More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_2201 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012912  Dd1591_2201  response regulator of RpoS  100 
 
 		 338 aa  686    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1959  response regulator of RpoS  80.77 
 
 		 338 aa  570  1e-161  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1979  response regulator of RpoS  74.26 
 
 		 338 aa  508  1e-143  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.46167  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2280  response regulator of RpoS  74.26 
 
 		 338 aa  504  1e-141  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0715238  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2710  response regulator of RpoS  68.05 
 
 		 337 aa  446  1.0000000000000001e-124  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.317611  hitchhiker  0.000232648 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2331  response regulator of RpoS  66.57 
 
 		 338 aa  443  1e-123  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000591908  normal  0.501576 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1969  response regulator of RpoS  65.98 
 
 		 338 aa  439  9.999999999999999e-123  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.313928  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2078  response regulator of RpoS  66.27 
 
 		 338 aa  441  9.999999999999999e-123  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2308  response regulator of RpoS  66.57 
 
 		 337 aa  432  1e-120  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.863566  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01211  response regulator of RpoS  64.5 
 
 		 337 aa  429  1e-119  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.480052  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1384  response regulator of RpoS  64.5 
 
 		 337 aa  429  1e-119  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.421294  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1343  response regulator of RpoS  64.5 
 
 		 337 aa  429  1e-119  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00109338  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1906  response regulator of RpoS  64.5 
 
 		 337 aa  429  1e-119  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.174648  normal  0.215745 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2392  response regulator of RpoS  64.5 
 
 		 337 aa  429  1e-119  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000237009 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01221  hypothetical protein  64.5 
 
 		 337 aa  429  1e-119  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.417729  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1400  response regulator of RpoS  64.5 
 
 		 337 aa  428  1e-119  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1720  response regulator of RpoS  64.5 
 
 		 337 aa  429  1e-119  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0232509  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1392  response regulator of RpoS  63.91 
 
 		 337 aa  421  1e-117  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00188361  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1575  response regulator of RpoS  64.2 
 
 		 337 aa  422  1e-117  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.307447  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1886  response regulator of RpoS  63.91 
 
 		 337 aa  421  1e-117  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0489347  normal  0.205124 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1880  response regulator of RpoS  63.91 
 
 		 337 aa  421  1e-117  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.239117  normal  0.804945 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1943  response regulator of RpoS  63.91 
 
 		 337 aa  421  1e-117  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.941531 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0568  response regulator  33.86 
 
 		 368 aa  152  8e-36  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00216047  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002881  response regulator  32.08 
 
 		 368 aa  150  3e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03091  hypothetical protein  31.68 
 
 		 368 aa  149  9e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1082  response regulator  30.54 
 
 		 367 aa  147  3e-34  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3036  response regulator receiver protein  30.97 
 
 		 367 aa  114  3e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.697745  hitchhiker  0.00756104 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1391  response regulator receiver protein  31.42 
 
 		 368 aa  113  5e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2546  response regulator receiver protein  27.69 
 
 		 376 aa  112  9e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2117  response regulator  28.9 
 
 		 394 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0129975  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1648  response regulator receiver protein  30.71 
 
 		 367 aa  110  3e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0057956  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2359  putative two-component response regulator  29.62 
 
 		 394 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3038  response regulator receiver protein  27.31 
 
 		 367 aa  109  8.000000000000001e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0232368  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3849  response regulator receiver (CheY) modulated Serine phosphatase  29.31 
 
 		 412 aa  108  2e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.658628 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27940  putative two-component response regulator  29.03 
 
 		 394 aa  108  2e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2896  response regulator receiver protein  26.92 
 
 		 367 aa  107  2e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00201335  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2906  response regulator receiver protein  26.92 
 
 		 367 aa  107  3e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0132666  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1467  response regulator receiver protein  26.92 
 
 		 367 aa  107  4e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0140274  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1706  response regulator receiver modulated serine phosphatase  29.94 
 
 		 393 aa  105  1e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000168842 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1912  response regulator receiver:stage II sporulation E  27.41 
 
 		 394 aa  104  2e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.432168  hitchhiker  0.00180426 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3577  response regulator receiver protein  29.94 
 
 		 393 aa  104  2e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.00266085  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2165  response regulator  29.94 
 
 		 393 aa  104  3e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0249002  normal  0.813701 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1396  response regulator receiver protein  25.45 
 
 		 367 aa  103  3e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00425013  normal  0.314583 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1929  response regulator receiver protein  28.94 
 
 		 394 aa  103  5e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.310245 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1682  response regulator receiver modulated serine phosphatase  30 
 
 		 412 aa  102  1e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1312  response regulator receiver protein  26.72 
 
 		 367 aa  102  1e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000399806  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1379  response regulator receiver protein  26.72 
 
 		 367 aa  102  1e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00673289  normal  0.16507 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3196  response regulator  27.06 
 
 		 367 aa  100  3e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1372  response regulator receiver protein  27.24 
 
 		 367 aa  99  1e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0119088  hitchhiker  0.0000873565 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2267  response regulator receiver protein  27.1 
 
 		 367 aa  97.4  3e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0287525  normal  0.0560142 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1419  signal transduction histidine kinase  34.17 
 
 		 551 aa  97.4  3e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32720  Response regulator  25.95 
 
 		 394 aa  95.9  9e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1112  response regulator receiver domain-containing protein  25.08 
 
 		 399 aa  95.9  1e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2806  response regulator receiver protein  27.12 
 
 		 373 aa  92.8  7e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1356  response regulator receiver  26.69 
 
 		 386 aa  91.7  2e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.235342  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2828  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  33.83 
 
 		 410 aa  87.4  3e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1544  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  41.38 
 
 		 739 aa  87.4  3e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.498595 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3074  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  37.82 
 
 		 363 aa  83.6  0.000000000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2461  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase  28.97 
 
 		 581 aa  82.8  0.000000000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2325  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  39.09 
 
 		 362 aa  82  0.00000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.663275  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0913  response regulator receiver sensor hybrid histidine kinase  38.66 
 
 		 544 aa  81.6  0.00000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1013  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  36.04 
 
 		 456 aa  79.3  0.00000000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0616674 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0607  two component transcriptional regulator  38.68 
 
 		 248 aa  79.3  0.00000000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2673  response regulator receiver modulated serine phosphatase  30.29 
 
 		 392 aa  77.8  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2224  putative two-component regulatory system, sensor kinase protein  38.46 
 
 		 1082 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0532  response regulator receiver /GGDEF/PAS/PAC domain-containing protein  35.34 
 
 		 715 aa  78.2  0.0000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0193  response regulator receiver protein  37.39 
 
 		 127 aa  78.2  0.0000000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00528064  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0165  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.96 
 
 		 826 aa  78.6  0.0000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0017  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  32.03 
 
 		 459 aa  77.8  0.0000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.120309  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0913  response regulator receiver protein  39.81 
 
 		 301 aa  77.8  0.0000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.348072  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2296  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  35.24 
 
 		 394 aa  77.4  0.0000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2620  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  39.6 
 
 		 532 aa  77.8  0.0000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0658498  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2021  Hpt sensor hybrid histidine kinase  38.46 
 
 		 1082 aa  77.8  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2077  sensor histidine kinase/response regulator  38.46 
 
 		 1082 aa  77.8  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.981024  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2526  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  39.13 
 
 		 715 aa  76.6  0.0000000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.263284  normal  0.0502692 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2396  response regulator receiver protein  40.54 
 
 		 126 aa  76.6  0.0000000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.612966  normal  0.464694 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3648  response regulator receiver modulated serine phosphatase  26.71 
 
 		 380 aa  76.3  0.0000000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0995  two component transcriptional regulator, AraC family  32.71 
 
 		 542 aa  75.5  0.000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0843  response regulator receiver protein  37.74 
 
 		 251 aa  75.5  0.000000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000594696  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3080  histidine kinase  37.72 
 
 		 1088 aa  75.1  0.000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0169759  normal  0.77184 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1969  response regulator receiver domain-containing protein  39.81 
 
 		 219 aa  75.5  0.000000000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.478098  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4135  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  40.95 
 
 		 922 aa  75.5  0.000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000000370631  normal  0.0140414 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0332  response regulator receiver protein  32.9 
 
 		 806 aa  75.9  0.000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.112355  normal  0.937153 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1134  two-component sensor  40 
 
 		 795 aa  75.5  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0980947  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1382  response regulator receiver protein  39.05 
 
 		 122 aa  75.5  0.000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.997925  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0931  response regulator receiver protein  34.78 
 
 		 120 aa  75.1  0.000000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.252152  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1802  two component transcriptional regulator  37.59 
 
 		 227 aa  74.7  0.000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0628  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  37.86 
 
 		 446 aa  74.7  0.000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2942  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  31.51 
 
 		 451 aa  75.1  0.000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2943  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  35.64 
 
 		 438 aa  75.1  0.000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.641955  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11290  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  38.46 
 
 		 234 aa  73.9  0.000000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1579  response regulator receiver  37.25 
 
 		 225 aa  74.3  0.000000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.410227  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3975  Cache sensor hybrid histidine kinase  36.84 
 
 		 811 aa  73.9  0.000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000222358  hitchhiker  0.00723661 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3309  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  37.59 
 
 		 900 aa  74.3  0.000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.269875  normal  0.342346 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2149  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  31.37 
 
 		 477 aa  73.9  0.000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3018  hybrid sensory kinase in two-component regulatory system with RcsB and YojN  39.22 
 
 		 955 aa  74.3  0.000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0433784  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4388  DNA-binding response regulator  41.58 
 
 		 227 aa  73.6  0.000000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0452  response regulator receiver protein  37.74 
 
 		 122 aa  73.6  0.000000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.17051  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3173  histidine kinase  37.04 
 
 		 606 aa  73.9  0.000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.286696  normal  0.896245 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0647  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.84 
 
 		 790 aa  73.6  0.000000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>