265 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_0887 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011059  Paes_0887  Tetratricopeptide domain protein  100 
 
 
1339 aa  2740    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.102317 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08322  conserved hypothetical protein  28.93 
 
 
1050 aa  177  9.999999999999999e-43  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1718  tetratricopeptide TPR_4  28.11 
 
 
799 aa  159  4e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_10448  TPR domain protein (AFU_orthologue; AFUA_3G01710)  25.04 
 
 
1488 aa  147  1e-33  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.162575 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0362  TPR repeat-containing protein  39.5 
 
 
804 aa  134  7.999999999999999e-30  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.587657  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02941  hypothetical protein  23.19 
 
 
1676 aa  132  6e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.673691 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_09426  conserved hypothetical protein  27.98 
 
 
1262 aa  121  9.999999999999999e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.442713  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01071  conserved hypothetical protein  25 
 
 
1185 aa  119  3.9999999999999997e-25  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0324435  normal  0.67029 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0200  TPR repeat-containing protein  23.24 
 
 
505 aa  119  3.9999999999999997e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3497  peptidase-like  22.35 
 
 
1328 aa  115  5e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1102  tetratricopeptide TPR_2  25.29 
 
 
1507 aa  112  5e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03547  conserved hypothetical protein  27.09 
 
 
1288 aa  106  3e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.204102  normal  0.74316 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4362  tetratricopeptide TPR_2  25 
 
 
725 aa  105  7e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.714509 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1300  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  22.98 
 
 
771 aa  103  2e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0083  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  22.27 
 
 
2240 aa  102  5e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01580  conserved hypothetical protein  25.75 
 
 
1128 aa  100  2e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0427699 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0977  TPR repeat-containing protein  23.78 
 
 
1215 aa  96.3  3e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.153699  normal  0.773463 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3708  hypothetical protein  28.57 
 
 
1039 aa  95.9  5e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0074  TPR repeat-containing protein  23.29 
 
 
567 aa  94.7  1e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00635622 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6918  TPR repeat-containing protein  23.92 
 
 
847 aa  94  2e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.378966  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0840  TPR repeat-containing protein  21.55 
 
 
1371 aa  94  2e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1822  NB-ARC  30.46 
 
 
977 aa  89.7  4e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.244157  normal  0.101864 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1233  intermediate filament protein  22.63 
 
 
573 aa  89  5e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.190296 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0447  TPR domain-containing protein  23.18 
 
 
992 aa  87.4  0.000000000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000620141  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0166  TPR repeat-containing protein  25.95 
 
 
454 aa  87.4  0.000000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0362369  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5149  TPR repeat-containing protein  20.85 
 
 
1105 aa  86.3  0.000000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000182587  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1432  TPR domain-containing protein  22.76 
 
 
573 aa  85.9  0.000000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02811  hypothetical protein  26.46 
 
 
837 aa  85.9  0.000000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.370164 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0785  TPR repeat-containing protein  22.37 
 
 
796 aa  84.3  0.00000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.225465  hitchhiker  0.00421983 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  19.11 
 
 
1737 aa  84  0.00000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1589  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  22.09 
 
 
572 aa  83.6  0.00000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.499739 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1356  beta-lactamase domain-containing protein  22.46 
 
 
833 aa  83.6  0.00000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19711  hypothetical protein  29.17 
 
 
865 aa  81.6  0.0000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.372007  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2048  TPR repeat-containing protein  20.73 
 
 
573 aa  80.9  0.0000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.732994  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2862  TPR repeat-containing protein  23.28 
 
 
448 aa  80.1  0.0000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.375816 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1746  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.33 
 
 
767 aa  78.6  0.0000000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19131  hypothetical protein  29.07 
 
 
936 aa  78.2  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.105709 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0689  TPR repeat-containing protein  25.58 
 
 
632 aa  77.4  0.000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000734837  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0122  glycosyl transferase, group 1  19.35 
 
 
3301 aa  77  0.000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.326818 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3719  TPR repeat-containing protein  30.1 
 
 
405 aa  77  0.000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4084  TPR repeat-containing protein  25.15 
 
 
843 aa  76.3  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2656  TPR repeat-containing protein  21.33 
 
 
568 aa  75.1  0.000000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000162187  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1087  TPR repeat-containing protein  20.85 
 
 
808 aa  75.1  0.000000000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3815  TPR repeat-containing protein  27.67 
 
 
399 aa  75.1  0.000000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1506  tetratricopeptide TPR_4  22.24 
 
 
729 aa  74.7  0.00000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2707  glycosyl transferase family protein  24.07 
 
 
1486 aa  74.3  0.00000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.228337 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3262  tetratricopeptide TPR_2  25.57 
 
 
919 aa  74.7  0.00000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.857288  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4603  TPR repeat-containing protein  21.27 
 
 
722 aa  73.6  0.00000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.524488 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3213  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  21.97 
 
 
639 aa  73.9  0.00000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000022774  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2876  NB-ARC domain protein  22.86 
 
 
822 aa  73.9  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08457  Pfs, NB-ARC and TPR domain protein (JCVI)  26.65 
 
 
1131 aa  72.8  0.00000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3469  TPR repeat-containing protein  21.57 
 
 
1161 aa  72.4  0.00000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0276  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.62 
 
 
624 aa  72.4  0.00000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1096  sulfotransferase  21.53 
 
 
1764 aa  72  0.00000000007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0523  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.18 
 
 
582 aa  70.9  0.0000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2645  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  21.24 
 
 
572 aa  70.9  0.0000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000110346  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2032  TPR repeat-containing protein  21.76 
 
 
883 aa  70.9  0.0000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.192732  normal  0.125101 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3216  TPR repeat-containing protein  26.79 
 
 
643 aa  70.5  0.0000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000674385  hitchhiker  0.00000466075 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3191  TPR domain-containing protein  25.94 
 
 
638 aa  69.3  0.0000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2583  TPR repeat-containing protein  23.53 
 
 
729 aa  68.9  0.0000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2478  TPR repeat-containing protein  21.12 
 
 
884 aa  69.3  0.0000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.599046  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1582  TPR repeat-containing protein  22.09 
 
 
767 aa  68.9  0.0000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000189935  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2659  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.17 
 
 
565 aa  68.6  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.144865 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2418  TPR repeat-containing protein  22.68 
 
 
827 aa  68.6  0.0000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0238  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  21.53 
 
 
787 aa  68.2  0.0000000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.463685  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0293  TPR repeat-containing protein  22.62 
 
 
789 aa  67.8  0.000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0195  TPR domain protein  23.72 
 
 
379 aa  68.2  0.000000001  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.315867  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3372  TPR repeat-containing protein  20.28 
 
 
4095 aa  67.4  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2098  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  20.43 
 
 
566 aa  67  0.000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000120088  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1245  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.99 
 
 
568 aa  66.6  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0199548 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1215  TPR repeat-containing protein  25.99 
 
 
568 aa  66.6  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3455  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  19.6 
 
 
4104 aa  66.2  0.000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08545  conserved hypothetical protein  29.21 
 
 
1136 aa  65.9  0.000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4770  sulfotransferase  21.4 
 
 
887 aa  65.9  0.000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.185793 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0616  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.98 
 
 
647 aa  65.5  0.000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  6.1691e-34 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3311  TPR repeat-containing protein  18.78 
 
 
4074 aa  65.1  0.000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1499  TPR repeat-containing protein  21.1 
 
 
486 aa  64.7  0.00000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.329638 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1169  TPR repeat-containing protein  25.62 
 
 
444 aa  63.5  0.00000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0025  TPR repeat-containing protein  22.42 
 
 
842 aa  63.5  0.00000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000698246  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0446  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  21.43 
 
 
885 aa  63.9  0.00000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2579  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.81 
 
 
786 aa  63.2  0.00000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02961  hypothetical protein  27.46 
 
 
594 aa  63.5  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0817  TPR repeat-containing protein  21.44 
 
 
594 aa  63.5  0.00000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.02661  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0684  TPR repeat-containing protein  26.7 
 
 
626 aa  62.8  0.00000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.073347 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3267  glycosyl transferase family 2  22.63 
 
 
1252 aa  62.8  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0602  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.53 
 
 
645 aa  62.4  0.00000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000607684  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2854  glycosyl transferase family 2  22.63 
 
 
1252 aa  62.4  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.956112  normal  0.0955707 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0995  tetratricopeptide TPR_2  24.4 
 
 
614 aa  62.4  0.00000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.129848  normal  0.103443 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1105  TPR repeat-containing protein  26.06 
 
 
911 aa  62.4  0.00000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03881  conserved hypothetical protein  22.65 
 
 
1125 aa  62  0.00000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.693693 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9475  predicted protein  23.19 
 
 
336 aa  62  0.00000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  23.52 
 
 
810 aa  61.2  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  23.75 
 
 
878 aa  60.5  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0336  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.69 
 
 
557 aa  60.8  0.0000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000572448  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4573  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  21.19 
 
 
3590 aa  60.5  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24081  hypothetical protein  18.83 
 
 
764 aa  60.1  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1429  PDZ/DHR/GLGF domain protein  27.16 
 
 
668 aa  60.1  0.0000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.00000000000479067  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3333  TPR repeat-containing protein  27.67 
 
 
274 aa  60.1  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.34116  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0913  TPR repeat-containing protein  22.67 
 
 
280 aa  60.1  0.0000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.249159  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2716  TPR domain/sulfotransferase domain protein  22.74 
 
 
762 aa  60.1  0.0000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>