More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_2570 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_2570  two component transcriptional regulator  100 
 
 		 222 aa  435  1e-121  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000747651 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2517  two component transcriptional regulator  65.49 
 
 		 240 aa  282  3.0000000000000004e-75  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0413154  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2008  two component transcriptional regulator  66.67 
 
 		 251 aa  279  2e-74  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.857325  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3011  two component transcriptional regulator, winged helix family  63.72 
 
 		 226 aa  276  1e-73  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.267721  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1641  two component transcriptional regulator  61.23 
 
 		 243 aa  268  5e-71  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.179821  normal  0.0712727 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2073  two component transcriptional regulator, winged helix family  60.79 
 
 		 228 aa  267  1e-70  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.847769  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1233  two component transcriptional regulator  65.47 
 
 		 230 aa  266  2e-70  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.333382 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3012  two component transcriptional regulator  62.22 
 
 		 258 aa  265  4e-70  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.642179 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3437  two component transcriptional regulator  51.13 
 
 		 225 aa  198  7e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3585  two component transcriptional regulator  48.87 
 
 		 224 aa  192  3e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4141  two component transcriptional regulator  47.51 
 
 		 224 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0723203  normal  0.19792 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1764  two component transcriptional regulator  47.51 
 
 		 226 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.807336  hitchhiker  0.00538862 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3669  two component transcriptional regulator  47.51 
 
 		 224 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4247  two component transcriptional regulator  47.06 
 
 		 224 aa  182  4.0000000000000006e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.29812  normal  0.0988817 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4119  two component transcriptional regulator  47.06 
 
 		 224 aa  182  4.0000000000000006e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0386662  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3270  two component transcriptional regulator  47.06 
 
 		 224 aa  182  4.0000000000000006e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.424776  normal  0.538433 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49450  response regulator TctD  48.42 
 
 		 223 aa  181  6e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.537816  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2101  two component transcriptional regulator  50.22 
 
 		 226 aa  181  9.000000000000001e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1724  DNA-binding response regulator TctD  47.3 
 
 		 267 aa  179  2.9999999999999997e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0825207  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1627  two component transcriptional regulator  48.88 
 
 		 230 aa  179  2.9999999999999997e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3084  transcriptional regulator TctD  44.75 
 
 		 224 aa  178  4e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1127  DNA-binding response regulator TctD  46.85 
 
 		 223 aa  179  4e-44  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2964  transcriptional regulator TctD  44.75 
 
 		 224 aa  178  4e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000947102 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2928  transcriptional regulatory protein TctD  44.75 
 
 		 224 aa  178  4e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.501058  normal  0.269412 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2981  transcriptional regulator TctD  44.75 
 
 		 224 aa  178  4e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.510212 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0952  DNA-binding response regulator TctD  46.85 
 
 		 252 aa  178  4.999999999999999e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0114  DNA-binding response regulator TctD  46.85 
 
 		 252 aa  178  4.999999999999999e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1037  transcriptional regulatory protein TctD  46.85 
 
 		 252 aa  178  4.999999999999999e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1501  DNA-binding response regulator TctD  46.85 
 
 		 252 aa  178  4.999999999999999e-44  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.412982  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2897  DNA-binding response regulator TctD  44.75 
 
 		 224 aa  178  5.999999999999999e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2277  DNA-binding response regulator TctD  46.85 
 
 		 287 aa  178  7e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1459  two component transcriptional regulator  46.79 
 
 		 223 aa  176  2e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4343  two component transcriptional regulator  47.03 
 
 		 222 aa  176  3e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3332  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.15 
 
 		 221 aa  175  5e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0160  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.96 
 
 		 229 aa  173  1.9999999999999998e-42  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3212  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.09 
 
 		 233 aa  172  2.9999999999999996e-42  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.419022  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2865  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.09 
 
 		 233 aa  172  3.9999999999999995e-42  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.176419 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1354  two component transcriptional regulator  46.43 
 
 		 223 aa  171  5.999999999999999e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.776412  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4231  DNA-binding response regulator TctD  45.98 
 
 		 223 aa  171  6.999999999999999e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1450  two component transcriptional regulator  47.51 
 
 		 226 aa  171  7.999999999999999e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.286317  normal  0.490701 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3934  DNA-binding response regulator  44.04 
 
 		 223 aa  171  7.999999999999999e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2935  putative response regulator transcription regulator protein  48.43 
 
 		 235 aa  171  1e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3965  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  45.98 
 
 		 223 aa  170  1e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3309  two component transcriptional regulator  41.18 
 
 		 220 aa  168  5e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4391  two component transcriptional regulator  46.15 
 
 		 223 aa  166  2e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3340  two component transcriptional regulator  44.8 
 
 		 224 aa  166  2e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0836001  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1060  two component transcriptional regulator  45.7 
 
 		 223 aa  166  2e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3354  two component transcriptional regulator  41.74 
 
 		 220 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.44436  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4301  two component transcriptional regulator  46.15 
 
 		 223 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.285594  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1420  winged helix family two component transcriptional regulator  46.15 
 
 		 223 aa  166  4e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.448392  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2713  DNA-binding response regulator  42.01 
 
 		 220 aa  165  4e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.20215  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4764  two-component response regulator  44.8 
 
 		 223 aa  166  4e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.343356  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54510  two-component response regulator  44.8 
 
 		 223 aa  166  4e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.377152 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3039  two component transcriptional regulator  41.1 
 
 		 220 aa  165  5e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3516  two component transcriptional regulator  43.38 
 
 		 222 aa  165  6.9999999999999995e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.796525  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0699  two component transcriptional regulator  46.15 
 
 		 220 aa  164  8e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3267  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.7 
 
 		 220 aa  164  9e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.387524  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0008  two component transcriptional regulator  42.53 
 
 		 228 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3924  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.53 
 
 		 228 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.154255  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3337  two component response regulator  41.44 
 
 		 221 aa  162  3e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.986169  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2580  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.12 
 
 		 231 aa  162  4.0000000000000004e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0075  two component transcriptional regulator  42.08 
 
 		 230 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3256  two component transcriptional regulator  42.08 
 
 		 230 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.430005 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0286  response regulator receiver protein  41.82 
 
 		 231 aa  162  5.0000000000000005e-39  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0093  two component transcriptional regulator  42.08 
 
 		 230 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.51453 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2980  two component transcriptional regulator  42.08 
 
 		 230 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0074  two component transcriptional regulator  42.08 
 
 		 230 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.948307  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0066  two component transcriptional regulator  42.08 
 
 		 230 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.530384  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0075  two component transcriptional regulator  42.08 
 
 		 230 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.280185  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4239  two component transcriptional regulator  42.15 
 
 		 220 aa  161  6e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0202421  normal  0.361244 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3120  two component transcriptional regulator  41.18 
 
 		 239 aa  161  6e-39  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18630  Response regulator, two-component  41.74 
 
 		 219 aa  161  7e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2401  two component transcriptional regulator  45.29 
 
 		 227 aa  161  7e-39  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3057  two component transcriptional regulator  42.08 
 
 		 228 aa  161  7e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1533  two component transcriptional regulator  42.92 
 
 		 223 aa  161  8.000000000000001e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.649703 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3386  DNA-binding response regulator  42.08 
 
 		 230 aa  160  1e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1619  DNA-binding response regulator  42.08 
 
 		 230 aa  160  1e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2924  DNA-binding response regulator  42.08 
 
 		 230 aa  160  1e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2983  DNA-binding response regulator  42.08 
 
 		 230 aa  160  1e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1364  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.66 
 
 		 224 aa  160  1e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0208  DNA-binding response regulator  42.08 
 
 		 230 aa  160  1e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.857207  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3019  two component transcriptional regulator  41.1 
 
 		 220 aa  160  1e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.933394  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4078  DNA-binding response regulator  42.08 
 
 		 230 aa  160  1e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0729773  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3339  DNA-binding response regulator  42.08 
 
 		 230 aa  160  1e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_4004  DNA-binding response regulator  42.08 
 
 		 230 aa  160  1e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0257  two component transcriptional regulator  41.36 
 
 		 231 aa  160  2e-38  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5339  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.37 
 
 		 222 aa  160  2e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3535  two component transcriptional regulator  44.78 
 
 		 234 aa  159  2e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.58717  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63150  two-component response regulator  42.59 
 
 		 221 aa  160  2e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.388672  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2755  two component transcriptional regulator  40.83 
 
 		 221 aa  159  3e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.795661  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3341  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.24 
 
 		 225 aa  159  4e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.219699 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0310  two component transcriptional regulator  44.5 
 
 		 223 aa  159  4e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.859655 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3802  two component transcriptional regulator  43.56 
 
 		 227 aa  159  4e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.711494  normal  0.282515 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6108  two component response regulator  43.12 
 
 		 226 aa  159  4e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.655098  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3389  two component transcriptional regulator  43.86 
 
 		 234 aa  159  4e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.413911  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6140  two component transcriptional regulator  45.21 
 
 		 221 aa  159  4e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0752147  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0604  two component transcriptional regulator  37.33 
 
 		 227 aa  159  5e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00704602  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0632  two component transcriptional regulator  37.33 
 
 		 227 aa  159  5e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.157641  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3958  two component transcriptional regulator  42.66 
 
 		 237 aa  158  5e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5497  DNA-binding response regulator  42.13 
 
 		 221 aa  158  7e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.553345  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>