92 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_3455 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011891  A2cp1_3455  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  100 
 
 		 4104 aa  7648    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3372  TPR repeat-containing protein  74.75 
 
 		 4095 aa  5048    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4573  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.32 
 
 		 3590 aa  806    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3311  TPR repeat-containing protein  96.69 
 
 		 4074 aa  6579    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3816  TPR repeat-containing protein  27.44 
 
 		 3936 aa  350  3e-94  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5443  TPR repeat-containing protein  27.47 
 
 		 2316 aa  177  3.9999999999999995e-42  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.162158 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0125  response regulator receiver protein  27.54 
 
 		 1131 aa  119  8.999999999999998e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.915528  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4143  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.86 
 
 		 2837 aa  117  4.0000000000000004e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0473869 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02941  hypothetical protein  22 
 
 		 1676 aa  107  4e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.673691 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5958  Tetratricopeptide TPR_4  26.67 
 
 		 2620 aa  97.8  4e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3902  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.46 
 
 		 1921 aa  72.8  0.0000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0699787 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4770  sulfotransferase  20.82 
 
 		 887 aa  72.8  0.0000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.185793 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  24.29 
 
 		 810 aa  72  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  26.61 
 
 		 878 aa  69.3  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1432  TPR domain-containing protein  25.35 
 
 		 573 aa  68.2  0.000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0083  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.9 
 
 		 2240 aa  67.8  0.000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4768  sulfotransferase  21.89 
 
 		 676 aa  67.8  0.000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.260339  normal  0.153237 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0887  Tetratricopeptide domain protein  19.23 
 
 		 1339 aa  67.4  0.000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.102317 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6186  Tetratricopeptide TPR_4  29.69 
 
 		 2910 aa  67  0.000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.23193 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  23.91 
 
 		 1737 aa  64.3  0.00000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0099  TPR repeat-containing protein  28.8 
 
 		 243 aa  63.9  0.00000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1499  TPR repeat-containing protein  23.88 
 
 		 486 aa  60.8  0.0000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.329638 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4767  sulfotransferase  26.77 
 
 		 682 aa  60.8  0.0000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.287127 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3213  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.36 
 
 		 639 aa  60.8  0.0000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000022774  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0516  TPR repeat-containing protein  24.08 
 
 		 673 aa  60.8  0.0000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000776603  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2491  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.12 
 
 		 689 aa  60.1  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02811  hypothetical protein  23.06 
 
 		 837 aa  60.5  0.0000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.370164 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1233  TPR repeat-containing protein  23.1 
 
 		 909 aa  58.2  0.000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.161918  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0637  TPR repeat-containing protein  27.35 
 
 		 4489 aa  57  0.000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0441  TPR repeat-containing protein  31.58 
 
 		 1085 aa  56.6  0.00001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.239248 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1683  TPR repeat-containing protein  27.03 
 
 		 362 aa  55.5  0.00002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1537  tetratricopeptide repeat protein  34.21 
 
 		 392 aa  55.5  0.00002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00894  tetratricopeptide repeat protein  33.33 
 
 		 392 aa  55.5  0.00002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0775107  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0540  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  21.97 
 
 		 1056 aa  55.5  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0423513  normal  0.0609988 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1594  tetratricopeptide repeat protein  34.21 
 
 		 392 aa  55.8  0.00002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.632242  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0122  glycosyl transferase, group 1  21.03 
 
 		 3301 aa  55.5  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.326818 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2859  sulfotransferase  22.39 
 
 		 832 aa  55.5  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.398491 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  22.64 
 
 		 4079 aa  55.1  0.00003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0825  TPR repeat-containing protein  25.53 
 
 		 739 aa  55.1  0.00003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.423694  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16401  hypothetical protein  23.27 
 
 		 779 aa  54.7  0.00003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.659248 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0685  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.91 
 
 		 883 aa  54.7  0.00003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013163  Cyan8802_4605  TPR repeat-containing protein  19.82 
 
 		 279 aa  55.1  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24081  hypothetical protein  26.89 
 
 		 764 aa  55.1  0.00003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1649  tetratricopeptide repeat protein  31.36 
 
 		 392 aa  54.7  0.00004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.165991  normal  0.0903087 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2853  TPR repeat-containing protein  22.9 
 
 		 3172 aa  54.7  0.00004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0157  TPR repeat-containing protein  24.49 
 
 		 465 aa  54.3  0.00005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0911  tetratricopeptide TPR_4  25.83 
 
 		 875 aa  53.9  0.00006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.379762  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0158  tetratricopeptide repeat protein  26.44 
 
 		 400 aa  53.9  0.00006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.185124  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4728  TPR repeat-containing protein  25.36 
 
 		 718 aa  53.5  0.00008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.346608 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2515  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.97 
 
 		 265 aa  53.5  0.00009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000326196  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2439  TPR repeat-containing protein  25.66 
 
 		 448 aa  53.1  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0207467  normal  0.980065 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  19.42 
 
 		 927 aa  52.8  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0934  tetratricopeptide repeat protein  29.58 
 
 		 389 aa  53.1  0.0001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0560  tetratricopeptide repeat protein  32.35 
 
 		 389 aa  53.1  0.0001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.143452  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1755  TPR repeat-containing protein  29.06 
 
 		 265 aa  52.4  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.0000044478  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24101  hypothetical protein  22.87 
 
 		 725 aa  52.4  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0048  tetratricopeptide domain-containing protein  28.4 
 
 		 897 aa  52  0.0002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00467809 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1745  TPR repeat-containing protein  28.42 
 
 		 402 aa  51.6  0.0003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2992  TPR repeat-containing protein  24.71 
 
 		 824 aa  50.8  0.0005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000746825 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2526  hypothetical protein  22.39 
 
 		 732 aa  50.8  0.0005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0463083 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2707  glycosyl transferase family protein  23.21 
 
 		 1486 aa  50.8  0.0005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.228337 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  22.26 
 
 		 3145 aa  50.8  0.0005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1312  TPR repeat-containing protein  28.74 
 
 		 1069 aa  50.8  0.0006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.530092  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3901  Tetratricopeptide repeat protein  26.53 
 
 		 2235 aa  50.4  0.0007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0305093 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4603  TPR repeat-containing protein  22.29 
 
 		 722 aa  50.1  0.0009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.524488 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6918  TPR repeat-containing protein  24.72 
 
 		 847 aa  49.7  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.378966  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0651  TPR repeat-containing protein  24.39 
 
 		 878 aa  49.7  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.10746  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19131  hypothetical protein  23.05 
 
 		 936 aa  49.7  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.105709 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3996  tetratricopeptide TPR_2  23.39 
 
 		 1694 aa  49.7  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.271204  normal  0.601264 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0200  TPR repeat-containing protein  23.8 
 
 		 505 aa  49.3  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0070  cellulose synthase subunit BcsC  26.24 
 
 		 1159 aa  48.5  0.002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.494386  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2906  TPR repeat-containing protein  31.15 
 
 		 614 aa  49.3  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0475913  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0453  TPR domain-containing protein  31.15 
 
 		 626 aa  49.3  0.002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.311085  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1957  hypothetical protein  28.57 
 
 		 475 aa  48.9  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  decreased coverage  0.00211883  hitchhiker  0.00150316 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3015  TPR domain-containing protein  31.15 
 
 		 626 aa  49.3  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0177  TPR repeat-containing protein  31.15 
 
 		 614 aa  49.3  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1987  TPR repeat-containing protein  23.71 
 
 		 934 aa  49.3  0.002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0465352  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2967  TPR repeat-containing protein  31.15 
 
 		 614 aa  48.9  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0970  TPR domain-containing protein  31.15 
 
 		 614 aa  49.3  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2599  TPR domain-containing protein  31.15 
 
 		 614 aa  49.3  0.002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0734298  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  22.61 
 
 		 632 aa  48.1  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7349  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  22.77 
 
 		 988 aa  48.1  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0738846  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0702  TPR repeat-containing protein  40 
 
 		 667 aa  48.5  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.274193  normal  0.091435 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0301  TPR repeat-containing protein  28.32 
 
 		 1827 aa  48.1  0.003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3201  TPR repeat-containing protein  23.76 
 
 		 955 aa  47.8  0.005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0757905 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0258  TPR repeat-containing protein  25.44 
 
 		 974 aa  47.8  0.005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3157  TPR repeat-containing protein  36.29 
 
 		 744 aa  47.4  0.006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.513945  normal  0.746059 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1840  TPR repeat-containing protein  24.79 
 
 		 3560 aa  47  0.008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1506  tetratricopeptide TPR_4  30.32 
 
 		 729 aa  47  0.008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1841  TPR repeat-containing protein  25.23 
 
 		 3035 aa  47  0.008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4342  TPR repeat-containing protein  23.79 
 
 		 1406 aa  46.6  0.01  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.603254  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3191  TPR domain-containing protein  22.65 
 
 		 638 aa  46.6  0.01  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>