More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeHA_C1943 on replicon NC_011083
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011083  SeHA_C1943  response regulator of RpoS  100 
 
 		 337 aa  685    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.941531 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1392  response regulator of RpoS  100 
 
 		 337 aa  685    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00188361  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1886  response regulator of RpoS  100 
 
 		 337 aa  685    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0489347  normal  0.205124 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1575  response regulator of RpoS  99.7 
 
 		 337 aa  684    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.307447  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1880  response regulator of RpoS  100 
 
 		 337 aa  685    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.239117  normal  0.804945 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01211  response regulator of RpoS  90.5 
 
 		 337 aa  609  1e-173  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.480052  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1400  response regulator of RpoS  90.21 
 
 		 337 aa  607  1e-173  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1384  response regulator of RpoS  90.5 
 
 		 337 aa  609  1e-173  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.421294  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01221  hypothetical protein  90.5 
 
 		 337 aa  609  1e-173  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.417729  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1906  response regulator of RpoS  90.5 
 
 		 337 aa  609  1e-173  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.174648  normal  0.215745 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1343  response regulator of RpoS  90.5 
 
 		 337 aa  609  1e-173  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00109338  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2392  response regulator of RpoS  90.5 
 
 		 337 aa  609  1e-173  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000237009 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1720  response regulator of RpoS  90.5 
 
 		 337 aa  609  1e-173  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0232509  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2308  response regulator of RpoS  87.24 
 
 		 337 aa  568  1e-161  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.863566  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2710  response regulator of RpoS  68.55 
 
 		 337 aa  469  1.0000000000000001e-131  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.317611  hitchhiker  0.000232648 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2331  response regulator of RpoS  62.91 
 
 		 338 aa  434  1e-121  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000591908  normal  0.501576 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2078  response regulator of RpoS  62.91 
 
 		 338 aa  434  1e-120  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1969  response regulator of RpoS  62.61 
 
 		 338 aa  432  1e-120  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.313928  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1979  response regulator of RpoS  62.13 
 
 		 338 aa  429  1e-119  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.46167  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1959  response regulator of RpoS  62.72 
 
 		 338 aa  427  1e-118  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2201  response regulator of RpoS  63.91 
 
 		 338 aa  421  1e-116  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2280  response regulator of RpoS  62.43 
 
 		 338 aa  421  1e-116  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0715238  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0568  response regulator  31.75 
 
 		 368 aa  151  1e-35  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00216047  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1082  response regulator  29.77 
 
 		 367 aa  140  3e-32  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002881  response regulator  28.43 
 
 		 368 aa  133  3.9999999999999996e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03091  hypothetical protein  28.53 
 
 		 368 aa  130  2.0000000000000002e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1648  response regulator receiver protein  30.67 
 
 		 367 aa  110  3e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0057956  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1706  response regulator receiver modulated serine phosphatase  28.53 
 
 		 393 aa  107  3e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000168842 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3036  response regulator receiver protein  31.11 
 
 		 367 aa  107  4e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.697745  hitchhiker  0.00756104 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3849  response regulator receiver (CheY) modulated Serine phosphatase  29.17 
 
 		 412 aa  107  4e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.658628 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2546  response regulator receiver protein  27.03 
 
 		 376 aa  105  8e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2165  response regulator  28.21 
 
 		 393 aa  104  2e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0249002  normal  0.813701 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1467  response regulator receiver protein  27.8 
 
 		 367 aa  104  2e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0140274  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3038  response regulator receiver protein  27.8 
 
 		 367 aa  104  2e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0232368  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1682  response regulator receiver modulated serine phosphatase  27.55 
 
 		 412 aa  104  2e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2117  response regulator  26.48 
 
 		 394 aa  104  3e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0129975  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2359  putative two-component response regulator  27.57 
 
 		 394 aa  103  4e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2896  response regulator receiver protein  27.41 
 
 		 367 aa  103  4e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00201335  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27940  putative two-component response regulator  27.57 
 
 		 394 aa  103  5e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1391  response regulator receiver protein  29 
 
 		 368 aa  103  5e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2906  response regulator receiver protein  27.41 
 
 		 367 aa  103  6e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0132666  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1929  response regulator receiver protein  26.19 
 
 		 394 aa  102  1e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.310245 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3577  response regulator receiver protein  27.9 
 
 		 393 aa  102  1e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.00266085  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1912  response regulator receiver:stage II sporulation E  26.17 
 
 		 394 aa  101  2e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.432168  hitchhiker  0.00180426 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2267  response regulator receiver protein  28.76 
 
 		 367 aa  98.6  1e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0287525  normal  0.0560142 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1312  response regulator receiver protein  26.77 
 
 		 367 aa  98.2  2e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000399806  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1379  response regulator receiver protein  26.77 
 
 		 367 aa  98.2  2e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00673289  normal  0.16507 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1396  response regulator receiver protein  25.77 
 
 		 367 aa  96.7  5e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00425013  normal  0.314583 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3196  response regulator  26.77 
 
 		 367 aa  96.3  6e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1112  response regulator receiver domain-containing protein  23.25 
 
 		 399 aa  94  4e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32720  Response regulator  28.38 
 
 		 394 aa  92.4  9e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2806  response regulator receiver protein  24.68 
 
 		 373 aa  92  1e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1372  response regulator receiver protein  25.59 
 
 		 367 aa  91.3  2e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0119088  hitchhiker  0.0000873565 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2828  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  33.99 
 
 		 410 aa  90.5  4e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4368  two component transcriptional regulator  36.36 
 
 		 245 aa  83.2  0.000000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1356  response regulator receiver  26.34 
 
 		 386 aa  83.2  0.000000000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.235342  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5049  two component transcriptional regulator  36.36 
 
 		 259 aa  83.2  0.000000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.839238  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5811  two component transcriptional regulator  36.36 
 
 		 245 aa  83.2  0.000000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.244111  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0913  response regulator receiver sensor hybrid histidine kinase  38.53 
 
 		 544 aa  82  0.00000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3465  putative PAS/PAC sensor protein  31.91 
 
 		 489 aa  82.4  0.00000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5311  two component transcriptional regulator  38.61 
 
 		 246 aa  82.4  0.00000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.554395  normal  0.310406 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3050  two component transcriptional regulator  35.61 
 
 		 245 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.545982  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2459  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.21 
 
 		 489 aa  80.9  0.00000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.854352 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4353  two component transcriptional regulator  39 
 
 		 245 aa  80.5  0.00000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3620  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.62 
 
 		 239 aa  80.1  0.00000000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0253056  normal  0.477246 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1564  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.62 
 
 		 223 aa  79.7  0.00000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.194978  normal  0.692086 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2735  two component transcriptional regulator  40 
 
 		 228 aa  80.1  0.00000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.223671 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3379  two component heavy metal response transcriptional regulator  41 
 
 		 223 aa  79.3  0.00000000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0509  two component transcriptional regulator  42.57 
 
 		 232 aa  79.3  0.00000000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.163629  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1155  two component transcriptional regulator  37.76 
 
 		 235 aa  79  0.0000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.503115  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0377  DNA-binding response regulator  32.5 
 
 		 226 aa  79  0.0000000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.306284  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1013  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  35 
 
 		 456 aa  78.6  0.0000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0616674 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1364  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.86 
 
 		 224 aa  77.8  0.0000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1483  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  29.21 
 
 		 335 aa  78.6  0.0000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.882912  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0738  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  37.72 
 
 		 925 aa  78.2  0.0000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2096  CheA signal transduction histidine kinases  35.04 
 
 		 2301 aa  78.6  0.0000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3309  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  34.19 
 
 		 900 aa  78.2  0.0000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.269875  normal  0.342346 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4657  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.35 
 
 		 240 aa  77.8  0.0000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2943  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  37.86 
 
 		 438 aa  78.2  0.0000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.641955  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0581  winged helix family two component transcriptional regulator  36.27 
 
 		 242 aa  77.4  0.0000000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.296955  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0607  two component transcriptional regulator  38.24 
 
 		 248 aa  77.4  0.0000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1749  two component heavy metal response transcriptional regulator  41.58 
 
 		 242 aa  77  0.0000000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1878  two component transcriptional regulator  36.27 
 
 		 242 aa  77  0.0000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.559477 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3648  response regulator receiver modulated serine phosphatase  25.48 
 
 		 380 aa  77.4  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2612  two component transcriptional regulator, winged helix family  40 
 
 		 228 aa  76.6  0.0000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0412974  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1813  putative hybrid two-component sensor and regulatory protein  35.04 
 
 		 2284 aa  77  0.0000000000005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.409027  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1954  two component transcriptional regulator  39 
 
 		 253 aa  76.6  0.0000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.897911  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05454  two component response regulator transcription regulator protein  38 
 
 		 256 aa  76.6  0.0000000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.169333 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2384  two component transcriptional regulator  37.25 
 
 		 259 aa  76.3  0.0000000000007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1090  response regulator receiver protein  35.65 
 
 		 846 aa  76.3  0.0000000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.874134  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0954  two component transcriptional regulator  36.27 
 
 		 243 aa  75.9  0.0000000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0817018 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3074  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  32.17 
 
 		 363 aa  75.9  0.0000000000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6397  response regulator receiver protein  35.92 
 
 		 237 aa  75.5  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.680662  normal  0.0804167 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0628  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  37.61 
 
 		 446 aa  75.1  0.000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4301  two component transcriptional regulator  38.61 
 
 		 230 aa  75.5  0.000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.681825  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0123  two component transcriptional regulator  37.96 
 
 		 241 aa  75.5  0.000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2416  two component transcriptional regulator  39.6 
 
 		 226 aa  75.1  0.000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.134995  hitchhiker  0.000110965 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4387  two component transcriptional regulator  38.61 
 
 		 230 aa  75.5  0.000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0316317  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0999  response regulator receiver modulated serine phosphatase  33.57 
 
 		 602 aa  75.1  0.000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.118416  hitchhiker  0.00369461 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1461  two component heavy metal response transcriptional regulator  40.59 
 
 		 227 aa  75.5  0.000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>