More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_0125 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_0125  response regulator receiver protein  100 
 
 		 1131 aa  2276    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.915528  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3455  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.54 
 
 		 4104 aa  108  4e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3311  TPR repeat-containing protein  27.75 
 
 		 4074 aa  108  4e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4573  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.73 
 
 		 3590 aa  98.6  6e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3372  TPR repeat-containing protein  28.54 
 
 		 4095 aa  87.4  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1892  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 442 aa  73.2  0.00000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1986  response regulator receiver domain-containing protein  33.33 
 
 		 442 aa  72.4  0.00000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1011  two component transcriptional regulator, winged helix family  32.56 
 
 		 231 aa  71.6  0.00000000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1977  response regulator receiver protein  33.14 
 
 		 431 aa  70.9  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1220  response regulator receiver protein  29.46 
 
 		 130 aa  68.2  0.0000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1597  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase  36.15 
 
 		 860 aa  67.8  0.000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.711633  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1617  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase  36.15 
 
 		 860 aa  67.4  0.000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1196  two component transcriptional regulator  32.06 
 
 		 246 aa  65.9  0.000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20711  two-component response regulator  32.06 
 
 		 246 aa  66.2  0.000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17451  two-component response regulator  29.86 
 
 		 269 aa  65.5  0.000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0220  two component transcriptional regulator, AraC family  30.43 
 
 		 934 aa  65.1  0.000000007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.497584  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1134  two-component sensor  32.61 
 
 		 795 aa  65.1  0.000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0980947  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5887  serine/threonine protein kinase  28.35 
 
 		 762 aa  63.9  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6237  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  32.52 
 
 		 721 aa  63.2  0.00000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.703753 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1055  two component signal transduction response regulator  32.79 
 
 		 734 aa  63.2  0.00000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0148851  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3074  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  39.58 
 
 		 363 aa  63.2  0.00000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1246  CheA signal transduction histidine kinases  34.13 
 
 		 1643 aa  62  0.00000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0708097  normal  0.755815 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2975  response regulator receiver protein  35.23 
 
 		 124 aa  62  0.00000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0989438  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3017  response regulator receiver protein  35.23 
 
 		 124 aa  62  0.00000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.203071 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1240  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.4 
 
 		 227 aa  61.6  0.00000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.729355  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3766  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  40.21 
 
 		 802 aa  61.2  0.00000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0676736 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1671  response regulator/GGDEF domain-containing protein  35.45 
 
 		 322 aa  60.8  0.0000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3833  response regulator receiver protein  32.54 
 
 		 117 aa  60.8  0.0000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18081  two-component response regulator  31.01 
 
 		 248 aa  60.8  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0693  response regulator receiver protein  22.78 
 
 		 639 aa  61.2  0.0000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000123693 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1120  response regulator  39.13 
 
 		 134 aa  60.1  0.0000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0348  transcriptional regulatory protein  30.67 
 
 		 233 aa  60.1  0.0000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.618403  normal  0.242627 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4333  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 706 aa  60.5  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.742186  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0361  two component transcriptional regulator, winged helix family  30.72 
 
 		 233 aa  60.5  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.324623  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08590  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  30.34 
 
 		 239 aa  60.5  0.0000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.857083 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0467  response regulator receiver protein  33.06 
 
 		 124 aa  60.8  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.117091  normal  0.827791 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1038  sensory box histidine kinase/response regulator  30.37 
 
 		 513 aa  60.1  0.0000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3089  two component transcriptional regulator  30.19 
 
 		 236 aa  59.7  0.0000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.63756 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2563  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  26.9 
 
 		 935 aa  59.3  0.0000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.851477 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0721  two component transcriptional regulator, winged helix family  29.86 
 
 		 233 aa  59.3  0.0000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.811558  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3705  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase  36.27 
 
 		 628 aa  59.3  0.0000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.567264  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1937  response regulator receiver protein  31.75 
 
 		 117 aa  59.3  0.0000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.29733  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0443  two component transcriptional regulator  31.88 
 
 		 233 aa  59.3  0.0000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0876  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  31.76 
 
 		 709 aa  59.3  0.0000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0730078  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1463  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.34 
 
 		 1118 aa  59.3  0.0000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000390432  normal  0.0407868 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2712  two component transcriptional regulator  33.6 
 
 		 224 aa  59.3  0.0000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00552555  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3692  CheA signal transduction histidine kinase  33.58 
 
 		 1907 aa  58.9  0.0000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3548  response regulator receiver protein  32.54 
 
 		 117 aa  58.9  0.0000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0400953 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1863  response regulator receiver protein  28.66 
 
 		 431 aa  58.9  0.0000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3328  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase  31.97 
 
 		 711 aa  59.3  0.0000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2096  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  36.67 
 
 		 953 aa  58.5  0.0000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000903564 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01831  two-component response regulator  29.63 
 
 		 290 aa  58.9  0.0000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7367  two component transcriptional regulator  30.3 
 
 		 233 aa  58.5  0.0000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0819  LuxR family two component transcriptional regulator  29.34 
 
 		 227 aa  58.5  0.0000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.633548  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4681  two component transcriptional regulator  30.83 
 
 		 230 aa  58.5  0.0000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.354926 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2519  nitrogen metabolism transcriptional regulator, NtrC, Fis Family  28.42 
 
 		 468 aa  58.5  0.0000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4301  two component transcriptional regulator  30.83 
 
 		 230 aa  58.5  0.0000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.681825  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2901  nitrogen regulation protein NR(I)  28.42 
 
 		 468 aa  58.5  0.0000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4387  two component transcriptional regulator  30.83 
 
 		 230 aa  58.5  0.0000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0316317  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0337  response regulator receiver protein  31.85 
 
 		 139 aa  58.2  0.0000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0132867 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0597  two component transcriptional regulator  30.67 
 
 		 233 aa  58.2  0.0000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5352  two component transcriptional regulator, winged helix family  30 
 
 		 224 aa  58.5  0.0000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0135  DNA-binding response regulator  28.46 
 
 		 230 aa  58.2  0.0000009  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2324  two component LuxR family transcriptional regulator  28.66 
 
 		 245 aa  58.2  0.0000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.42123  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1595  two component transcriptional regulator  31.54 
 
 		 227 aa  58.2  0.0000009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.526383  normal  0.570373 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1037  sensory box/response regulator  30.71 
 
 		 799 aa  58.2  0.000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0868  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.94 
 
 		 650 aa  57.8  0.000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_143  DNA-binding response regulator, two-component system, OmpR family  27.33 
 
 		 256 aa  57.8  0.000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3619  response regulator receiver protein  22.39 
 
 		 647 aa  58.2  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.201054  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1920  response regulator receiver  40.28 
 
 		 226 aa  57.4  0.000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2159  two component transcriptional regulator, winged helix family  27.89 
 
 		 227 aa  58.2  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00177162  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0153  two component transcriptional regulator  29.03 
 
 		 253 aa  57.4  0.000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.711737  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4153  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  36.61 
 
 		 392 aa  57.8  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2122  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  36.67 
 
 		 953 aa  57.4  0.000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0111685  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3542  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase  27.73 
 
 		 590 aa  58.2  0.000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18291  two-component response regulator  28.89 
 
 		 248 aa  57.4  0.000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.276613  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2908  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.33 
 
 		 860 aa  57.8  0.000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4844  two component transcriptional regulator  31.39 
 
 		 231 aa  57.8  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.312171 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1285  sensory box sensor histidine kinase/response regulator  32.35 
 
 		 772 aa  57  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1179  two component transcriptional regulator, winged helix family  30.88 
 
 		 237 aa  57  0.000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.566879  normal  0.163877 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1878  two component transcriptional regulator  29.1 
 
 		 242 aa  57.4  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.559477 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1400  two component transcriptional regulator, winged helix family  30.88 
 
 		 237 aa  57  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0577794  normal  0.435154 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1712  two component transcriptional regulator  28.12 
 
 		 248 aa  57  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0463  two component transcriptional regulator  30.43 
 
 		 233 aa  57.4  0.000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.966783  normal  0.711351 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2907  two component transcriptional regulator  32.8 
 
 		 250 aa  57  0.000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1238  response regulator receiver  30.88 
 
 		 237 aa  57  0.000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4677  response regulator receiver domain-containing protein  36.89 
 
 		 121 aa  57  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0367  winged helix family two component transcriptional regulator  30.43 
 
 		 233 aa  57.4  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0127671 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0372  response regulator receiver protein  33.68 
 
 		 340 aa  57  0.000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.463682  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0581  winged helix family two component transcriptional regulator  30.6 
 
 		 242 aa  56.6  0.000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.296955  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5311  two component transcriptional regulator  30.82 
 
 		 246 aa  56.6  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.554395  normal  0.310406 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1245  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.81 
 
 		 256 aa  56.6  0.000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0649443  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3572  two component, sigma-54 specific, Fis family transcriptional regulator  32.03 
 
 		 457 aa  56.2  0.000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2841  response regulator receiver modulated GAF sensor protein  27.78 
 
 		 308 aa  56.2  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.585847 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2924  two component transcriptional regulator, winged helix family  29.79 
 
 		 265 aa  56.2  0.000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18111  two-component response regulator  28.91 
 
 		 248 aa  56.6  0.000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2845  two component transcriptional regulator  30.71 
 
 		 232 aa  56.2  0.000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.868207 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0075  response regulator receiver modulated PilZ sensor protein  35.16 
 
 		 227 aa  56.6  0.000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.124346  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14770  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  34.4 
 
 		 226 aa  56.2  0.000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.383411  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1399  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  35.56 
 
 		 476 aa  56.2  0.000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>