More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_2755 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_2755  two component transcriptional regulator  100 
 
 		 221 aa  436  1e-121  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.795661  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0526  two component transcriptional regulator  46.58 
 
 		 229 aa  200  1.9999999999999998e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0788787  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1421  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.95 
 
 		 230 aa  197  1.0000000000000001e-49  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0283266  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0699  two component transcriptional regulator  47.25 
 
 		 220 aa  195  4.0000000000000005e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0465  two component transcriptional regulator  45.66 
 
 		 229 aa  195  4.0000000000000005e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4119  two component transcriptional regulator  48.18 
 
 		 224 aa  195  6e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0386662  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4247  two component transcriptional regulator  48.18 
 
 		 224 aa  195  6e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.29812  normal  0.0988817 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3270  two component transcriptional regulator  48.18 
 
 		 224 aa  195  6e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.424776  normal  0.538433 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1764  two component transcriptional regulator  47.73 
 
 		 226 aa  194  8.000000000000001e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.807336  hitchhiker  0.00538862 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4141  two component transcriptional regulator  48.18 
 
 		 224 aa  194  8.000000000000001e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0723203  normal  0.19792 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1764  DNA-binding response regulator  47.03 
 
 		 224 aa  194  9e-49  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3669  two component transcriptional regulator  48.18 
 
 		 224 aa  194  9e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3120  two component transcriptional regulator  45.7 
 
 		 239 aa  194  1e-48  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0114  DNA-binding response regulator TctD  47.27 
 
 		 252 aa  192  4e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1127  DNA-binding response regulator TctD  47.27 
 
 		 223 aa  192  4e-48  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1724  DNA-binding response regulator TctD  47.73 
 
 		 267 aa  192  4e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0825207  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0952  DNA-binding response regulator TctD  47.27 
 
 		 252 aa  192  4e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1501  DNA-binding response regulator TctD  47.27 
 
 		 252 aa  192  4e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.412982  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1037  transcriptional regulatory protein TctD  47.27 
 
 		 252 aa  192  4e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2277  DNA-binding response regulator TctD  47.27 
 
 		 287 aa  192  5e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3267  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.33 
 
 		 220 aa  191  9e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.387524  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54510  two-component response regulator  46.82 
 
 		 223 aa  191  9e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.377152 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0813  DNA-binding response regulator  46.15 
 
 		 247 aa  191  9e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0618873  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0642  DNA-binding response regulator  46.12 
 
 		 291 aa  191  9e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.743353  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0470  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.59 
 
 		 236 aa  190  1e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0809  DNA-binding response regulator  45.7 
 
 		 247 aa  190  1e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3296  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.21 
 
 		 260 aa  190  1e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0174877  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4764  two-component response regulator  46.36 
 
 		 223 aa  191  1e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.343356  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2405  DNA-binding response regulator  46.15 
 
 		 250 aa  189  2e-47  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0552978  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1459  two component transcriptional regulator  45.91 
 
 		 223 aa  189  2e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0271  DNA-binding response regulator  46.15 
 
 		 247 aa  189  2e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0454  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.59 
 
 		 235 aa  190  2e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0018  DNA-binding response regulator  46.15 
 
 		 247 aa  189  2e-47  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2671  DNA-binding response regulator  46.15 
 
 		 247 aa  189  2e-47  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.84234  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0670  two component transcriptional regulator  45.25 
 
 		 266 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.293028 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1627  two component transcriptional regulator  45.91 
 
 		 230 aa  189  4e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0439  two component transcriptional regulator  44.75 
 
 		 253 aa  188  5.999999999999999e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0076  two component transcriptional regulator  45.21 
 
 		 223 aa  187  9e-47  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.225452 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5980  two component transcriptional regulator  44.75 
 
 		 273 aa  187  1e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0635726 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0429  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  46.12 
 
 		 223 aa  186  3e-46  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.199286  decreased coverage  0.000258733 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4343  two component transcriptional regulator  46.79 
 
 		 222 aa  186  3e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4687  two component transcriptional regulator  45.45 
 
 		 223 aa  185  5e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000526997  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0649  two component transcriptional regulator  44.29 
 
 		 252 aa  184  7e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0498  two component transcriptional regulator  43.38 
 
 		 223 aa  184  7e-46  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00313695 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2653  two component transcriptional regulator  44.29 
 
 		 242 aa  184  8e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2682  two component transcriptional regulator  44.29 
 
 		 242 aa  184  8e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2700  two component transcriptional regulator  44.29 
 
 		 282 aa  184  9e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.469389  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2574  two component transcriptional regulator  44.29 
 
 		 242 aa  184  9e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2042  two component transcriptional regulator  44.29 
 
 		 282 aa  184  9e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0143055  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3820  two component transcriptional regulator  45.66 
 
 		 221 aa  182  3e-45  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0357  two component transcriptional regulator  45 
 
 		 226 aa  182  4.0000000000000006e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.369065 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2384  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.89 
 
 		 219 aa  182  4.0000000000000006e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.23421  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4231  DNA-binding response regulator TctD  45.45 
 
 		 223 aa  182  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3958  two component transcriptional regulator  45 
 
 		 224 aa  181  7e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0314218 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2101  two component transcriptional regulator  46.36 
 
 		 226 aa  181  8.000000000000001e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3965  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  45.45 
 
 		 223 aa  180  1e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3309  two component transcriptional regulator  44.09 
 
 		 220 aa  180  2e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3607  DNA-binding transcriptional regulator BasR  44.09 
 
 		 220 aa  179  2e-44  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000202279  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5197  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.64 
 
 		 223 aa  180  2e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.47869  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3741  DNA-binding transcriptional regulator BasR  44.09 
 
 		 220 aa  179  2e-44  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3950  two component transcriptional regulator  44.09 
 
 		 224 aa  180  2e-44  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3516  two component transcriptional regulator  44.34 
 
 		 222 aa  180  2e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.796525  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0876  two component transcriptional regulator  44.09 
 
 		 224 aa  179  2e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.478428 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3980  DNA-binding transcriptional regulator BasR  44.09 
 
 		 220 aa  179  2e-44  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000564215  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1180  two component transcriptional regulator  45.21 
 
 		 221 aa  179  2.9999999999999997e-44  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3437  two component transcriptional regulator  45.66 
 
 		 225 aa  179  2.9999999999999997e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1354  two component transcriptional regulator  45.45 
 
 		 223 aa  179  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.776412  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4638  two component transcriptional regulator  44.09 
 
 		 224 aa  179  2.9999999999999997e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5326  two component transcriptional regulator  45.18 
 
 		 235 aa  179  4e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1060  two component transcriptional regulator  45.66 
 
 		 223 aa  178  4.999999999999999e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3105  two component transcriptional regulator  43.12 
 
 		 219 aa  178  7e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.136173  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1533  two component transcriptional regulator  43.84 
 
 		 223 aa  177  8e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.649703 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3039  two component transcriptional regulator  43.64 
 
 		 220 aa  177  9e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3354  two component transcriptional regulator  43.38 
 
 		 220 aa  177  1e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.44436  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1450  two component transcriptional regulator  45.66 
 
 		 226 aa  177  1e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.286317  normal  0.490701 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1420  winged helix family two component transcriptional regulator  45.66 
 
 		 223 aa  176  2e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.448392  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2713  DNA-binding response regulator  43.18 
 
 		 220 aa  176  2e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.20215  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3674  two component transcriptional regulator  42.66 
 
 		 219 aa  177  2e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4391  two component transcriptional regulator  45.66 
 
 		 223 aa  176  2e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0850  DNA-binding response regulator  47.25 
 
 		 220 aa  176  3e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0308  DNA-binding response regulator  47.25 
 
 		 220 aa  176  3e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0051  DNA-binding response regulator  47.25 
 
 		 220 aa  176  3e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2437  DNA-binding response regulator  47.25 
 
 		 220 aa  176  3e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0845  DNA-binding response regulator  47.25 
 
 		 220 aa  176  3e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3337  two component response regulator  43.44 
 
 		 221 aa  175  4e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.986169  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4301  two component transcriptional regulator  45.21 
 
 		 223 aa  175  5e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.285594  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0469  two component transcriptional regulator  44.95 
 
 		 220 aa  175  6e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.601273  normal  0.0513669 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3999  two component transcriptional regulator  43.64 
 
 		 224 aa  175  6e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.901243 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3349  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.64 
 
 		 224 aa  174  7e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.142225  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0680  two component transcriptional regulator  46.79 
 
 		 225 aa  174  7e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.982653 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6108  two component response regulator  42.92 
 
 		 226 aa  174  7e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.655098  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6288  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.75 
 
 		 224 aa  174  7e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0171319  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3585  two component transcriptional regulator  44.75 
 
 		 224 aa  174  7e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3019  two component transcriptional regulator  43.18 
 
 		 220 aa  174  8e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.933394  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3332  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.66 
 
 		 221 aa  174  9e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0801  two component transcriptional regulator  41.1 
 
 		 221 aa  174  9.999999999999999e-43  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0203691 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3958  two component transcriptional regulator  41.28 
 
 		 237 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49450  response regulator TctD  45.45 
 
 		 223 aa  173  1.9999999999999998e-42  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.537816  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5798  winged helix family two component transcriptional regulator  44.49 
 
 		 242 aa  173  1.9999999999999998e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0751826 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5949  two component transcriptional regulator  46.79 
 
 		 224 aa  172  2.9999999999999996e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.274276 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>