More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_2008 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_2008  two component transcriptional regulator  100 
 
 		 251 aa  499  1e-140  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.857325  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1233  two component transcriptional regulator  87.83 
 
 		 230 aa  365  1e-100  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.333382 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3012  two component transcriptional regulator  67.83 
 
 		 258 aa  335  2.9999999999999997e-91  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.642179 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3011  two component transcriptional regulator, winged helix family  72.44 
 
 		 226 aa  325  5e-88  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.267721  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1641  two component transcriptional regulator  68.83 
 
 		 243 aa  310  2e-83  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.179821  normal  0.0712727 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2517  two component transcriptional regulator  67.36 
 
 		 240 aa  309  2.9999999999999997e-83  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0413154  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2073  two component transcriptional regulator, winged helix family  69.3 
 
 		 228 aa  308  6.999999999999999e-83  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.847769  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2570  two component transcriptional regulator  66.37 
 
 		 222 aa  292  3e-78  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000747651 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3437  two component transcriptional regulator  49.78 
 
 		 225 aa  182  4.0000000000000006e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3585  two component transcriptional regulator  47.98 
 
 		 224 aa  178  9e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0160  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.16 
 
 		 229 aa  177  1e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4141  two component transcriptional regulator  46.29 
 
 		 224 aa  176  2e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0723203  normal  0.19792 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1764  two component transcriptional regulator  46.46 
 
 		 226 aa  176  2e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.807336  hitchhiker  0.00538862 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3270  two component transcriptional regulator  46.46 
 
 		 224 aa  176  4e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.424776  normal  0.538433 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4119  two component transcriptional regulator  45.85 
 
 		 224 aa  176  4e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0386662  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4247  two component transcriptional regulator  45.85 
 
 		 224 aa  176  4e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.29812  normal  0.0988817 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3669  two component transcriptional regulator  45.85 
 
 		 224 aa  175  5e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2981  transcriptional regulator TctD  45.74 
 
 		 224 aa  174  9.999999999999999e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.510212 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3084  transcriptional regulator TctD  45.74 
 
 		 224 aa  174  9.999999999999999e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2964  transcriptional regulator TctD  45.74 
 
 		 224 aa  174  9.999999999999999e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000947102 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2928  transcriptional regulatory protein TctD  45.74 
 
 		 224 aa  174  9.999999999999999e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.501058  normal  0.269412 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2897  DNA-binding response regulator TctD  45.74 
 
 		 224 aa  174  1.9999999999999998e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1627  two component transcriptional regulator  45.58 
 
 		 230 aa  174  1.9999999999999998e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1037  transcriptional regulatory protein TctD  45.41 
 
 		 252 aa  172  3.9999999999999995e-42  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0114  DNA-binding response regulator TctD  45.41 
 
 		 252 aa  172  3.9999999999999995e-42  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0952  DNA-binding response regulator TctD  45.41 
 
 		 252 aa  172  3.9999999999999995e-42  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1501  DNA-binding response regulator TctD  45.41 
 
 		 252 aa  172  3.9999999999999995e-42  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.412982  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2277  DNA-binding response regulator TctD  45.41 
 
 		 287 aa  172  5e-42  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5339  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.7 
 
 		 222 aa  171  1e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1127  DNA-binding response regulator TctD  46.19 
 
 		 223 aa  170  2e-41  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3332  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.58 
 
 		 221 aa  170  2e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3934  DNA-binding response regulator  42.15 
 
 		 223 aa  170  2e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3340  two component transcriptional regulator  46.43 
 
 		 224 aa  169  3e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0836001  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4343  two component transcriptional regulator  46.43 
 
 		 222 aa  169  4e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2580  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.09 
 
 		 231 aa  168  6e-41  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2101  two component transcriptional regulator  45.29 
 
 		 226 aa  168  7e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1724  DNA-binding response regulator TctD  43.97 
 
 		 267 aa  168  7e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0825207  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2042  two component transcriptional regulator  41.56 
 
 		 282 aa  168  9e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0143055  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2700  two component transcriptional regulator  42.54 
 
 		 282 aa  168  9e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.469389  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49450  response regulator TctD  44.39 
 
 		 223 aa  167  1e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.537816  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5980  two component transcriptional regulator  42.54 
 
 		 273 aa  166  2e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0635726 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3057  two component transcriptional regulator  42.86 
 
 		 228 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3924  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.3 
 
 		 228 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.154255  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0008  two component transcriptional regulator  43.3 
 
 		 228 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2983  DNA-binding response regulator  44.3 
 
 		 230 aa  166  4e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2924  DNA-binding response regulator  44.3 
 
 		 230 aa  166  4e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0074  two component transcriptional regulator  44.74 
 
 		 230 aa  166  4e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.948307  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1421  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.39 
 
 		 230 aa  166  4e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0283266  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0208  DNA-binding response regulator  44.3 
 
 		 230 aa  166  4e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.857207  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3256  two component transcriptional regulator  44.74 
 
 		 230 aa  166  4e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.430005 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3339  DNA-binding response regulator  44.3 
 
 		 230 aa  166  4e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0075  two component transcriptional regulator  44.74 
 
 		 230 aa  166  4e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2980  two component transcriptional regulator  44.74 
 
 		 230 aa  166  4e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_4004  DNA-binding response regulator  44.3 
 
 		 230 aa  166  4e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0066  two component transcriptional regulator  44.74 
 
 		 230 aa  166  4e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.530384  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1619  DNA-binding response regulator  44.3 
 
 		 230 aa  166  4e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3386  DNA-binding response regulator  44.3 
 
 		 230 aa  166  4e-40  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0093  two component transcriptional regulator  44.74 
 
 		 230 aa  166  4e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.51453 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0075  two component transcriptional regulator  44.74 
 
 		 230 aa  166  4e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.280185  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4078  DNA-binding response regulator  44.3 
 
 		 230 aa  166  4e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0729773  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0470  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.92 
 
 		 236 aa  165  5e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0454  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.92 
 
 		 235 aa  166  5e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2935  putative response regulator transcription regulator protein  47.14 
 
 		 235 aa  165  5.9999999999999996e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0649  two component transcriptional regulator  42.6 
 
 		 252 aa  165  5.9999999999999996e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0813  DNA-binding response regulator  42.6 
 
 		 247 aa  165  6.9999999999999995e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0618873  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0439  two component transcriptional regulator  42.15 
 
 		 253 aa  165  6.9999999999999995e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1459  two component transcriptional regulator  43.05 
 
 		 223 aa  165  6.9999999999999995e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0642  DNA-binding response regulator  43.05 
 
 		 291 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.743353  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2755  two component transcriptional regulator  43.05 
 
 		 221 aa  164  1.0000000000000001e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.795661  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0670  two component transcriptional regulator  41.48 
 
 		 266 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.293028 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0809  DNA-binding response regulator  42.15 
 
 		 247 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4231  DNA-binding response regulator TctD  43.5 
 
 		 223 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2574  two component transcriptional regulator  42.6 
 
 		 242 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1354  two component transcriptional regulator  43.95 
 
 		 223 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.776412  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1450  two component transcriptional regulator  44.49 
 
 		 226 aa  163  2.0000000000000002e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.286317  normal  0.490701 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2682  two component transcriptional regulator  42.6 
 
 		 242 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2653  two component transcriptional regulator  42.6 
 
 		 242 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2405  DNA-binding response regulator  42.6 
 
 		 250 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0552978  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0018  DNA-binding response regulator  42.6 
 
 		 247 aa  163  3e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0271  DNA-binding response regulator  42.6 
 
 		 247 aa  163  3e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3802  two component transcriptional regulator  44.05 
 
 		 227 aa  163  3e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.711494  normal  0.282515 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2671  DNA-binding response regulator  42.6 
 
 		 247 aa  163  3e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.84234  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0076  two component transcriptional regulator  43.05 
 
 		 223 aa  163  3e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.225452 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3296  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.7 
 
 		 260 aa  163  3e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0174877  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3212  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.32 
 
 		 233 aa  162  4.0000000000000004e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.419022  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2865  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.32 
 
 		 233 aa  162  4.0000000000000004e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.176419 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3120  two component transcriptional regulator  40.36 
 
 		 239 aa  162  4.0000000000000004e-39  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1364  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.54 
 
 		 224 aa  162  4.0000000000000004e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10613  two component system DNA binding transcriptional regulatory protein tcrA  42.67 
 
 		 253 aa  162  5.0000000000000005e-39  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000499525  normal  0.750249 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3965  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  43.05 
 
 		 223 aa  162  6e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5059  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.81 
 
 		 222 aa  161  7e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.118223  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3337  two component response regulator  41.26 
 
 		 221 aa  162  7e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.986169  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0429  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  43.5 
 
 		 223 aa  161  1e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.199286  decreased coverage  0.000258733 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3228  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.26 
 
 		 236 aa  160  2e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4764  two-component response regulator  43.5 
 
 		 223 aa  160  2e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.343356  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2401  two component transcriptional regulator  44.3 
 
 		 227 aa  160  2e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4301  two component transcriptional regulator  43.95 
 
 		 223 aa  160  2e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.285594  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1060  two component transcriptional regulator  43.05 
 
 		 223 aa  160  2e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54510  two-component response regulator  43.5 
 
 		 223 aa  160  2e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.377152 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0465  two component transcriptional regulator  41.26 
 
 		 229 aa  160  3e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>