More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amuc_1098 on replicon NC_010655
Organism: Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010655  Amuc_1098  type II and III secretion system protein  100 
 
 
907 aa  1851    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0580477  hitchhiker  0.000681519 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1638  type II and III secretion system protein  37.41 
 
 
833 aa  516  1.0000000000000001e-145  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2851  type II and III secretion system protein  29.66 
 
 
895 aa  248  3e-64  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.17629  normal  0.0410464 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0639  type II and III secretion system protein  23.79 
 
 
596 aa  94  1e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3114  general secretory pathway D transmembrane protein  26.39 
 
 
805 aa  87  0.000000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.442209  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0031  general secretion pathway protein D  22.88 
 
 
794 aa  86.7  0.000000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.412275  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3420  general secretion pathway protein D  31.49 
 
 
758 aa  84  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.454827  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2927  general secretion pathway protein D  33.08 
 
 
645 aa  82  0.00000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.319356  normal  0.290619 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1175  general secretion pathway protein D  22.88 
 
 
797 aa  80.1  0.0000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.217594  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23970  general secretion pathway protein D  44 
 
 
658 aa  80.1  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.598956  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40320  secretion protein XqhA  30.07 
 
 
776 aa  79.7  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.386319  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3052  general secretion pathway protein D  33.1 
 
 
803 aa  78.6  0.0000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3399  general secretion pathway protein D  33.1 
 
 
807 aa  78.6  0.0000000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1041  general secretion pathway protein D  29.71 
 
 
799 aa  77.4  0.000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0180927  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3688  type II and III secretion system protein  24.88 
 
 
1469 aa  77  0.000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2028  general secretion pathway protein D  44.62 
 
 
658 aa  76.3  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.547904  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3244  type II and III secretion system protein  23.08 
 
 
781 aa  75.5  0.000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.549479 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0076  type II and III secretion system protein  31.14 
 
 
539 aa  75.1  0.000000000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2306  general secretion pathway protein D  34.81 
 
 
674 aa  75.1  0.000000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1416  general secretion pathway protein D  36.09 
 
 
634 aa  75.1  0.000000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.67015  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0917  general secretion pathway protein D  31.79 
 
 
810 aa  75.1  0.000000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.460737  normal  0.382842 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0052  general secretion pathway protein D  24.34 
 
 
777 aa  74.7  0.000000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0062  general secretion pathway protein D  24.34 
 
 
771 aa  74.7  0.000000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0097  general secretion pathway protein D  50 
 
 
662 aa  74.7  0.000000000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.395857  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3529  general secretion pathway protein D  24.86 
 
 
740 aa  73.9  0.00000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.22216  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2591  general secretion pathway protein D  23.18 
 
 
682 aa  73.9  0.00000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0081  general secretion pathway protein D  23.86 
 
 
780 aa  73.9  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0007  general secretion pathway protein D  23.13 
 
 
757 aa  73.6  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4160  general secretion pathway protein D  29.56 
 
 
748 aa  72.4  0.00000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5697  general secretion pathway protein D  32.33 
 
 
787 aa  72.4  0.00000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0549216 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0220  general secretion pathway protein D  22.89 
 
 
750 aa  72  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.960002  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0646  general secretion pathway protein D  31.16 
 
 
781 aa  72  0.00000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0255398  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0007  general secretion pathway protein D  22.89 
 
 
757 aa  72.4  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3070  general secretion pathway protein D  39.76 
 
 
787 aa  72  0.00000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00279328 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0667  general secretion pathway protein D  31.16 
 
 
781 aa  72  0.00000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.509623 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2786  general secretion pathway protein D  29.33 
 
 
757 aa  72  0.00000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.136433  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2662  general secretion pathway protein D  29.33 
 
 
757 aa  72  0.00000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1890  general secretion pathway protein D  29.33 
 
 
757 aa  72  0.00000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.189433  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3518  general secretion pathway protein D  29.33 
 
 
757 aa  72  0.00000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00601  general secretion pathway protein D  34.07 
 
 
658 aa  72  0.00000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0836  type II and III secretion system protein  44.78 
 
 
1282 aa  71.6  0.00000000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000934463  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2027  general secretion pathway protein D  43.08 
 
 
649 aa  71.6  0.00000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3427  general secretion pathway protein D  24.86 
 
 
753 aa  71.2  0.00000000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000756806 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0003  general secretion pathway protein D  24.31 
 
 
655 aa  71.2  0.00000000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0438473 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001892  general secretion pathway protein D/type II secretion outermembrane pore forming protein (PulD)  32.59 
 
 
672 aa  71.2  0.00000000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0859  type II and III secretion system protein  44.78 
 
 
1282 aa  71.2  0.00000000009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0159294  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1046  general secretion pathway protein D  31.65 
 
 
584 aa  70.9  0.0000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.603917  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4591  general secretion pathway protein D  44.93 
 
 
697 aa  70.9  0.0000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2695  type II and III secretion system protein  24.03 
 
 
530 aa  70.9  0.0000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2529  general secretion pathway protein D  21.78 
 
 
728 aa  70.9  0.0000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.151487  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2924  general secretion pathway protein D  34.78 
 
 
675 aa  70.1  0.0000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1519  putative pilus assembly protein cpaC  25.48 
 
 
496 aa  70.1  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.527914  normal  0.565497 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1087  general secretion pathway protein D  31.65 
 
 
584 aa  70.1  0.0000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.57571  normal  0.616621 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0007  general secretion pathway protein D  29.33 
 
 
744 aa  70.1  0.0000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2653  type II and III secretion system protein  22.55 
 
 
748 aa  70.5  0.0000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4501  putative general secretory pathway protein D  39.76 
 
 
814 aa  70.1  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.322148 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3936  general secretion pathway protein D  39.76 
 
 
791 aa  70.1  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.765741 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03956  general secretion pathway protein D  40.58 
 
 
681 aa  69.3  0.0000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2360  type II and III secretion system protein  30.81 
 
 
574 aa  69.3  0.0000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0231  general secretion pathway protein D  41.43 
 
 
689 aa  69.3  0.0000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3229  type II and III secretion system protein:NolW-like  30.28 
 
 
804 aa  68.9  0.0000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.151962  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0063  general secretion pathway protein D  30.22 
 
 
775 aa  68.9  0.0000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1299  general secretion pathway protein D  25.2 
 
 
716 aa  68.9  0.0000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1954  type II and III secretion system protein  32.61 
 
 
750 aa  68.6  0.0000000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0109975  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0756  general secretion pathway protein D  24.74 
 
 
738 aa  68.6  0.0000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.2147 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1412  general secretion pathway protein D  40.58 
 
 
640 aa  68.2  0.0000000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1043  general secretion pathway protein D  38.57 
 
 
584 aa  68.2  0.0000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.795547  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0885  general secretion pathway protein D  33.33 
 
 
756 aa  67.8  0.0000000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.741173  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4871  putative type II secretion system protein  25.2 
 
 
408 aa  67.4  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0665602  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4661  Flp pilus assembly protein secretin CpaC  31.79 
 
 
443 aa  67.4  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000794738  hitchhiker  0.00340482 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0542  type II and III secretion system protein  29.73 
 
 
702 aa  67  0.000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3580  helix-turn-helix, AraC type  41.43 
 
 
666 aa  67.4  0.000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.18181  normal  0.716334 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0279  type IV pilus secretin PilQ  41.67 
 
 
710 aa  66.6  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.881103 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4445  type II and III secretion system protein  28.99 
 
 
457 aa  66.6  0.000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2860  general secretion pathway protein D  40.58 
 
 
640 aa  66.2  0.000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3392  type II and III secretion system protein  24.92 
 
 
783 aa  67  0.000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0849213  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0315  type II and III secretion system protein  40 
 
 
732 aa  66.2  0.000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.713775 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55920  putative type II secretion system protein  25.2 
 
 
416 aa  66.6  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0275442  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3315  general secretion pathway protein D  37.36 
 
 
696 aa  67  0.000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4170  type II and III secretion system protein  31.79 
 
 
743 aa  66.2  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3928  type II and III secretion system protein  30 
 
 
460 aa  66.2  0.000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.13282  normal  0.228642 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4180  general secretion pathway protein D  38.57 
 
 
650 aa  66.2  0.000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.304265  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1041  type II and III secretion system protein  30.77 
 
 
443 aa  66.2  0.000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00604679  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4210  type II and III secretion system protein  31.79 
 
 
899 aa  66.2  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4358  general secretion pathway protein D  33.58 
 
 
724 aa  65.9  0.000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000917218  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3421  type II and III secretion system protein  25.86 
 
 
460 aa  66.2  0.000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.195466  normal  0.703201 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1521  type II and III secretion system protein  30.77 
 
 
443 aa  66.2  0.000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00384422  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1497  type II and III secretion system protein  30.77 
 
 
443 aa  66.2  0.000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0318341  hitchhiker  0.0000037114 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0690  type IV pilus secretin PilQ  41.1 
 
 
893 aa  66.2  0.000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2211  general secretion pathway protein D  31.19 
 
 
793 aa  65.5  0.000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.971398  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0388  general secretion pathway protein D  38.03 
 
 
650 aa  65.5  0.000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3136  general secretion pathway protein D  22.97 
 
 
736 aa  65.9  0.000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.81817  hitchhiker  0.003504 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1778  type II/III secretion system protein  30.54 
 
 
441 aa  65.5  0.000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1941  type II/III secretion system protein  30.54 
 
 
441 aa  65.5  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0187984  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3519  general secretion pathway protein D  38.03 
 
 
654 aa  65.5  0.000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0147755  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0250  type II and III secretion system protein  44.12 
 
 
703 aa  65.5  0.000000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.980463  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0887  type II and III secretion system protein  29.2 
 
 
625 aa  65.5  0.000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0606978  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0388  general secretion pathway protein D  38.03 
 
 
654 aa  65.5  0.000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0226374 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0609  general secretion pathway protein D  31.16 
 
 
635 aa  65.9  0.000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.73081e-17 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1768  type II/III secretion system protein  30.54 
 
 
441 aa  65.5  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.477043  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>