More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Anae109_1863 on replicon NC_009675
Organism: Anaeromyxobacter sp. Fw109-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009675  Anae109_1863  response regulator receiver protein  100 
 
 
431 aa  818    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1986  response regulator receiver domain-containing protein  57.47 
 
 
442 aa  402  1e-111  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1892  response regulator receiver protein  57.24 
 
 
442 aa  382  1e-105  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1977  response regulator receiver protein  57.54 
 
 
431 aa  375  1e-103  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4417  response regulator receiver protein  31.93 
 
 
442 aa  175  9.999999999999999e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.628973  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4262  response regulator receiver domain-containing protein  30.96 
 
 
451 aa  154  4e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4396  response regulator receiver protein  30.18 
 
 
469 aa  150  5e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4417  response regulator receiver protein  30.24 
 
 
451 aa  146  6e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5548  response regulator receiver protein  32.31 
 
 
849 aa  76.3  0.000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.423891  normal  0.646802 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0845  hypothetical protein  22.83 
 
 
273 aa  66.6  0.0000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4422  response regulator receiver  37.88 
 
 
237 aa  66.2  0.0000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.259959  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1894  two component transcriptional regulator  37.39 
 
 
219 aa  63.5  0.000000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000765732  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2399  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.39 
 
 
219 aa  63.5  0.000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00272  hitchhiker  0.00893631 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4157  hypothetical protein  33.33 
 
 
366 aa  63.2  0.000000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0386592  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4041  hypothetical protein  33.33 
 
 
383 aa  62.8  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.380101  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2083  two component transcriptional regulator  35.65 
 
 
219 aa  62.4  0.00000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.129585  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4184  hypothetical protein  33.33 
 
 
366 aa  62.8  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.16612  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2201  response regulator of RpoS  34.23 
 
 
338 aa  62.8  0.00000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3962  two component transcriptional regulator  28.86 
 
 
221 aa  62.4  0.00000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1927  two component transcriptional regulator  36.52 
 
 
219 aa  62.4  0.00000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000341688  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0314  two component transcriptional regulator  32.26 
 
 
233 aa  62  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.765921 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1681  two-component transcriptional regulator  32.26 
 
 
233 aa  62  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1920  two component transcriptional regulator  36.52 
 
 
219 aa  62.4  0.00000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000662196  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3012  two component transcriptional regulator  38.24 
 
 
258 aa  62  0.00000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.642179 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1959  response regulator of RpoS  33.33 
 
 
338 aa  61.6  0.00000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2334  response regulator receiver protein  39.67 
 
 
151 aa  61.6  0.00000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0125  response regulator receiver protein  23.8 
 
 
1131 aa  61.6  0.00000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.915528  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1969  response regulator of RpoS  32.73 
 
 
338 aa  60.8  0.00000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.313928  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2331  response regulator of RpoS  32.73 
 
 
338 aa  60.8  0.00000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000591908  normal  0.501576 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0340  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  32.26 
 
 
470 aa  60.8  0.00000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1979  response regulator of RpoS  32.73 
 
 
338 aa  60.8  0.00000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.46167  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2078  response regulator of RpoS  32.73 
 
 
338 aa  60.8  0.00000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1827  two component transcriptional regulator  36.52 
 
 
219 aa  60.8  0.00000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00738443  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2150  two component transcriptional regulator  36.52 
 
 
219 aa  60.8  0.00000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00200664  normal  0.32319 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2280  response regulator of RpoS  33.64 
 
 
338 aa  60.5  0.00000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0715238  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0031  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.19 
 
 
234 aa  60.1  0.00000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02959  hypothetical protein  33.62 
 
 
467 aa  60.1  0.00000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2441  two component transcriptional regulator  29.41 
 
 
233 aa  60.1  0.00000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.325552  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5887  serine/threonine protein kinase  32.58 
 
 
762 aa  60.1  0.00000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1606  two component transcriptional regulator  33.1 
 
 
230 aa  60.5  0.00000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.307098  normal  0.688459 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002951  regulatory protein LuxO  33.62 
 
 
468 aa  60.1  0.00000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0508152  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0387  hypothetical protein  29.66 
 
 
371 aa  60.1  0.00000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.527792  hitchhiker  0.000473152 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1885  two component transcriptional regulator  35.65 
 
 
219 aa  60.1  0.00000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6070  two component response regulator  34.48 
 
 
228 aa  59.7  0.0000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1480  two component transcriptional regulator, winged helix family  27.78 
 
 
219 aa  59.3  0.0000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000681553  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2042  response regulator receiver protein  35.34 
 
 
147 aa  58.5  0.0000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04836  two-component system regulatory protein  30.3 
 
 
229 aa  58.5  0.0000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2008  two component transcriptional regulator  35.24 
 
 
251 aa  58.5  0.0000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.857325  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1135  GAF sensor hybrid histidine kinase  39.82 
 
 
1142 aa  58.9  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0522922  normal  0.044499 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2021  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.88 
 
 
236 aa  58.9  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.48021  normal  0.282737 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3443  response regulator receiver protein  30.17 
 
 
223 aa  58.5  0.0000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3079  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  31.62 
 
 
480 aa  58.5  0.0000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00177638  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2104  DNA-binding response regulator YgiX, putative  34.78 
 
 
219 aa  58.2  0.0000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3262  nitrogen metabolism transcriptional regulator, NtrC, Fis Family  30.77 
 
 
471 aa  58.2  0.0000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2692  two component transcriptional regulator, winged helix family  29.85 
 
 
229 aa  57.8  0.0000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0188  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  29.66 
 
 
452 aa  57.8  0.0000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0681  response regulator receiver protein  34.68 
 
 
639 aa  57.8  0.0000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.657626  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3686  response regulator receiver  32.95 
 
 
233 aa  57.8  0.0000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3459  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.61 
 
 
544 aa  57.4  0.0000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1197  response regulator receiver  35.71 
 
 
230 aa  57.4  0.0000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1641  two component transcriptional regulator  36.03 
 
 
243 aa  57.4  0.0000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.179821  normal  0.0712727 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1649  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  26.96 
 
 
479 aa  57.4  0.0000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3619  response regulator receiver protein  36.43 
 
 
647 aa  57  0.0000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.201054  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3292  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  35.09 
 
 
502 aa  57  0.0000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.652795 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2710  response regulator of RpoS  33.94 
 
 
337 aa  57  0.0000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.317611  hitchhiker  0.000232648 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0007  two component Fis family transcriptional regulator  34.48 
 
 
187 aa  57  0.0000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0291  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  26.96 
 
 
444 aa  56.6  0.0000007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00612417  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4163  two component transcriptional regulator  30.71 
 
 
223 aa  56.6  0.0000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4021  two component transcriptional regulator, winged helix family  30 
 
 
235 aa  56.6  0.0000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0415  two component transcriptional regulator  31.91 
 
 
231 aa  57  0.0000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.777838 
 
 
-
 
NC_002936  DET0232  DNA-binding response regulator  33.05 
 
 
227 aa  56.6  0.0000009  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.156156  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4064  two component transcriptional regulator  32.37 
 
 
233 aa  55.8  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.98903  normal  0.0666639 
 
 
-
 
NC_004310  BR0137  DNA-binding response regulator  36.89 
 
 
187 aa  56.2  0.000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2426  DNA-binding response regulator  32.09 
 
 
237 aa  55.8  0.000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2050  two component transcriptional regulator  35.19 
 
 
226 aa  56.2  0.000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2046  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.11 
 
 
226 aa  56.2  0.000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.095715  hitchhiker  0.000000000691151 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3077  two component transcriptional regulator  29.82 
 
 
227 aa  56.2  0.000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0535977  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1885  response regulator receiver protein  27.7 
 
 
1066 aa  56.2  0.000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.166704  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0131  DNA-binding response regulator  36.89 
 
 
187 aa  56.2  0.000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00417692  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0386  two component transcriptional regulator  32.17 
 
 
229 aa  56.2  0.000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2544  DNA binding domain protein, excisionase family  34.13 
 
 
264 aa  55.8  0.000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0361834  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4394  nitrogen regulation protein NR(I)  29.82 
 
 
469 aa  55.8  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1641  response regulator receiver protein  32.89 
 
 
183 aa  56.2  0.000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.772734  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41260  putative two-component response regulator  33.33 
 
 
235 aa  55.8  0.000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.923976 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003617  DNA-binding response regulator  32.11 
 
 
218 aa  55.8  0.000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.831618  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0970  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  22.03 
 
 
459 aa  55.8  0.000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000694494  normal  0.524712 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1847  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  35.65 
 
 
459 aa  55.8  0.000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.122843  normal  0.436579 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1483  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  35.04 
 
 
335 aa  56.2  0.000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.882912  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1233  two component transcriptional regulator  34.29 
 
 
230 aa  55.8  0.000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.333382 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1013  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  23.04 
 
 
456 aa  55.8  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0616674 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1781  response regulator receiver  32.09 
 
 
226 aa  55.8  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.365073  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2148  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.06 
 
 
819 aa  55.5  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.233006  hitchhiker  0.00949178 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0539  DNA-binding response regulator PhoP  30.54 
 
 
239 aa  55.5  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000130788 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4287  nitrogen regulation protein NR(I)  29.82 
 
 
469 aa  55.5  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0756679  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4237  nitrogen regulation protein NR(I)  29.82 
 
 
469 aa  55.5  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2479  response regulator receiver protein  28.81 
 
 
204 aa  55.5  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.303056 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10613  two component system DNA binding transcriptional regulatory protein tcrA  35.56 
 
 
253 aa  55.5  0.000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000499525  normal  0.750249 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2983  two component transcriptional regulator  32.61 
 
 
228 aa  55.1  0.000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4699  DNA-binding response regulator PhoP  30.54 
 
 
239 aa  55.5  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0647  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.25 
 
 
790 aa  55.5  0.000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>