More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_2479 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008009  Acid345_2479  response regulator receiver protein  100 
 
 		 204 aa  430  1e-120  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.303056 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2167  response regulator receiver protein  56.35 
 
 		 204 aa  152  4e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.965673 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4655  response regulator receiver protein  44.74 
 
 		 125 aa  103  2e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.230035  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0804  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.3 
 
 		 663 aa  88.2  7e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.296509  normal  0.022202 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2691  putative PAS/PAC sensor protein  31.09 
 
 		 385 aa  80.5  0.00000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.10412 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1812  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.48 
 
 		 553 aa  78.6  0.00000000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2975  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.87 
 
 		 663 aa  78.2  0.00000000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.658614  normal  0.178476 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3138  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.63 
 
 		 647 aa  77  0.0000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.825955 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2411  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.85 
 
 		 497 aa  76.6  0.0000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4252  response regulator receiver protein  34.65 
 
 		 151 aa  75.9  0.0000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.824205  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3286  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.96 
 
 		 228 aa  75.9  0.0000000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.167791  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4975  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.45 
 
 		 660 aa  74.7  0.0000000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3739  response regulator receiver modulated serine phosphatase  34.65 
 
 		 523 aa  74.7  0.0000000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.433453  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0367  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.23 
 
 		 503 aa  73.2  0.000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0540164 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0238  multi-component transcriptional regulator  31.39 
 
 		 1629 aa  72.8  0.000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0134  histidine kinase  36.92 
 
 		 547 aa  72.4  0.000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5066  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  34.43 
 
 		 338 aa  72  0.000000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2207  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.52 
 
 		 866 aa  71.6  0.000000000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4406  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.56 
 
 		 653 aa  72  0.000000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3272  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.1 
 
 		 962 aa  71.6  0.000000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0467  response regulator receiver protein  36.84 
 
 		 124 aa  71.2  0.000000000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.117091  normal  0.827791 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2370  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.62 
 
 		 1433 aa  71.2  0.00000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3134  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.65 
 
 		 500 aa  71.2  0.00000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.952243  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4225  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.51 
 
 		 1322 aa  70.1  0.00000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4151  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.5 
 
 		 230 aa  70.1  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2649  response regulator receiver protein  34.86 
 
 		 122 aa  70.1  0.00000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.857048  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1887  two component transcriptional regulator  30.17 
 
 		 231 aa  70.1  0.00000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.882564  normal  0.344123 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4125  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.5 
 
 		 230 aa  70.1  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.125271  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1954  two component transcriptional regulator  34.13 
 
 		 229 aa  70.1  0.00000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000155813  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0415  two component transcriptional regulator  33.86 
 
 		 231 aa  70.1  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.777838 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1477  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  29.92 
 
 		 317 aa  70.1  0.00000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3674  two component transcriptional regulator  34.21 
 
 		 263 aa  70.5  0.00000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.400914  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1440  response regulator  33.04 
 
 		 391 aa  69.3  0.00000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0677305  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0347  PAS  34.19 
 
 		 513 aa  69.7  0.00000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000072068 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4681  two component transcriptional regulator  34.59 
 
 		 230 aa  69.7  0.00000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.354926 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1069  response regulator receiver protein  33.88 
 
 		 128 aa  69.7  0.00000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0511705  normal  0.476202 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4301  two component transcriptional regulator  34.59 
 
 		 230 aa  69.7  0.00000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.681825  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1422  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  29.85 
 
 		 361 aa  69.3  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4387  two component transcriptional regulator  34.59 
 
 		 230 aa  69.7  0.00000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0316317  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4844  two component transcriptional regulator  34.62 
 
 		 231 aa  69.7  0.00000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.312171 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5666  two component LuxR family transcriptional regulator  36.94 
 
 		 312 aa  68.9  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.917296 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0244  two component transcriptional regulator, winged helix family  29.51 
 
 		 233 aa  69.3  0.00000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.71816  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4009  two component transcriptional regulator  35.88 
 
 		 230 aa  69.3  0.00000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00751412  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4966  two-component sensor response receiver component, histidine kinase  32.79 
 
 		 951 aa  69.3  0.00000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.292915 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3277  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  32.2 
 
 		 741 aa  69.3  0.00000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0387  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.29 
 
 		 1068 aa  68.9  0.00000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10999  two component response transcriptional regulatory protein MprA  34.21 
 
 		 230 aa  68.9  0.00000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000188235  normal  0.671639 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3730  two component LuxR family transcriptional regulator  36.94 
 
 		 312 aa  68.9  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4638  two component LuxR family transcriptional regulator  36.94 
 
 		 312 aa  68.9  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3396  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.15 
 
 		 927 aa  68.6  0.00000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2708  sensor hybrid histidine kinase  28.33 
 
 		 530 aa  68.6  0.00000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.752029  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0008  PAS  30.66 
 
 		 1439 aa  68.6  0.00000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.130257  normal  0.0574671 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3044  DMSO/TMAO-sensor hybrid histidine kinase  33.59 
 
 		 813 aa  68.6  0.00000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2324  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.47 
 
 		 1162 aa  68.6  0.00000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3423  response regulator receiver protein  30.92 
 
 		 224 aa  68.6  0.00000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.699539  normal  0.107362 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02505  putative response regulator  26.19 
 
 		 306 aa  68.6  0.00000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2620  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  33.83 
 
 		 532 aa  68.6  0.00000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0658498  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4229  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  30.33 
 
 		 383 aa  68.6  0.00000000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.599633  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2789  response regulator receiver protein  33.05 
 
 		 121 aa  68.2  0.00000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0585  ATP-binding region ATPase domain protein  34.38 
 
 		 528 aa  68.6  0.00000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.215545  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3217  sigma-54 dependent DNA-binding response regulator  31.97 
 
 		 501 aa  68.2  0.00000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0080  two component transcriptional regulator, winged helix family  31.58 
 
 		 230 aa  68.2  0.00000000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5081  PAS  32.26 
 
 		 659 aa  68.2  0.00000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.803763  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3771  Hpt sensor hybrid histidine kinase  33.59 
 
 		 455 aa  68.2  0.00000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000121  response regulator  37.07 
 
 		 319 aa  68.2  0.00000000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0601608  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2264  Serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit-like protein  31.97 
 
 		 525 aa  68.2  0.00000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0874374 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6507  two component transcriptional regulator  32.64 
 
 		 270 aa  68.2  0.00000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0763131  normal  0.20607 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3143  response regulator receiver protein  31.78 
 
 		 124 aa  67.4  0.0000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0749  Signal transduction histidine kinase  33.88 
 
 		 418 aa  67.8  0.0000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1815  response regulator receiver domain-containing protein  29.6 
 
 		 411 aa  67.4  0.0000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.800608  normal  0.49797 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3765  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.81 
 
 		 562 aa  67.8  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.13531 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3485  histidine kinase  33.33 
 
 		 418 aa  67.8  0.0000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3753  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.06 
 
 		 913 aa  67.8  0.0000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0468324  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0439  two component transcriptional regulator  31.67 
 
 		 225 aa  67.4  0.0000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000223011  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0717  two component transcriptional regulator, winged helix family  30.23 
 
 		 226 aa  67.8  0.0000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000154116  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3157  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.71 
 
 		 859 aa  67.4  0.0000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.388874 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0193  response regulator receiver protein  31.03 
 
 		 127 aa  67.8  0.0000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00528064  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0268  two component transcriptional regulator, winged helix family  32.62 
 
 		 227 aa  67.8  0.0000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.509377 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3794  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  32.71 
 
 		 376 aa  67.4  0.0000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0277983  normal  0.543799 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1480  two component transcriptional regulator, winged helix family  29.01 
 
 		 219 aa  67  0.0000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000681553  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0987  two component transcriptional regulator, winged helix family  32.35 
 
 		 233 aa  67  0.0000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.195539  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1269  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  29.31 
 
 		 509 aa  66.6  0.0000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0257  response regulator receiver  34.82 
 
 		 241 aa  67  0.0000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.926332  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4783  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.4 
 
 		 680 aa  67  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.302794  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01690  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  30.43 
 
 		 217 aa  67  0.0000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.459553  normal  0.405302 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3723  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  28.69 
 
 		 903 aa  66.6  0.0000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.803649  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0719  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32 
 
 		 531 aa  67  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5468  two component transcriptional regulator, winged helix family  32.85 
 
 		 223 aa  67  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0758  response regulator receiver protein  34.26 
 
 		 132 aa  66.6  0.0000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0540632 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4210  response regulator receiver protein  32.2 
 
 		 123 aa  67  0.0000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00926762  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3446  response regulator receiver  32.03 
 
 		 234 aa  67  0.0000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.664648  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2743  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  31.97 
 
 		 395 aa  66.6  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1680  response regulator receiver  32.74 
 
 		 130 aa  66.6  0.0000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0338  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  32.12 
 
 		 513 aa  66.2  0.0000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.102838 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1011  two component transcriptional regulator, winged helix family  31.97 
 
 		 231 aa  66.2  0.0000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2749  response regulator receiver domain-containing protein  29.03 
 
 		 436 aa  66.2  0.0000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3005  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  31.58 
 
 		 303 aa  66.6  0.0000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000288968 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3359  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  31.97 
 
 		 395 aa  66.6  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.361398  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0743  response regulator receiver protein  34.26 
 
 		 132 aa  66.2  0.0000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1805  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  30.91 
 
 		 310 aa  66.2  0.0000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0638722  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>