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2853  TPR repeat-containing protein  23.36 
 
 		 3172 aa  63.9  0.000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2981  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.91 
 
 		 383 aa  63.5  0.000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000586322  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0461  TPR repeat-containing protein  38.89 
 
 		 627 aa  63.5  0.000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.999909  normal  0.380381 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1449  tetratricopeptide TPR_2  27.06 
 
 		 1067 aa  63.2  0.00000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2606  tetratricopeptide TPR_2  23.44 
 
 		 643 aa  63.2  0.00000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2471  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.89 
 
 		 406 aa  63.2  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0400427  normal  0.45906 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3643  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.89 
 
 		 406 aa  63.2  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0195  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 931 aa  62  0.00000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28481  hypothetical protein  20.23 
 
 		 462 aa  61.2  0.00000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0917  TPR repeat-containing protein  26.58 
 
 		 566 aa  61.2  0.00000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00563549 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0087  TPR repeat-containing protein  23.61 
 
 		 366 aa  60.5  0.00000007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1582  TPR repeat-containing protein  27.5 
 
 		 767 aa  59.7  0.0000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000189935  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3996  tetratricopeptide TPR_2  26.78 
 
 		 1694 aa  59.7  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.271204  normal  0.601264 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2405  hypothetical protein  25.31 
 
 		 577 aa  58.9  0.0000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3073  TPR repeat-containing protein  25.84 
 
 		 886 aa  58.9  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3831  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.4 
 
 		 1034 aa  58.9  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0133068 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  22.43 
 
 		 632 aa  58.5  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1767  PEP-CTERM system TPR-repeat lipoprotein  25.78 
 
 		 882 aa  58.5  0.0000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3216  TPR repeat-containing protein  23.39 
 
 		 643 aa  58.9  0.0000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000674385  hitchhiker  0.00000466075 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2707  glycosyl transferase family protein  20.7 
 
 		 1486 aa  58.9  0.0000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.228337 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24101  hypothetical protein  26.47 
 
 		 725 aa  58.5  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2478  TPR repeat-containing protein  23.55 
 
 		 884 aa  58.5  0.0000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.599046  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2549  hypothetical protein  25 
 
 		 577 aa  58.2  0.0000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3295  TPR repeat-containing protein  28.7 
 
 		 311 aa  57.8  0.0000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3120  TPR repeat-containing protein  27.15 
 
 		 767 aa  58.2  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4492  TPR repeat-containing protein  25.87 
 
 		 605 aa  57.8  0.0000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2431  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  24.79 
 
 		 818 aa  57  0.0000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2023  TPR domain-containing protein  27.34 
 
 		 369 aa  56.6  0.000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000313787  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1812  TPR repeat-containing protein  35.78 
 
 		 189 aa  56.6  0.000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  24.94 
 
 		 1276 aa  56.2  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0691  PEP-CTERM system TPR-repeat lipoprotein  25.21 
 
 		 883 aa  56.2  0.000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.953113 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0122  glycosyl transferase, group 1  24.73 
 
 		 3301 aa  56.2  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.326818 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2224  PEP-CTERM system TPR-repeat lipoprotein  23.86 
 
 		 884 aa  55.5  0.000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0200  TPR repeat-containing protein  25 
 
 		 505 aa  55.5  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1746  TPR repeat-containing protein  29.35 
 
 		 404 aa  55.5  0.000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4774  TPR repeat-containing protein  27.27 
 
 		 371 aa  56.2  0.000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.300856  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2862  TPR repeat-containing protein  23.67 
 
 		 448 aa  55.5  0.000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.375816 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28501  hypothetical protein  21.28 
 
 		 706 aa  54.7  0.000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0215  TPR repeat-containing protein  29.08 
 
 		 2262 aa  54.7  0.000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0297822 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1125  TPR domain-containing protein  28.02 
 
 		 457 aa  54.3  0.000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00731  hypothetical protein  24.26 
 
 		 816 aa  54.3  0.000005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.456129 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1232  TPR repeat-containing protein  24.69 
 
 		 750 aa  54.3  0.000005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.967237  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4726  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  26.97 
 
 		 730 aa  54.3  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3466  TPR repeat-containing protein  28.76 
 
 		 374 aa  54.3  0.000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0738  TPR repeat-containing protein  23.69 
 
 		 323 aa  54.3  0.000006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  hitchhiker  0.00630781  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1093  TPR repeat-containing protein  21.8 
 
 		 681 aa  54.3  0.000006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.353622  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0641  TPR repeat-containing protein  26.8 
 
 		 1094 aa  54.3  0.000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.230386  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0436  tetratricopeptide TPR_2  21.54 
 
 		 1056 aa  54.3  0.000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1094  TPR repeat-containing protein  24.17 
 
 		 685 aa  53.9  0.000007  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1062  TPR repeat-containing protein  35.8 
 
 		 503 aa  53.9  0.000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0498001 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2875  TPR repeat-containing protein  39.76 
 
 		 649 aa  53.9  0.000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0232  TPR repeat-containing protein  39.76 
 
 		 649 aa  53.9  0.000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1653  TPR repeat-containing protein  22.38 
 
 		 466 aa  52.8  0.00001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1000  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.19 
 
 		 219 aa  52.8  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.810235  normal  0.0608831 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1499  TPR repeat-containing protein  22.57 
 
 		 486 aa  53.1  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.329638 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0516  TPR repeat-containing protein  25.88 
 
 		 673 aa  53.5  0.00001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000776603  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4803  tetratricopeptide TPR_3  30.41 
 
 		 340 aa  52.8  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6170  hypothetical protein  28.51 
 
 		 612 aa  52  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.198655 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2562  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.1 
 
 		 364 aa  52.4  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1947  tetratricopeptide TPR_2  26.82 
 
 		 564 aa  52  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0106408 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4782  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  20.86 
 
 		 746 aa  52.4  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.20458 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1636  TPR repeat-containing protein  31.35 
 
 		 968 aa  52.4  0.00002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.992619 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1178  TPR repeat-containing protein  27.61 
 
 		 280 aa  51.6  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1506  tetratricopeptide TPR_4  26.29 
 
 		 729 aa  52  0.00003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02811  hypothetical protein  24.48 
 
 		 837 aa  51.6  0.00003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.370164 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0698  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  20.53 
 
 		 784 aa  52  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3576  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.43 
 
 		 261 aa  52  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1787  TPR repeat-containing protein  22.58 
 
 		 543 aa  51.6  0.00003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.662156  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12541  Tfp pilus assembly protein PilF  23.7 
 
 		 442 aa  52  0.00003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.34619  hitchhiker  0.00140851 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2135  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.95 
 
 		 373 aa  52  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.204203  normal  0.945333 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1053  TPR domain-containing protein  32.98 
 
 		 586 aa  51.6  0.00004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.038306  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0083  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.8 
 
 		 2240 aa  51.6  0.00004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0955  TPR repeat-containing protein  21.68 
 
 		 637 aa  51.6  0.00004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0217  TPR repeat-containing protein  39.76 
 
 		 646 aa  51.2  0.00004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1987  TPR repeat-containing protein  27.75 
 
 		 934 aa  51.6  0.00004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0465352  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24171  hypothetical protein  22.58 
 
 		 733 aa  51.2  0.00004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2530  TPR repeat-containing protein  27.43 
 
 		 260 aa  51.2  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1991  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.87 
 
 		 367 aa  51.2  0.00005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.310287  normal  0.0147414 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1606  tetratricopeptide TPR_2  25.31 
 
 		 240 aa  50.8  0.00005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.799027 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0276  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.85 
 
 		 624 aa  51.2  0.00005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1943  TPR repeat-containing protein  29.35 
 
 		 952 aa  50.8  0.00006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.102548 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>