59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU1698 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU1698  TPR domain-containing protein  100 
 
 		 626 aa  1264    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1635  TPR repeat-containing protein  53.5 
 
 		 665 aa  645    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0192476  normal  0.892457 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0646  TPR repeat-containing protein  35.27 
 
 		 611 aa  329  8e-89  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0665559  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1260  TPR repeat-containing protein  36.05 
 
 		 616 aa  305  1.0000000000000001e-81  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.126899  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2071  TPR repeat-containing protein  44.88 
 
 		 757 aa  277  4e-73  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1322  TPR repeat-containing protein  51.52 
 
 		 627 aa  214  2.9999999999999995e-54  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.993956  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2961  Tetratricopeptide domain protein  50.5 
 
 		 635 aa  212  2e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.445649 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1302  TPR domain-containing protein  35.74 
 
 		 846 aa  177  6e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0258  TPR repeat-containing protein  36.84 
 
 		 974 aa  136  9.999999999999999e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4380  TPR repeat-containing protein  30.93 
 
 		 900 aa  131  3e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0685  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.07 
 
 		 883 aa  131  4.0000000000000003e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0696  TPR repeat-containing protein  34.69 
 
 		 893 aa  127  6e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0651  TPR repeat-containing protein  32.18 
 
 		 878 aa  119  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.10746  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0583  diguanylate cyclase with GAF sensor  30.5 
 
 		 870 aa  57.8  0.0000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.958543 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  27.13 
 
 		 878 aa  52.8  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0540  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  20.92 
 
 		 1056 aa  52  0.00003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0423513  normal  0.0609988 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24101  hypothetical protein  31.48 
 
 		 725 aa  51.6  0.00004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2906  TPR repeat-containing protein  30.95 
 
 		 614 aa  51.2  0.00005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0475913  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1125  TPR domain-containing protein  30 
 
 		 457 aa  51.6  0.00005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2967  TPR repeat-containing protein  30.95 
 
 		 614 aa  51.2  0.00006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3015  TPR domain-containing protein  30.95 
 
 		 626 aa  50.8  0.00007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2601  TPR domain/SecC motif-containing domain protein  25 
 
 		 585 aa  50.4  0.00009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0346889  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6918  TPR repeat-containing protein  23.76 
 
 		 847 aa  48.9  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.378966  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2431  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  29.63 
 
 		 818 aa  48.9  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0177  TPR repeat-containing protein  30.16 
 
 		 614 aa  48.5  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0970  TPR domain-containing protein  30.16 
 
 		 614 aa  48.5  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2599  TPR domain-containing protein  30.16 
 
 		 614 aa  48.5  0.0003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0734298  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0453  TPR domain-containing protein  30.16 
 
 		 626 aa  48.5  0.0004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.311085  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2509  TPR repeat-containing protein  30.19 
 
 		 308 aa  48.5  0.0004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.235257 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7349  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  30.09 
 
 		 988 aa  48.5  0.0004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0738846  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1030  cellulose synthase operon protein C  30.11 
 
 		 1230 aa  48.5  0.0004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24171  hypothetical protein  27.21 
 
 		 733 aa  47.8  0.0006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6182  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  30.09 
 
 		 1056 aa  47.8  0.0006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0192  TPR repeat-containing protein  24.35 
 
 		 349 aa  47.8  0.0006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.906422  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3295  TPR repeat-containing protein  24.3 
 
 		 311 aa  47.8  0.0007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  26.17 
 
 		 810 aa  47.8  0.0007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4803  tetratricopeptide TPR_3  29.06 
 
 		 340 aa  47.4  0.0008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3368  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.85 
 
 		 503 aa  46.6  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00879958  normal  0.135189 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2480  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  27.43 
 
 		 1022 aa  46.6  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3815  TPR repeat-containing protein  21.56 
 
 		 399 aa  45.8  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1834  TPR repeat-containing protein  28.35 
 
 		 593 aa  46.6  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2606  tetratricopeptide TPR_2  24.07 
 
 		 643 aa  45.8  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4040  TPR repeat-containing protein  34.29 
 
 		 226 aa  45.8  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1106  TPR repeat-containing protein  22.94 
 
 		 371 aa  46.2  0.002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.178209 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0122  glycosyl transferase, group 1  26.71 
 
 		 3301 aa  45.4  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.326818 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3213  TPR repeat-containing protein  29.31 
 
 		 227 aa  45.1  0.004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0863  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.51 
 
 		 991 aa  45.1  0.004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3216  TPR repeat-containing protein  38.24 
 
 		 643 aa  45.1  0.004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000674385  hitchhiker  0.00000466075 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1146  TPR repeat-containing protein  23.62 
 
 		 1091 aa  45.1  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000383652 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1987  TPR repeat-containing protein  19.82 
 
 		 934 aa  44.7  0.005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0465352  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3191  TPR domain-containing protein  45.1 
 
 		 638 aa  44.7  0.005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2853  TPR repeat-containing protein  25.34 
 
 		 3172 aa  44.7  0.005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.56 
 
 		 632 aa  44.3  0.006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7275  hypothetical protein  29.73 
 
 		 385 aa  44.3  0.006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2383  TPR repeat-containing protein  27.07 
 
 		 1421 aa  44.7  0.006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.823331 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0607  tetratricopeptide TPR_2  28.17 
 
 		 957 aa  44.3  0.007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.21285 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0074  TPR repeat-containing protein  27.62 
 
 		 567 aa  44.3  0.007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00635622 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2754  TPR repeat-containing protein  26.19 
 
 		 295 aa  44.3  0.008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1098  type II and III secretion system protein  27.08 
 
 		 907 aa  43.9  0.009  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0580477  hitchhiker  0.000681519 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>