138 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_4573 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007760  Adeh_3311  TPR repeat-containing protein  27.42 
 
 		 4074 aa  692    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3816  TPR repeat-containing protein  28.04 
 
 		 3936 aa  671    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4573  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  100 
 
 		 3590 aa  7203    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3455  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.26 
 
 		 4104 aa  668    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3372  TPR repeat-containing protein  27.42 
 
 		 4095 aa  731    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5443  TPR repeat-containing protein  24.09 
 
 		 2316 aa  197  2e-48  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.162158 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4143  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.35 
 
 		 2837 aa  162  2e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0473869 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5958  Tetratricopeptide TPR_4  24.29 
 
 		 2620 aa  155  2e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02941  hypothetical protein  20.61 
 
 		 1676 aa  108  2e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.673691 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0125  response regulator receiver protein  23.73 
 
 		 1131 aa  98.2  3e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.915528  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6186  Tetratricopeptide TPR_4  22.89 
 
 		 2910 aa  76.6  0.000000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.23193 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0840  TPR repeat-containing protein  23.52 
 
 		 1371 aa  74.3  0.00000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0083  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  22.1 
 
 		 2240 aa  70.5  0.0000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  21.08 
 
 		 1737 aa  65.5  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3902  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.76 
 
 		 1921 aa  65.5  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0699787 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0471  TPR repeat-containing protein  21.34 
 
 		 1297 aa  64.7  0.00000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3901  Tetratricopeptide repeat protein  24.68 
 
 		 2235 aa  63.9  0.00000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0305093 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2321  TPR repeat-containing protein  20.64 
 
 		 750 aa  61.6  0.0000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0122  glycosyl transferase, group 1  21.33 
 
 		 3301 aa  61.2  0.0000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.326818 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3996  tetratricopeptide TPR_2  21.84 
 
 		 1694 aa  60.8  0.0000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.271204  normal  0.601264 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4770  sulfotransferase  19.81 
 
 		 887 aa  60.8  0.0000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.185793 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0781  TPR domain-containing protein  26.55 
 
 		 924 aa  60.5  0.0000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.55707  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7349  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  21.47 
 
 		 988 aa  60.1  0.0000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0738846  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0887  Tetratricopeptide domain protein  20.29 
 
 		 1339 aa  60.1  0.0000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.102317 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  21.52 
 
 		 4079 aa  60.1  0.0000009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0011  hypothetical protein  20.59 
 
 		 1138 aa  59.7  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.41301  normal  0.0644501 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2048  TPR repeat-containing protein  23.88 
 
 		 573 aa  59.7  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.732994  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1356  beta-lactamase domain-containing protein  24.47 
 
 		 833 aa  59.3  0.000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3643  TPR domain-containing protein  22.71 
 
 		 1979 aa  58.9  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2707  glycosyl transferase family protein  20.14 
 
 		 1486 aa  58.9  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.228337 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4603  TPR repeat-containing protein  22.71 
 
 		 722 aa  58.2  0.000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.524488 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2981  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.43 
 
 		 383 aa  57.8  0.000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000586322  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1312  TPR repeat-containing protein  22.62 
 
 		 1069 aa  57.8  0.000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.530092  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3213  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.69 
 
 		 639 aa  57.8  0.000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000022774  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3719  TPR repeat-containing protein  27.75 
 
 		 405 aa  57.8  0.000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0540  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  22.15 
 
 		 1056 aa  57.4  0.000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0423513  normal  0.0609988 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0516  TPR repeat-containing protein  20.17 
 
 		 673 aa  57  0.000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000776603  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24101  hypothetical protein  20.44 
 
 		 725 aa  56.2  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2480  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  23.17 
 
 		 1022 aa  55.5  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3216  TPR repeat-containing protein  27.4 
 
 		 643 aa  55.5  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000674385  hitchhiker  0.00000466075 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2862  TPR repeat-containing protein  22.74 
 
 		 448 aa  55.8  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.375816 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0163  TPR repeat-containing protein  24.88 
 
 		 356 aa  55.5  0.00002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00233758  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  22.26 
 
 		 878 aa  55.8  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02857  tetratricopeptide repeat protein  23.42 
 
 		 391 aa  54.7  0.00003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3815  TPR repeat-containing protein  28.38 
 
 		 399 aa  54.7  0.00003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  20.11 
 
 		 810 aa  54.3  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1653  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  19.12 
 
 		 758 aa  54.3  0.00004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2853  TPR repeat-containing protein  23.08 
 
 		 3172 aa  54.3  0.00004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2861  sulfotransferase  29.03 
 
 		 681 aa  54.7  0.00004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.392476 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003023  putative heat shock protein  22.48 
 
 		 373 aa  54.3  0.00004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000120972  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1603  TPR repeat-containing protein  22.72 
 
 		 804 aa  53.9  0.00006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1502  tetratricopeptide repeat protein  23.42 
 
 		 389 aa  53.5  0.00007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000018122  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1518  TPR repeat-containing protein  20.12 
 
 		 597 aa  53.5  0.00008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00971618 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1078  TPR repeat-containing protein  25.74 
 
 		 423 aa  53.1  0.00009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.327406  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0687  TPR repeat-containing protein  24.38 
 
 		 2262 aa  53.1  0.00009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00419541 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0157  TPR repeat-containing protein  22.01 
 
 		 465 aa  52.8  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2859  sulfotransferase  23.36 
 
 		 832 aa  52.8  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.398491 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1376  TPR repeat-containing protein  24.08 
 
 		 1261 aa  52.8  0.0001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0670144  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11910  TPR repeat-containing protein  22.61 
 
 		 394 aa  52.8  0.0001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000944223  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1589  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.23 
 
 		 572 aa  52.8  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.499739 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1384  TPR repeat-containing protein  22.16 
 
 		 870 aa  53.1  0.0001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.00000149301  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0280  TPR domain-containing protein  22.02 
 
 		 1013 aa  52  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.416311 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0911  tetratricopeptide TPR_4  22.41 
 
 		 875 aa  51.6  0.0002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.379762  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  25.14 
 
 		 3145 aa  52  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0074  TPR repeat-containing protein  22.79 
 
 		 567 aa  52  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00635622 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3295  TPR repeat-containing protein  24.88 
 
 		 311 aa  51.6  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1704  TPR repeat-containing protein  27.87 
 
 		 265 aa  51.6  0.0003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.12979e-21 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0447  TPR domain-containing protein  20.65 
 
 		 992 aa  50.8  0.0004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000620141  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1499  TPR repeat-containing protein  21.17 
 
 		 486 aa  50.8  0.0004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.329638 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1796  TPR repeat-containing protein  31.73 
 
 		 352 aa  51.2  0.0004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1188  peptidase S41  22.19 
 
 		 897 aa  51.2  0.0004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.130898  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1773  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.95 
 
 		 466 aa  50.8  0.0004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0276  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.12 
 
 		 624 aa  50.8  0.0004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0864  TPR repeat-containing protein  23.28 
 
 		 1060 aa  51.2  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3191  TPR domain-containing protein  25.61 
 
 		 638 aa  50.8  0.0005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2893  O-linked N-acetylglucosamine transferase  24.19 
 
 		 397 aa  50.8  0.0005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.272299 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6471  Sel1 domain protein repeat-containing protein  23.53 
 
 		 1274 aa  50.4  0.0005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.707662  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24081  hypothetical protein  23.91 
 
 		 764 aa  50.8  0.0005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0112  Hep_Hag family protein  23.57 
 
 		 827 aa  50.4  0.0006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2431  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  22.45 
 
 		 818 aa  50.4  0.0006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0602  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.15 
 
 		 586 aa  50.4  0.0006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19131  hypothetical protein  25.36 
 
 		 936 aa  50.4  0.0006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.105709 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0689  TPR repeat-containing protein  23.59 
 
 		 632 aa  50.4  0.0006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000734837  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3469  TPR repeat-containing protein  23.2 
 
 		 1161 aa  50.4  0.0006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3518  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.37 
 
 		 320 aa  50.1  0.0008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1595  Hep_Hag family protein  20.41 
 
 		 617 aa  49.3  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.855766  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6182  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  21.58 
 
 		 1056 aa  49.7  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0087  TPR repeat-containing protein  27.87 
 
 		 366 aa  49.7  0.001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2367  TPR repeat-containing protein  22.19 
 
 		 860 aa  49.3  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2515  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.32 
 
 		 265 aa  49.7  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000326196  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  19.83 
 
 		 927 aa  48.5  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4492  TPR repeat-containing protein  21.3 
 
 		 605 aa  48.9  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1233  intermediate filament protein  20.43 
 
 		 573 aa  48.9  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.190296 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02961  hypothetical protein  26.29 
 
 		 594 aa  48.9  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2680  peptidase S41  19.72 
 
 		 745 aa  48.5  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.20871  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0930  TPR repeat-containing protein  23.46 
 
 		 329 aa  48.5  0.002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0215  TPR repeat-containing protein  25.14 
 
 		 2262 aa  48.9  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0297822 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2384  N-acetylglucosaminyl transferase-like protein  28.57 
 
 		 539 aa  48.1  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.40493  normal  0.336988 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13011  hypothetical protein  29.13 
 
 		 737 aa  48.1  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.113459 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28481  hypothetical protein  22.31 
 
 		 462 aa  48.5  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>