112 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_3816 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_4573  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.04 
 
 		 3590 aa  681    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3816  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 3936 aa  7604    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3311  TPR repeat-containing protein  27.41 
 
 		 4074 aa  333  3e-89  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3372  TPR repeat-containing protein  26.03 
 
 		 4095 aa  301  2e-79  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3455  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.66 
 
 		 4104 aa  266  4.999999999999999e-69  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4143  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.5 
 
 		 2837 aa  147  3e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0473869 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5443  TPR repeat-containing protein  25.24 
 
 		 2316 aa  143  7.999999999999999e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.162158 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02941  hypothetical protein  22.65 
 
 		 1676 aa  86.7  0.000000000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.673691 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5958  Tetratricopeptide TPR_4  25.28 
 
 		 2620 aa  86.3  0.00000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3901  Tetratricopeptide repeat protein  27.23 
 
 		 2235 aa  63.2  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0305093 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0840  TPR repeat-containing protein  22.29 
 
 		 1371 aa  62.4  0.0000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3902  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.01 
 
 		 1921 aa  62  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0699787 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1078  TPR repeat-containing protein  28.31 
 
 		 423 aa  59.3  0.000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.327406  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24101  hypothetical protein  26.78 
 
 		 725 aa  58.5  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1499  TPR repeat-containing protein  23.18 
 
 		 486 aa  58.2  0.000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.329638 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1518  TPR repeat-containing protein  25.77 
 
 		 597 aa  58.5  0.000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00971618 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1366  hypothetical protein  25.71 
 
 		 825 aa  56.6  0.000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2562  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.36 
 
 		 364 aa  55.8  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1144  stage V sporulation protein K  25.18 
 
 		 1930 aa  55.8  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1233  intermediate filament protein  23.38 
 
 		 573 aa  55.8  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.190296 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1506  tetratricopeptide TPR_4  24.55 
 
 		 729 aa  55.8  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0887  Tetratricopeptide domain protein  27.72 
 
 		 1339 aa  55.5  0.00002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.102317 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2854  glycosyl transferase family 2  22.05 
 
 		 1252 aa  55.8  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.956112  normal  0.0955707 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1432  TPR domain-containing protein  23.08 
 
 		 573 aa  55.1  0.00003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4603  TPR repeat-containing protein  21.33 
 
 		 722 aa  55.1  0.00003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.524488 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  20.57 
 
 		 1737 aa  55.1  0.00003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2659  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.5 
 
 		 565 aa  54.7  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.144865 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2491  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.4 
 
 		 689 aa  54.7  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2853  TPR repeat-containing protein  21.96 
 
 		 3172 aa  54.7  0.00004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2048  TPR repeat-containing protein  25.71 
 
 		 573 aa  54.7  0.00004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.732994  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1087  TPR repeat-containing protein  25.87 
 
 		 808 aa  54.7  0.00004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2480  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  24.09 
 
 		 1022 aa  54.7  0.00004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3796  tetratricopeptide TPR_2  29.93 
 
 		 1040 aa  54.3  0.00005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  20.44 
 
 		 878 aa  53.9  0.00007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2861  sulfotransferase  21.05 
 
 		 681 aa  53.5  0.00009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.392476 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24191  hypothetical protein  24.72 
 
 		 545 aa  52.8  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1660  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.92 
 
 		 370 aa  52.8  0.0001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  22.33 
 
 		 810 aa  53.1  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23981  hypothetical protein  24.72 
 
 		 587 aa  52.4  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.167552 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3267  glycosyl transferase family 2  21.67 
 
 		 1252 aa  52.4  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0122  glycosyl transferase, group 1  23.84 
 
 		 3301 aa  51.6  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.326818 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1376  TPR repeat-containing protein  22.41 
 
 		 1261 aa  51.6  0.0003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0670144  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0083  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.69 
 
 		 2240 aa  51.6  0.0003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4304  TPR repeat-containing protein  25.45 
 
 		 430 aa  51.2  0.0004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2906  TPR repeat-containing protein  31.96 
 
 		 614 aa  50.8  0.0005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0475913  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0453  TPR domain-containing protein  31.96 
 
 		 626 aa  50.4  0.0006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.311085  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3015  TPR domain-containing protein  31.96 
 
 		 626 aa  50.4  0.0006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2599  TPR domain-containing protein  31.96 
 
 		 614 aa  50.8  0.0006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0734298  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0970  TPR domain-containing protein  31.96 
 
 		 614 aa  50.8  0.0006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0177  TPR repeat-containing protein  31.96 
 
 		 614 aa  50.8  0.0006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1334  tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.41 
 
 		 512 aa  50.4  0.0006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.278248  normal  0.0416734 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3643  TPR domain-containing protein  21.43 
 
 		 1979 aa  50.4  0.0007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1308  Flp pilus assembly protein TadD  30.63 
 
 		 272 aa  50.4  0.0007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.59735e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1619  TPR domain-containing protein  30.38 
 
 		 626 aa  50.4  0.0007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0978258  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0685  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.93 
 
 		 883 aa  50.4  0.0007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3201  TPR repeat-containing protein  28.42 
 
 		 955 aa  50.1  0.0009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0757905 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3321  TPR repeat-containing protein  36.04 
 
 		 453 aa  49.7  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0116  TPR repeat-containing protein  21.09 
 
 		 289 aa  49.7  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.75872 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  29.91 
 
 		 3145 aa  49.3  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2859  sulfotransferase  20.27 
 
 		 832 aa  50.1  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.398491 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_66638  glucose repression mediator protein  27.93 
 
 		 815 aa  50.1  0.001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_5235  predicted protein  25.89 
 
 		 236 aa  49.7  0.001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.929624  normal  0.933998 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2904  TPR repeat-containing protein  25 
 
 		 265 aa  49.7  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000121078  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0966  hypothetical protein  27.88 
 
 		 2145 aa  49.7  0.001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.360119 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4478  TPR domain-containing protein  29.91 
 
 		 219 aa  48.5  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.404717  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2707  glycosyl transferase family protein  22.15 
 
 		 1486 aa  48.9  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.228337 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3751  tetratricopeptide TPR_2  26.17 
 
 		 204 aa  48.5  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.87227  normal  0.451472 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02811  hypothetical protein  23.31 
 
 		 837 aa  48.9  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.370164 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1312  TPR repeat-containing protein  27.9 
 
 		 1069 aa  48.9  0.002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.530092  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4081  methyltransferase type 12  40.23 
 
 		 456 aa  49.3  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000110716 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0336  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  22.99 
 
 		 557 aa  49.3  0.002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000572448  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4528  TPR domain protein  29.91 
 
 		 219 aa  48.5  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000798973  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7349  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  23.08 
 
 		 988 aa  49.3  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0738846  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1589  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  21.15 
 
 		 572 aa  48.9  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.499739 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4728  TPR repeat-containing protein  24.9 
 
 		 718 aa  48.5  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.346608 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6186  Tetratricopeptide TPR_4  33 
 
 		 2910 aa  48.1  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.23193 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0722  TPR repeat-containing protein  29.11 
 
 		 615 aa  48.1  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.434562 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4515  TPR domain protein  29.52 
 
 		 219 aa  48.1  0.003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.037102  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2876  NB-ARC domain protein  25.65 
 
 		 822 aa  48.5  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0721  TPR domain protein  29.52 
 
 		 219 aa  48.1  0.003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6182  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  23.14 
 
 		 1056 aa  48.5  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4290  TPR domain-containing protein  29.52 
 
 		 219 aa  47.8  0.004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4127  TPR repeat-containing protein  29.52 
 
 		 219 aa  47.8  0.004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0499017  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4624  TPR domain-containing protein  29.52 
 
 		 219 aa  47.8  0.004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.472019  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1146  hypothetical protein  24.71 
 
 		 299 aa  47.8  0.004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1449  tetratricopeptide TPR_2  21.18 
 
 		 1067 aa  48.1  0.004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0939  TPR repeat-containing protein  26.96 
 
 		 714 aa  47.8  0.004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0436  tetratricopeptide TPR_2  21.55 
 
 		 1056 aa  47.8  0.004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02857  tetratricopeptide repeat protein  25.45 
 
 		 391 aa  47.8  0.004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3401  Tetratricopeptide TPR_4  36.04 
 
 		 453 aa  47.8  0.004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0349174  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2645  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  22.19 
 
 		 572 aa  48.1  0.004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000110346  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3747  TPR repeat-containing protein  31.67 
 
 		 1005 aa  47.8  0.004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4475  TPR domain protein  29.52 
 
 		 219 aa  47.8  0.004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000190548 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2439  TPR repeat-containing protein  27.07 
 
 		 448 aa  47.4  0.005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0207467  normal  0.980065 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2953  TPR repeat-containing protein  24.51 
 
 		 711 aa  47.4  0.005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0781794 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11133  TPR repeat protein  29.25 
 
 		 417 aa  47.4  0.005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.474145  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0825  TPR repeat-containing protein  24 
 
 		 739 aa  47.4  0.006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.423694  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0949  TPR repeat-containing protein  23.04 
 
 		 1121 aa  47.4  0.006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0849269  normal  0.0980091 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0990  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.26 
 
 		 410 aa  47.4  0.006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.113297  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2708  tetratricopeptide TPR_2  23.15 
 
 		 979 aa  47.4  0.006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.169437 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>