19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_3902 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_3902  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  100 
 
 		 1921 aa  3641    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0699787 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4573  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.54 
 
 		 3590 aa  68.2  0.000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5443  TPR repeat-containing protein  25.22 
 
 		 2316 aa  66.2  0.000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.162158 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3901  Tetratricopeptide repeat protein  25.72 
 
 		 2235 aa  63.5  0.00000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0305093 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3816  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 3936 aa  62.4  0.00000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4143  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.77 
 
 		 2837 aa  62  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0473869 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3372  TPR repeat-containing protein  31.79 
 
 		 4095 aa  59.3  0.0000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6186  Tetratricopeptide TPR_4  25.88 
 
 		 2910 aa  57  0.000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.23193 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3455  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.33 
 
 		 4104 aa  56.2  0.000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3311  TPR repeat-containing protein  29.74 
 
 		 4074 aa  55.1  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02941  hypothetical protein  22.62 
 
 		 1676 aa  52.4  0.00009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.673691 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3687  hypothetical protein  37.27 
 
 		 261 aa  48.9  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.145402  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2414  TPR repeat-containing protein  33.54 
 
 		 589 aa  47  0.003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3496  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.68 
 
 		 638 aa  46.6  0.005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.544411  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0602  RNA polymerase alpha subunit domain protein  33.33 
 
 		 451 aa  46.2  0.006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.125598  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24101  hypothetical protein  28.4 
 
 		 725 aa  46.2  0.007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2853  TPR repeat-containing protein  26.72 
 
 		 3172 aa  46.2  0.007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4803  tetratricopeptide TPR_3  29.84 
 
 		 340 aa  45.8  0.008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  29.24 
 
 		 878 aa  45.4  0.009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>