14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_3901 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_3901  Tetratricopeptide repeat protein  100 
 
 		 2235 aa  4280    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0305093 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3372  TPR repeat-containing protein  33.55 
 
 		 4095 aa  73.2  0.00000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4573  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.68 
 
 		 3590 aa  62.4  0.00000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3816  TPR repeat-containing protein  27.23 
 
 		 3936 aa  62  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3902  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.69 
 
 		 1921 aa  61.2  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0699787 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3311  TPR repeat-containing protein  33.68 
 
 		 4074 aa  55.5  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2981  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.85 
 
 		 383 aa  52.8  0.00008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000586322  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5443  TPR repeat-containing protein  26.89 
 
 		 2316 aa  52  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.162158 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1499  TPR repeat-containing protein  27.44 
 
 		 620 aa  51.2  0.0002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0511559 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4143  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.34 
 
 		 2837 aa  51.6  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0473869 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3455  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.53 
 
 		 4104 aa  49.3  0.0008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1166  TPR domain-containing protein  25.93 
 
 		 266 aa  47  0.004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.194624  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1516  tetratricopeptide repeat family protein  26.96 
 
 		 561 aa  47  0.004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2515  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.79 
 
 		 265 aa  45.8  0.01  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000326196  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>