247 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_3645 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007519  Dde_3645  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 266 aa  537  9.999999999999999e-153  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2369  TPR repeat-containing protein  71.32 
 
 		 271 aa  394  1e-109  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.551588 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0269  TPR repeat-containing protein  64.66 
 
 		 267 aa  348  6e-95  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.583908 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0132  TPR repeat-containing protein  40 
 
 		 267 aa  196  2.0000000000000003e-49  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1630  TPR repeat-containing protein  26.39 
 
 		 279 aa  82.4  0.000000000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.374072  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0614  Tetratricopeptide domain protein  25.19 
 
 		 271 aa  70.9  0.00000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00924993 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1213  TPR repeat-containing protein  25.19 
 
 		 277 aa  67.4  0.0000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.576594 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2893  O-linked N-acetylglucosamine transferase  34.65 
 
 		 397 aa  62.8  0.000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.272299 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2326  TPR repeat-containing protein  38.67 
 
 		 254 aa  60.5  0.00000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  27.27 
 
 		 878 aa  60.5  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1667  TPR repeat-containing protein  29.14 
 
 		 250 aa  59.7  0.00000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00162147  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2476  TPR domain-containing protein  29.17 
 
 		 566 aa  59.7  0.00000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.834275  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2853  TPR repeat-containing protein  28.47 
 
 		 3172 aa  59.3  0.00000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2659  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.52 
 
 		 565 aa  57.4  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.144865 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3330  TPR repeat-containing protein  24.36 
 
 		 1038 aa  56.6  0.0000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2994  hypothetical protein  31.45 
 
 		 417 aa  56.2  0.0000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.542641  normal  0.0105744 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0911  tetratricopeptide TPR_4  29.71 
 
 		 875 aa  55.5  0.0000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.379762  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  26.67 
 
 		 810 aa  55.5  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3167  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.67 
 
 		 294 aa  55.5  0.000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0391783 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0659  TPR repeat-containing protein  30 
 
 		 2651 aa  55.1  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24171  hypothetical protein  27.01 
 
 		 733 aa  54.3  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0532  tetratricopeptide TPR_4  26.49 
 
 		 2679 aa  53.9  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  26.4 
 
 		 1737 aa  54.3  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0769  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.91 
 
 		 265 aa  53.5  0.000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5584  TPR repeat-containing protein  27.41 
 
 		 451 aa  53.9  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3006  response regulator receiver domain-containing protein  29 
 
 		 451 aa  53.5  0.000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.883991  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3235  tetratricopeptide TPR_2  32.67 
 
 		 734 aa  53.5  0.000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.82 
 
 		 632 aa  53.1  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1094  TPR repeat-containing protein  25.97 
 
 		 685 aa  52.4  0.000008  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0524  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.31 
 
 		 574 aa  51.6  0.00001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5235  hypothetical protein  21.19 
 
 		 797 aa  52  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.050699  normal  0.568835 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1499  TPR repeat-containing protein  26.61 
 
 		 486 aa  51.6  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.329638 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1568  hypothetical protein  26.09 
 
 		 820 aa  52  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4342  TPR repeat-containing protein  27.61 
 
 		 1406 aa  52  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.603254  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2414  TPR repeat-containing protein  31.13 
 
 		 589 aa  51.2  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0122  TPR repeat-containing protein  34.34 
 
 		 660 aa  50.8  0.00002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.142603  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  20.93 
 
 		 3145 aa  50.8  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2707  glycosyl transferase family protein  24.71 
 
 		 1486 aa  51.2  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.228337 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0755  TPR repeat-containing protein  30.15 
 
 		 662 aa  50.8  0.00002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.466717  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1387  TPR repeat-containing protein  22.22 
 
 		 333 aa  50.1  0.00003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.316988  normal  0.93517 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0439  Tetratricopeptide domain protein  24.29 
 
 		 272 aa  50.4  0.00003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1232  TPR repeat-containing protein  25.45 
 
 		 750 aa  50.4  0.00003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.967237  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2790  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.77 
 
 		 305 aa  50.4  0.00003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2859  sulfotransferase  30.3 
 
 		 832 aa  50.4  0.00003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.398491 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0163  TPR repeat-containing protein  28.1 
 
 		 356 aa  50.4  0.00003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00233758  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1233  TPR repeat-containing protein  26.17 
 
 		 909 aa  50.1  0.00004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.161918  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2126  TPR domain-containing protein  31.36 
 
 		 365 aa  50.1  0.00004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.0000000503657  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00381  hypothetical protein  31.31 
 
 		 437 aa  50.1  0.00004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2861  sulfotransferase  30.3 
 
 		 681 aa  50.1  0.00004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.392476 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0200  TPR repeat-containing protein  31.68 
 
 		 505 aa  49.7  0.00005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1106  TPR repeat-containing protein  35.56 
 
 		 605 aa  49.7  0.00005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000356395  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1840  TPR domain-containing protein  31.36 
 
 		 365 aa  49.7  0.00005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00013398  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1683  TPR repeat-containing protein  28.15 
 
 		 362 aa  49.3  0.00006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2526  tetratricopeptide TPR_2  24.29 
 
 		 1154 aa  49.3  0.00006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.240995 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3247  response regulator receiver protein  23.15 
 
 		 350 aa  49.3  0.00007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3115  TPR repeat-containing protein  29.52 
 
 		 284 aa  48.9  0.00008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000023055  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18211  hypothetical protein  27.54 
 
 		 603 aa  48.9  0.00008  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.905605 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2906  TPR repeat-containing protein  29.51 
 
 		 614 aa  48.5  0.0001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0475913  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2523  hypothetical protein  24.41 
 
 		 795 aa  48.1  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.184422  normal  0.460331 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0987  TPR repeat-containing protein  30.89 
 
 		 611 aa  48.5  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.384547  normal  0.0740288 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3015  TPR domain-containing protein  29.51 
 
 		 626 aa  48.5  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3339  TPR repeat-containing protein  28.47 
 
 		 732 aa  48.5  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.469864 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3533  SPINDLY family O-linked N-acetylglucosamine transferase  29 
 
 		 742 aa  48.5  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3075  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 602 aa  48.1  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.320155  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0637  TPR repeat-containing protein  28 
 
 		 4489 aa  48.5  0.0001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1449  tetratricopeptide TPR_2  27.27 
 
 		 1067 aa  48.5  0.0001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0737  TPR repeat-containing protein  31.82 
 
 		 229 aa  48.5  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.689615  normal  0.77842 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2967  TPR repeat-containing protein  29.51 
 
 		 614 aa  48.1  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0549  TPR repeat-containing protein  30.89 
 
 		 635 aa  48.1  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  29.41 
 
 		 1276 aa  48.5  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4770  sulfotransferase  31.31 
 
 		 887 aa  48.1  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.185793 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1028  TPR repeat-containing protein  30.89 
 
 		 635 aa  48.1  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.608823  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0060  TPR repeat-containing protein  25.18 
 
 		 562 aa  48.5  0.0001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0215  TPR repeat-containing protein  28.12 
 
 		 2262 aa  47.8  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0297822 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00731  hypothetical protein  24.68 
 
 		 816 aa  47.8  0.0002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.456129 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1093  TPR repeat-containing protein  27.27 
 
 		 681 aa  47.8  0.0002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.353622  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2993  TPR repeat-containing protein  31.25 
 
 		 789 aa  47.4  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00312978 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0934  Tetratricopeptide domain protein  31.17 
 
 		 301 aa  48.1  0.0002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2293  hypothetical protein  30.23 
 
 		 631 aa  47.8  0.0002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0853546 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3216  TPR repeat-containing protein  25.58 
 
 		 643 aa  47.8  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000674385  hitchhiker  0.00000466075 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2717  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 314 aa  47.4  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0212645  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0641  TPR repeat-containing protein  27.59 
 
 		 1094 aa  47.8  0.0002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.230386  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0100  TPR repeat-containing protein  35.11 
 
 		 375 aa  47  0.0003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0540  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  30.56 
 
 		 1056 aa  47  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0423513  normal  0.0609988 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1755  TPR repeat-containing protein  24.4 
 
 		 265 aa  47  0.0003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.0000044478  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0191  TPR repeat-containing protein  24.55 
 
 		 250 aa  47  0.0003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.641193  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1841  TPR repeat-containing protein  24.4 
 
 		 3035 aa  47.4  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1302  TPR domain-containing protein  31.87 
 
 		 846 aa  47  0.0003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2904  TPR repeat-containing protein  34.09 
 
 		 265 aa  47.4  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000121078  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0122  glycosyl transferase, group 1  24.65 
 
 		 3301 aa  47  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.326818 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3239  tetratricopeptide TPR_2  28.79 
 
 		 955 aa  47  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.502177  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1770  TPR repeat-containing protein  24.28 
 
 		 393 aa  47  0.0004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.452955  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1578  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  26.67 
 
 		 602 aa  46.6  0.0004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000346283  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3076  TPR repeat-containing protein  29.31 
 
 		 697 aa  46.6  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1711  TPR repeat-containing protein  23.15 
 
 		 222 aa  46.6  0.0004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02961  hypothetical protein  26.04 
 
 		 594 aa  46.6  0.0004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1677  TPR repeat-containing protein  23.15 
 
 		 222 aa  46.6  0.0004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4626  TPR repeat-containing protein  27.27 
 
 		 452 aa  46.6  0.0004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0087  TPR repeat-containing protein  29.91 
 
 		 366 aa  46.6  0.0004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2235  TPR repeat-containing protein  30.91 
 
 		 247 aa  46.6  0.0004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.294836  normal  0.740034 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>