More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_3619 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_3619  response regulator receiver protein  100 
 
 		 647 aa  1321    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.201054  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0693  response regulator receiver protein  53.48 
 
 		 639 aa  653    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000123693 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0681  response regulator receiver protein  53.41 
 
 		 639 aa  659    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.657626  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1830  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  36.36 
 
 		 941 aa  88.2  4e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3629  putative CheA signal transduction histidine kinases  34.51 
 
 		 2336 aa  87  0.000000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2096  CheA signal transduction histidine kinases  36.36 
 
 		 2301 aa  86.7  0.000000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0287  two component transcriptional regulator, winged helix family  31.89 
 
 		 237 aa  86.3  0.000000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0371836  normal  0.118342 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3717  KDP operon transcriptional regulatory protein KdpE  35.66 
 
 		 244 aa  84  0.000000000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1813  putative hybrid two-component sensor and regulatory protein  35.54 
 
 		 2284 aa  83.6  0.00000000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.409027  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3309  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  40.37 
 
 		 900 aa  83.6  0.00000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.269875  normal  0.342346 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1504  two component transcriptional regulator  32.09 
 
 		 231 aa  83.2  0.00000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.263867  normal  0.57819 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0776  response regulator receiver protein  37.93 
 
 		 121 aa  82  0.00000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.428997  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0623  DNA-binding response regulator  35 
 
 		 231 aa  81.6  0.00000000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000212568  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0609  DNA-binding response regulator  34.96 
 
 		 231 aa  81.6  0.00000000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000282114  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2695  response regulator receiver domain-containing protein  41.13 
 
 		 186 aa  81.3  0.00000000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00269866  normal  0.78823 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1884  response regulator receiver protein  35.97 
 
 		 244 aa  80.9  0.00000000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.365735  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1472  response regulator receiver protein  37.5 
 
 		 122 aa  80.5  0.00000000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.413604  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1212  response regulator receiver protein  37.9 
 
 		 123 aa  80.5  0.00000000000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3737  two component transcriptional regulator  29.85 
 
 		 231 aa  79.7  0.0000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00273603 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4150  response regulator receiver protein  36.36 
 
 		 125 aa  80.1  0.0000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.583085 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5345  two component transcriptional regulator, winged helix family  30.11 
 
 		 230 aa  79.7  0.0000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.264155 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1390  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.67 
 
 		 1977 aa  79.7  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3050  two component transcriptional regulator  34.06 
 
 		 224 aa  80.1  0.0000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.519152  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6070  two component response regulator  37.88 
 
 		 228 aa  79  0.0000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2396  CheA signal transduction histidine kinase  31.97 
 
 		 1832 aa  79.3  0.0000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.412957 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4050  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.62 
 
 		 227 aa  79.3  0.0000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00552008  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4157  winged helix family two component transcriptional regulator  37.9 
 
 		 231 aa  79  0.0000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.507569  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5030  sensor histidine kinase/response regulator  31.86 
 
 		 1987 aa  79  0.0000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1711  two component transcriptional regulator  37.9 
 
 		 231 aa  79  0.0000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4110  response regulator receiver protein  35.29 
 
 		 126 aa  78.6  0.0000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2814  response regulator receiver protein  34.43 
 
 		 124 aa  78.6  0.0000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.212392  normal  0.180632 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1875  histidine kinase  38.26 
 
 		 785 aa  78.2  0.0000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0661847  normal  0.240097 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0171  response regulator receiver protein  35 
 
 		 122 aa  78.2  0.0000000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3840  histidine kinase  38.26 
 
 		 785 aa  78.6  0.0000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0989388  normal  0.369399 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4410  response regulator receiver protein  35 
 
 		 131 aa  78.2  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.686937 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3859  response regulator receiver protein  35.29 
 
 		 124 aa  78.6  0.0000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1805  response regulator receiver protein  35 
 
 		 122 aa  78.2  0.0000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.422276 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1981  response regulator receiver domain-containing protein  36.89 
 
 		 177 aa  78.2  0.0000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.366163 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3221  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  27.62 
 
 		 443 aa  78.2  0.0000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0497788 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3729  two component transcriptional regulator  37.9 
 
 		 231 aa  77.8  0.0000000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2789  response regulator receiver domain-containing protein  36.36 
 
 		 122 aa  77.8  0.0000000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0513  response regulator  33.61 
 
 		 2458 aa  77.4  0.0000000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1496  response regulator receiver protein  34.43 
 
 		 127 aa  77.4  0.0000000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.270703 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0492  response regulator receiver:CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Hpt  31.86 
 
 		 1992 aa  77.4  0.0000000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05390  ChpA  33.61 
 
 		 2476 aa  77.4  0.0000000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.812783  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2649  response regulator receiver protein  33.88 
 
 		 122 aa  77  0.0000000000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.857048  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0423  response regulator receiver protein  38.71 
 
 		 123 aa  77  0.0000000000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.89687 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0612  polar differentiation response regulator  33.87 
 
 		 123 aa  76.6  0.000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2246  KDP operon transcriptional regulatory protein kdpE  37.6 
 
 		 230 aa  76.6  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.683582  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3134  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.54 
 
 		 500 aa  77  0.000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.952243  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0576  polar differentiation response regulator  33.87 
 
 		 134 aa  76.6  0.000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0299  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.17 
 
 		 231 aa  76.6  0.000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.867846 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2988  two component transcriptional regulator, winged helix family  31.74 
 
 		 256 aa  77  0.000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4029  two component transcriptional regulator  39.52 
 
 		 241 aa  76.6  0.000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.871415 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1450  histidine kinase  37.5 
 
 		 785 aa  77  0.000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.106734  normal  0.251272 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6680  response regulator receiver protein  35.48 
 
 		 126 aa  76.6  0.000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7418  response regulator receiver protein  35.48 
 
 		 126 aa  76.6  0.000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.149776  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1347  response regulator receiver protein  32.26 
 
 		 123 aa  76.6  0.000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.57835  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1555  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.7 
 
 		 1172 aa  76.6  0.000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0698206 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1483  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  38.24 
 
 		 335 aa  76.6  0.000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.882912  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0097  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  36.75 
 
 		 448 aa  75.9  0.000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0237  response regulator receiver protein  34.09 
 
 		 124 aa  75.9  0.000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000555979 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3677  response regulator PleD  32.77 
 
 		 461 aa  76.3  0.000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.00345303  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2056  DNA-binding response regulator  35.54 
 
 		 227 aa  75.9  0.000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.413172  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2240  DNA-binding response regulator  35.54 
 
 		 227 aa  75.9  0.000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.85177e-28 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1484  histidine kinase  38.39 
 
 		 785 aa  76.3  0.000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3142  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.61 
 
 		 1352 aa  75.9  0.000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2662  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.61 
 
 		 231 aa  76.3  0.000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2212  DNA-binding response regulator  35.54 
 
 		 227 aa  75.9  0.000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1791  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.16 
 
 		 240 aa  75.9  0.000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000442123 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3288  two component transcriptional regulator  38.14 
 
 		 272 aa  75.9  0.000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.234797 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0922  response regulator receiver protein  39.42 
 
 		 459 aa  76.3  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5029  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.59 
 
 		 225 aa  76.3  0.000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15460  membrane sensor hybrid histidine protein kinase  33.86 
 
 		 772 aa  76.3  0.000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.361903  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0918  response regulator receiver protein  39.42 
 
 		 458 aa  75.9  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1901  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 125 aa  76.3  0.000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2623  response regulator receiver  31.11 
 
 		 160 aa  75.5  0.000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1815  response regulator receiver domain-containing protein  42.86 
 
 		 411 aa  75.5  0.000000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.800608  normal  0.49797 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0873  response regulator receiver domain-containing protein  39.42 
 
 		 483 aa  75.5  0.000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0633299  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0742  two component transcriptional regulator  34.45 
 
 		 245 aa  75.5  0.000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2155  CheA signal transduction histidine kinase  32.77 
 
 		 1609 aa  75.5  0.000000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0669  response regulator receiver domain-containing protein  31.45 
 
 		 167 aa  75.9  0.000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00304574  normal  0.832292 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3186  twitching motility protein  35.45 
 
 		 2092 aa  75.1  0.000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0988113  normal  0.323736 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0476  CheA signal transduction histidine kinase  31.9 
 
 		 1629 aa  75.1  0.000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0503  two component transcriptional regulator  32.2 
 
 		 223 aa  74.7  0.000000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5173  DNA-binding response regulator  31.93 
 
 		 221 aa  74.7  0.000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3804  response regulator receiver protein  31.76 
 
 		 222 aa  75.1  0.000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0687952  normal  0.157721 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0120  response regulator receiver  34.07 
 
 		 221 aa  74.7  0.000000000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4744  response regulator  31.93 
 
 		 221 aa  74.7  0.000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4763  response regulator  31.93 
 
 		 221 aa  74.7  0.000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5275  DNA-binding response regulator  31.93 
 
 		 221 aa  74.7  0.000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1768  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.5 
 
 		 1033 aa  74.7  0.000000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.046039  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5179  DNA-binding response regulator  31.93 
 
 		 221 aa  74.7  0.000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5144  DNA-binding response regulator  31.93 
 
 		 221 aa  74.7  0.000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4859  two component transcriptional regulator  31.93 
 
 		 221 aa  75.1  0.000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5188  DNA-binding response regulator  31.93 
 
 		 221 aa  74.7  0.000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3069  two component transcriptional regulator  33.06 
 
 		 230 aa  75.1  0.000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000467461  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0071  DNA-binding response regulator  31.93 
 
 		 221 aa  74.7  0.000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0603  two component transcriptional regulator  36.59 
 
 		 233 aa  74.7  0.000000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0519325  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1694  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.51 
 
 		 236 aa  74.7  0.000000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000906935 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>