More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal223_2046 on replicon NC_011663
Organism: Shewanella baltica OS223



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011663  Sbal223_2046  two component transcriptional regulator, winged helix family  100 
 
 		 226 aa  466  9.999999999999999e-131  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.095715  hitchhiker  0.000000000691151 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2301  two component transcriptional regulator  99.12 
 
 		 226 aa  463  1e-129  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00729091  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2416  two component transcriptional regulator  97.79 
 
 		 226 aa  457  9.999999999999999e-129  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.134995  hitchhiker  0.000110965 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2050  two component transcriptional regulator  98.67 
 
 		 226 aa  460  9.999999999999999e-129  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1941  two component transcriptional regulator  79.02 
 
 		 236 aa  362  3e-99  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2426  DNA-binding response regulator  74.89 
 
 		 237 aa  358  3e-98  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2074  two component transcriptional regulator  74.78 
 
 		 226 aa  355  3.9999999999999996e-97  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00164535  hitchhiker  0.00140528 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1904  two component transcriptional regulator  74.34 
 
 		 226 aa  353  8.999999999999999e-97  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00970528  hitchhiker  0.0000356769 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1959  two component transcriptional regulator  74.34 
 
 		 226 aa  351  4e-96  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.400986  normal  0.283843 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2316  response regulator receiver protein  63.88 
 
 		 226 aa  296  2e-79  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00000147543  hitchhiker  0.000888492 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2294  two component transcriptional regulator  63.56 
 
 		 226 aa  285  5e-76  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000876575  normal  0.575243 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1718  response regulator receiver protein  60.71 
 
 		 224 aa  264  7e-70  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0955826  normal  0.0525727 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1936  two component transcriptional regulator  55.11 
 
 		 226 aa  251  5.000000000000001e-66  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0482001  normal  0.0104585 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2150  two component transcriptional regulator, winged helix family protein  51.47 
 
 		 220 aa  205  5e-52  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.175243  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2236  two component transcriptional regulator  49.11 
 
 		 227 aa  198  3.9999999999999996e-50  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000435819  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1906  transcriptional regulatory protein-like protein  43.48 
 
 		 248 aa  176  2e-43  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00141074  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00149  transcriptional regulator CpxR  43.61 
 
 		 229 aa  170  2e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2625  two component transcriptional regulator  39.47 
 
 		 232 aa  169  3e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000000000561273 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1750  transcriptional regulatory protein CpxR  39.3 
 
 		 242 aa  167  1e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.000216865  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002219  copper-sensing two-component system response regulator CpxR  41.41 
 
 		 229 aa  164  1.0000000000000001e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000572967  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0311  two component transcriptional regulator, winged helix family protein  40.09 
 
 		 228 aa  163  2.0000000000000002e-39  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00012342  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1213  two component transcriptional regulator  39.21 
 
 		 252 aa  162  3e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000851  probable transcriptional regulator SyrB  38.86 
 
 		 221 aa  159  3e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00675785  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0070  two component transcriptional regulator  40.79 
 
 		 229 aa  159  4e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.834843 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1562  two component transcriptional regulator  41.07 
 
 		 228 aa  158  6e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00000591425  unclonable  0.00000000000208218 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1393  transcriptional regulatory protein CpxR  38.33 
 
 		 226 aa  158  7e-38  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2797  transcriptional regulator, CpxR  42.36 
 
 		 227 aa  158  7e-38  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.0000288823  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06763  transcriptional regulatory protein CpxR  37.72 
 
 		 221 aa  158  7e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2279  DNA-binding response regulator  38.63 
 
 		 238 aa  157  1e-37  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6145  two component response regulator  37.89 
 
 		 229 aa  157  1e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1603  transcriptional regulatory protein CpxR  38.33 
 
 		 226 aa  157  1e-37  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4460  two component transcriptional regulator  39.38 
 
 		 230 aa  157  1e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.94443  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3432  response regulator receiver protein  39.65 
 
 		 228 aa  156  2e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000345172  normal  0.351937 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0716  two component transcriptional regulator  38.03 
 
 		 233 aa  154  1e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3570  two component transcriptional regulator  40.35 
 
 		 227 aa  154  1e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000660562  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1651  winged helix family two component transcriptional regulator  36.84 
 
 		 272 aa  153  2e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.514526  normal  0.527007 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4066  two component transcriptional regulator  36.84 
 
 		 253 aa  153  2e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.945155 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2264  transcriptional regulator CpxR  40.17 
 
 		 228 aa  153  2e-36  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.000000000000005667  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3933  two component transcriptional regulator  40.97 
 
 		 227 aa  153  2e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000000956729  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0128  DNA-binding transcriptional regulator CpxR  41.2 
 
 		 232 aa  153  2e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.3237  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0676  two comoponent transcriptional regulator  36.8 
 
 		 231 aa  152  2.9999999999999998e-36  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000000021656  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4221  two component transcriptional regulator  35.84 
 
 		 240 aa  152  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.430301  normal  0.246318 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3461  response regulator receiver  40.17 
 
 		 226 aa  152  2.9999999999999998e-36  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000000000124466  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4581  two-component response regulator  36.16 
 
 		 239 aa  151  7e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.382311  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0136  DNA-binding transcriptional regulator CpxR  40.26 
 
 		 232 aa  151  8.999999999999999e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52250  two-component response regulator  35.71 
 
 		 239 aa  150  1e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.220903 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4562  two component transcriptional regulator  40.26 
 
 		 247 aa  150  2e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.488322  normal  0.0982939 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0987  two component transcriptional regulator  36.68 
 
 		 235 aa  149  3e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000260123  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3155  two component transcriptional regulator  40.35 
 
 		 228 aa  149  4e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4508  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.52 
 
 		 231 aa  149  5e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1253  two component transcriptional regulator  36.4 
 
 		 253 aa  149  5e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.85938  hitchhiker  0.000294124 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0279  two component transcriptional regulator  40.09 
 
 		 227 aa  148  6e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000622263  unclonable  0.000000000101633 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2869  two component transcriptional regulator  39.37 
 
 		 222 aa  148  8e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.643015  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_143  DNA-binding response regulator, two-component system, OmpR family  37.28 
 
 		 256 aa  147  9e-35  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0135  DNA-binding response regulator  36.44 
 
 		 230 aa  147  1.0000000000000001e-34  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2983  two component transcriptional regulator  37.61 
 
 		 228 aa  147  1.0000000000000001e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4657  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.84 
 
 		 240 aa  147  1.0000000000000001e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6517  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.21 
 
 		 228 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0325894 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3962  two-component response regulator PfeR  39.46 
 
 		 240 aa  146  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0588  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.8 
 
 		 226 aa  146  2.0000000000000003e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.944339  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3920  two component transcriptional regulator  34.96 
 
 		 232 aa  146  3e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.175599  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7488  two component response regulator  37.89 
 
 		 228 aa  146  3e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.461205  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3485  two component transcriptional regulator  37.89 
 
 		 236 aa  145  5e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00535  Transcriptional regulatory protein CpxR  36.75 
 
 		 247 aa  145  6e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.774728  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0960  two component transcriptional regulator  37.99 
 
 		 236 aa  145  6e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0214647 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1731  two component transcriptional regulator  34.98 
 
 		 236 aa  145  6e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.135854  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0281  two component transcriptional regulator  39.47 
 
 		 227 aa  144  7.0000000000000006e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000215794  unclonable  0.0000000255624 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4371  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.33 
 
 		 228 aa  144  8.000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03750  PhoP-like protein  36.68 
 
 		 226 aa  144  9e-34  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.181369  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3411  two component transcriptional regulator  35.4 
 
 		 229 aa  144  1e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13280  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.67 
 
 		 227 aa  144  1e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000536961  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3118  DNA-binding response regulator  34.98 
 
 		 227 aa  144  2e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0235  two component transcriptional regulator  36.89 
 
 		 230 aa  143  2e-33  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1930  two component transcriptional regulator  36.56 
 
 		 233 aa  142  3e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.465475  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5311  two component transcriptional regulator  38.14 
 
 		 246 aa  143  3e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.554395  normal  0.310406 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0707  winged helix family two component transcriptional regulator  37.89 
 
 		 222 aa  143  3e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0603  two component transcriptional regulator  34.65 
 
 		 233 aa  142  3e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0519325  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2389  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.65 
 
 		 240 aa  143  3e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0687652  decreased coverage  0.0000973314 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0785  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.11 
 
 		 235 aa  142  4e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3846  two component transcriptional regulator, winged helix family  37 
 
 		 222 aa  142  5e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1174  two component transcriptional regulator  35.22 
 
 		 239 aa  141  7e-33  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0181894  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0704  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  39.21 
 
 		 226 aa  141  7e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.710027 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1136  two component transcriptional regulator  35.22 
 
 		 239 aa  141  7e-33  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000652217  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3686  response regulator receiver  37.5 
 
 		 233 aa  141  8e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31480  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  35.81 
 
 		 239 aa  141  9e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  hitchhiker  0.00376265  normal  0.556858 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0050  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.8 
 
 		 235 aa  141  9e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0319  two component transcriptional regulator  36.12 
 
 		 223 aa  141  9e-33  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000369721  hitchhiker  0.00000000968682 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2051  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.19 
 
 		 236 aa  140  9.999999999999999e-33  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1841  two component transcriptional regulator  38.74 
 
 		 216 aa  141  9.999999999999999e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0207334  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1831  two component transcriptional regulator  37 
 
 		 225 aa  140  9.999999999999999e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.989444  normal  0.522163 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0483  two component transcriptional regulator  33.91 
 
 		 229 aa  140  9.999999999999999e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.342081  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1333  response regulator receiver protein  37.44 
 
 		 222 aa  141  9.999999999999999e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.40527  normal  0.1595 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2656  two component transcriptional regulator  35.27 
 
 		 226 aa  140  9.999999999999999e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.311089  normal  0.831438 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3185  two component transcriptional regulator  36.52 
 
 		 231 aa  140  9.999999999999999e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.729743  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1871  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.12 
 
 		 226 aa  140  9.999999999999999e-33  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.105791  normal  0.266081 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1606  two component transcriptional regulator  35.09 
 
 		 230 aa  141  9.999999999999999e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.307098  normal  0.688459 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3534  two component transcriptional regulator  38.39 
 
 		 234 aa  140  9.999999999999999e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0920223  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03700  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  35.24 
 
 		 226 aa  140  1.9999999999999998e-32  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.132847 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3850  DNA-binding transcriptional regulator CpxR  40.26 
 
 		 232 aa  140  1.9999999999999998e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.308855  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1784  alkaline phosphatase synthesis transcriptional regulatory protein  35.09 
 
 		 234 aa  140  1.9999999999999998e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.561076  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>