More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_1680 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_1680  response regulator receiver  100 
 
 		 130 aa  267  4e-71  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0930  response regulator receiver protein  39.67 
 
 		 130 aa  79.7  0.00000000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000284085  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2282  histidine kinase  36.3 
 
 		 667 aa  77.8  0.00000000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4198  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.09 
 
 		 1185 aa  76.6  0.0000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.996958 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1701  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.89 
 
 		 236 aa  76.3  0.0000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0378  response regulator receiver protein  40 
 
 		 204 aa  75.5  0.0000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5346  PAS  35.59 
 
 		 1060 aa  75.9  0.0000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0493  signal transduction histidine kinase, LytS  37.19 
 
 		 1022 aa  75.9  0.0000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000359244  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0193  response regulator receiver protein  35.9 
 
 		 127 aa  74.3  0.0000000000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00528064  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1193  response regulator  39.82 
 
 		 223 aa  73.6  0.0000000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1389  DNA-binding response regulator  39.82 
 
 		 223 aa  73.6  0.0000000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1213  DNA-binding response regulator  39.82 
 
 		 223 aa  73.6  0.0000000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.203275  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1191  response regulator  39.82 
 
 		 223 aa  73.6  0.0000000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1312  DNA-binding response regulator  39.82 
 
 		 223 aa  73.6  0.0000000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1453  DNA-binding response regulator  39.82 
 
 		 223 aa  72.8  0.000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0741  chemotaxis response regulator transcription regulator protein  36.29 
 
 		 134 aa  72.8  0.000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.555358  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1413  DNA-binding response regulator  39.82 
 
 		 223 aa  72.8  0.000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3309  response regulator receiver  37.17 
 
 		 121 aa  73.6  0.000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0173978 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1351  DNA-binding response regulator  40 
 
 		 223 aa  73.2  0.000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3993  DNA-binding response regulator  40 
 
 		 223 aa  73.2  0.000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.910988 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1204  sensory box histidine kinase/response regulator  37.3 
 
 		 1177 aa  72.4  0.000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0360  response regulator receiver protein  39.05 
 
 		 204 aa  72.4  0.000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000726536 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0965  putative two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  38.52 
 
 		 462 aa  72.4  0.000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2032  hybrid sensory histidine kinase BarA  34.23 
 
 		 927 aa  72.4  0.000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0864566  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1402  chemotaxis response regulator transcription regulator protein  37.1 
 
 		 133 aa  72  0.000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.152629  normal  0.176551 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8520  response regulator receiver protein  34.21 
 
 		 224 aa  72  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.697367 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2981  two component transcriptional regulator  38.53 
 
 		 229 aa  71.6  0.000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000201285  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1021  two component transcriptional regulator  37.61 
 
 		 223 aa  72  0.000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3044  DMSO/TMAO-sensor hybrid histidine kinase  36.21 
 
 		 813 aa  72  0.000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3771  Hpt sensor hybrid histidine kinase  37.17 
 
 		 455 aa  71.6  0.000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3309  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  39.81 
 
 		 900 aa  71.6  0.000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.269875  normal  0.342346 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1438  putative PAS/PAC sensor protein  37.27 
 
 		 393 aa  71.6  0.000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.92182 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3241  response regulator receiver modulated PilZ sensor protein  41.51 
 
 		 470 aa  71.2  0.000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.230878  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3328  response regulator receiver modulated PilZ sensor protein  41.51 
 
 		 470 aa  71.2  0.000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4868  response regulator receiver protein  35.24 
 
 		 143 aa  71.2  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0669  putative twitching motility two-component response regulator transcription regulator protein  35.29 
 
 		 122 aa  70.9  0.000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1134  two-component sensor  33.59 
 
 		 795 aa  71.2  0.000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0980947  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2025  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  39.6 
 
 		 452 aa  70.9  0.000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1200  two component transcriptional regulator  37.61 
 
 		 238 aa  70.9  0.000000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1708  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase  40.57 
 
 		 869 aa  70.9  0.000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1028  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.86 
 
 		 237 aa  70.9  0.000000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2539  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 487 aa  70.9  0.000000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.846517  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2575  chitin degradation sensor protein  37.93 
 
 		 1127 aa  70.9  0.000000000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1215  two component transcriptional regulator  38.94 
 
 		 223 aa  70.9  0.000000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.533573  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2194  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  35.65 
 
 		 452 aa  70.5  0.000000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.514859 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4167  response regulator receiver protein  36.29 
 
 		 133 aa  70.5  0.000000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.937704  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2941  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.5 
 
 		 696 aa  70.5  0.000000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.843677  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4055  response regulator receiver protein  36.29 
 
 		 133 aa  70.5  0.000000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2370  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  38.6 
 
 		 899 aa  70.5  0.000000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.382891  normal  0.337313 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2622  response regulator receiver  31.15 
 
 		 123 aa  70.5  0.000000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6310  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.7 
 
 		 261 aa  70.5  0.000000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.534044  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0747  signal transduction histidine kinase-like protein  40.19 
 
 		 1287 aa  70.5  0.000000000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3142  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.21 
 
 		 939 aa  70.5  0.000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.660448  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3616  response regulator receiver Signal transduction histidine kinase  41.23 
 
 		 393 aa  70.1  0.000000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.159723  normal  0.789101 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002502  BarA sensory histidine kinase  38.39 
 
 		 932 aa  70.1  0.000000000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3089  winged helix family two component transcriptional regulator  35.09 
 
 		 224 aa  69.7  0.00000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.136258  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30940  response regulator with CheY-like receiver domain protein and winged-helix DNA-binding domain protein  35.19 
 
 		 225 aa  70.1  0.00000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1805  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  32.73 
 
 		 310 aa  69.7  0.00000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0638722  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0455  sensor histidine kinase/response regulator LuxN  31.93 
 
 		 686 aa  69.7  0.00000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0799  response regulator receiver protein  36.19 
 
 		 225 aa  69.7  0.00000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0661  adenylate/guanylate cyclase  36.28 
 
 		 1133 aa  69.7  0.00000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4712  two component transcriptional regulator  33.63 
 
 		 228 aa  68.9  0.00000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.541483  normal  0.0134498 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0846  response regulator receiver protein  35.24 
 
 		 225 aa  69.3  0.00000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3117  hybrid sensory histidine kinase BarA  34.23 
 
 		 918 aa  69.3  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.306406  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2280  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  37.86 
 
 		 453 aa  69.3  0.00000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.620123 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0561  response regulator receiver protein  34.45 
 
 		 122 aa  68.9  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.718467 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3131  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  38.1 
 
 		 464 aa  69.3  0.00000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.308445 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1768  multi-sensor hybrid histidine kinase  40 
 
 		 1033 aa  68.9  0.00000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.046039  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3180  hybrid sensory histidine kinase BarA  34.23 
 
 		 918 aa  69.3  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.359202 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0667  response regulator receiver domain-containing protein  33.33 
 
 		 1526 aa  69.3  0.00000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0280955  hitchhiker  0.000000898802 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20650  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  35.34 
 
 		 231 aa  68.9  0.00000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0260682  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3164  hybrid sensory histidine kinase BarA  34.23 
 
 		 918 aa  69.3  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0703153 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1377  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.61 
 
 		 225 aa  69.3  0.00000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000301655 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3099  hybrid sensory histidine kinase BarA  34.23 
 
 		 918 aa  69.3  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.528607  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0662  adenylate/guanylate cyclase  36.28 
 
 		 1130 aa  69.3  0.00000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1328  Signal transduction histidine kinase-like protein  35.34 
 
 		 763 aa  68.9  0.00000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0613  response regulator receiver protein  34.45 
 
 		 122 aa  68.9  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.242329  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3278  hybrid sensory histidine kinase BarA  34.23 
 
 		 918 aa  69.3  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.225719 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1691  sensor histidine kinase/response regulator GacS  35.34 
 
 		 917 aa  68.6  0.00000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4582  sensor/response regulator hybrid  36.36 
 
 		 925 aa  68.2  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1752  two component transcriptional regulator  33.63 
 
 		 228 aa  68.6  0.00000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.581522 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000289  sensor histidine kinase CqsS  30.89 
 
 		 681 aa  68.6  0.00000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.487379  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52260  sensor/response regulator hybrid  36.36 
 
 		 925 aa  68.2  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.173365 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1875  histidine kinase  36.36 
 
 		 785 aa  68.2  0.00000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0661847  normal  0.240097 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2824  ATP-binding region ATPase domain protein  33.59 
 
 		 1374 aa  68.2  0.00000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0829  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.78 
 
 		 1240 aa  68.2  0.00000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0022  GAF sensor hybrid histidine kinase  40.17 
 
 		 1356 aa  68.2  0.00000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2313  two component transcriptional regulator  36.89 
 
 		 228 aa  68.2  0.00000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0313786  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1949  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.26 
 
 		 1397 aa  67.8  0.00000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.539898  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03530  hybrid sensory histidine kinase BarA  36.94 
 
 		 932 aa  68.2  0.00000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3238  hybrid sensory histidine kinase BarA  35.14 
 
 		 918 aa  68.2  0.00000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.943664  normal  0.0194611 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2180  response regulator receiver  37.5 
 
 		 151 aa  67.8  0.00000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.269305  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3840  histidine kinase  36.36 
 
 		 785 aa  68.2  0.00000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0989388  normal  0.369399 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3856  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  34.55 
 
 		 378 aa  68.2  0.00000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.215089 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0766  two component transcriptional regulator  38.32 
 
 		 233 aa  68.2  0.00000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.528482  normal  0.302775 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3443  response regulator receiver protein  33.61 
 
 		 223 aa  68.2  0.00000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1051  response regulator receiver  28.45 
 
 		 125 aa  67.8  0.00000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0772  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.19 
 
 		 233 aa  67.8  0.00000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3770  response regulator receiver protein  38.71 
 
 		 391 aa  67.8  0.00000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000112062 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0959  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  33.03 
 
 		 372 aa  67.8  0.00000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>