186 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_0964 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007406  Nwi_0964  TPR and WD-40 repeat-containing protein  100 
 
 		 506 aa  1042    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.907164 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4322  Tetratricopeptide domain protein  42.68 
 
 		 550 aa  374  1e-102  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.576139 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3993  Tetratricopeptide domain protein  42.55 
 
 		 550 aa  354  2e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2840  tetratricopeptide TPR_4  30.12 
 
 		 420 aa  91.7  3e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.46747  normal  0.484223 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5827  cellulose biosynthesis protein CelD  26.92 
 
 		 397 aa  82  0.00000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.297647  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1016  glycosyl transferase, group 1  28.36 
 
 		 689 aa  77.4  0.0000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2360  cellulose biosynthesis protein CelD  24.66 
 
 		 382 aa  75.5  0.000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2696  glycosyl transferase, group 1  26.92 
 
 		 311 aa  73.9  0.000000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_875  hypothetical protein  29.26 
 
 		 329 aa  70.5  0.00000000006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.929392  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3028  TPR repeat-containing protein  33.05 
 
 		 620 aa  66.6  0.0000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.985806  normal  0.0142271 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2729  cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  24.12 
 
 		 393 aa  66.2  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.052022  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2643  cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  24.85 
 
 		 392 aa  65.5  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.140676  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2824  cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  24.12 
 
 		 393 aa  65.9  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.879866  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0959  hypothetical protein  32.2 
 
 		 620 aa  65.1  0.000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.868556 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2610  cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  23.67 
 
 		 401 aa  65.1  0.000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0722  TPR repeat-containing protein  33.05 
 
 		 615 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.434562 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1200  hypothetical protein  24.41 
 
 		 378 aa  62  0.00000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3746  TPR repeat-containing protein  34.15 
 
 		 602 aa  62  0.00000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.824926  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24101  hypothetical protein  26.15 
 
 		 725 aa  61.6  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0911  tetratricopeptide TPR_4  27.7 
 
 		 875 aa  61.2  0.00000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.379762  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2854  glycosyl transferase family 2  27.73 
 
 		 1252 aa  61.2  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.956112  normal  0.0955707 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1673  glycosyl transferase, group 1  23.65 
 
 		 355 aa  60.5  0.00000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.198509  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1840  TPR repeat-containing protein  28.81 
 
 		 3560 aa  60.5  0.00000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2406  tetratricopeptide TPR_2  30 
 
 		 436 aa  59.7  0.0000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24191  hypothetical protein  30.77 
 
 		 545 aa  58.9  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0891  hypothetical protein  22.84 
 
 		 329 aa  58.9  0.0000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24071  hypothetical protein  30.17 
 
 		 622 aa  58.5  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2475  peptidoglycan-binding LysM  35.56 
 
 		 632 aa  57.8  0.0000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00625277  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1003  hypothetical protein  28.31 
 
 		 325 aa  57.8  0.0000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.305983  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0549  TPR repeat-containing protein  29.03 
 
 		 635 aa  57.4  0.0000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1028  TPR repeat-containing protein  29.03 
 
 		 635 aa  57.4  0.0000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.608823  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0987  TPR repeat-containing protein  29.41 
 
 		 611 aa  57.4  0.0000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.384547  normal  0.0740288 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0588  TPR repeat-containing protein  32.11 
 
 		 613 aa  57  0.0000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3267  glycosyl transferase family 2  26.89 
 
 		 1252 aa  57  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0453  TPR domain-containing protein  28.91 
 
 		 626 aa  56.2  0.000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.311085  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3015  TPR domain-containing protein  28.91 
 
 		 626 aa  56.2  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3338  TPR repeat-containing protein  32 
 
 		 595 aa  56.6  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.257374 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1619  TPR domain-containing protein  28.06 
 
 		 626 aa  56.6  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0978258  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0190  TPR repeat-containing protein  34.68 
 
 		 601 aa  56.6  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4728  TPR repeat-containing protein  27.97 
 
 		 718 aa  56.2  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.346608 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0892  TPR repeat-containing protein  29.69 
 
 		 636 aa  56.6  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.647896  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3792  protein involved in cellulose biosynthesis (CelD)  23.6 
 
 		 331 aa  56.2  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7855  TPR domain-containing protein  30.47 
 
 		 648 aa  56.2  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.126864 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0301  TPR repeat-containing protein  27.61 
 
 		 1827 aa  55.5  0.000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0904  TPR repeat-containing protein  30.08 
 
 		 612 aa  55.5  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.587904  normal  0.769196 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1516  tetratricopeptide repeat family protein  28.46 
 
 		 561 aa  55.5  0.000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4141  TPR repeat-containing protein  28.23 
 
 		 637 aa  55.5  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.780051  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2599  TPR domain-containing protein  29.27 
 
 		 614 aa  55.1  0.000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0734298  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00731  hypothetical protein  22.44 
 
 		 816 aa  55.5  0.000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.456129 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0970  TPR domain-containing protein  29.27 
 
 		 614 aa  55.1  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2906  TPR repeat-containing protein  29.27 
 
 		 614 aa  55.1  0.000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0475913  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0177  TPR repeat-containing protein  29.27 
 
 		 614 aa  55.1  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0661  TPR repeat-containing methyltransferase  28.46 
 
 		 561 aa  54.7  0.000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.25847  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1841  TPR repeat-containing protein  28.81 
 
 		 3035 aa  54.7  0.000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2369  TPR repeat-containing protein  28.91 
 
 		 639 aa  53.9  0.000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.319986  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7517  hypothetical protein  30.91 
 
 		 703 aa  53.9  0.000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.328747  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6918  TPR repeat-containing protein  30.56 
 
 		 847 aa  53.9  0.000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.378966  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23981  hypothetical protein  25.62 
 
 		 587 aa  53.5  0.000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.167552 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2908  TPR repeat-containing protein  28.57 
 
 		 203 aa  53.5  0.000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0161  TPR repeat-containing protein  30.08 
 
 		 598 aa  53.1  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1801  cellulose biosynthesis protein CelD  34.51 
 
 		 376 aa  52.8  0.00001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0441  TPR repeat-containing protein  26.47 
 
 		 1085 aa  52.8  0.00002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.239248 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  25.89 
 
 		 878 aa  52.4  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24081  hypothetical protein  28.3 
 
 		 764 aa  52  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1077  glycosyl transferase group 1  31.49 
 
 		 690 aa  52.4  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.383593  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1759  TPR repeat-containing protein  28.21 
 
 		 207 aa  52.8  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2707  glycosyl transferase family protein  25 
 
 		 1486 aa  52  0.00003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.228337 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1074  glycosyl transferase group 1  31.84 
 
 		 690 aa  51.6  0.00004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3719  TPR repeat-containing protein  28.33 
 
 		 405 aa  51.6  0.00004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  30.36 
 
 		 4079 aa  51.2  0.00004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1389  TPR repeat-containing protein  28 
 
 		 700 aa  51.2  0.00005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.874801 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1087  TPR repeat-containing protein  28.57 
 
 		 808 aa  50.8  0.00005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5176  family 2 glycosyl transferase  29.67 
 
 		 434 aa  50.8  0.00006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.634801  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2034  TPR repeat-containing protein  29.03 
 
 		 416 aa  50.8  0.00006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2131  glycosyl transferase family protein  30.95 
 
 		 395 aa  50.4  0.00007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  27.19 
 
 		 1737 aa  50.4  0.00007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1211  TPR domain/sulfotransferase domain protein  33.91 
 
 		 695 aa  50.1  0.00008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2996  TPR repeat-containing protein  30.7 
 
 		 626 aa  50.1  0.00008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.637966  normal  0.0209641 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0651  TPR repeat-containing protein  27.2 
 
 		 878 aa  50.1  0.00009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.10746  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4767  sulfotransferase  25.22 
 
 		 682 aa  50.1  0.00009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.287127 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  25 
 
 		 810 aa  50.1  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  26.19 
 
 		 927 aa  49.7  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2893  O-linked N-acetylglucosamine transferase  32.26 
 
 		 397 aa  50.1  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.272299 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3643  TPR domain-containing protein  27.73 
 
 		 1979 aa  49.3  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2697  TPR repeat-containing protein  30 
 
 		 268 aa  49.7  0.0001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0000108911  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1518  TPR repeat-containing protein  26.61 
 
 		 597 aa  49.7  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00971618 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2967  TPR repeat-containing protein  32.14 
 
 		 614 aa  50.1  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.62 
 
 		 632 aa  48.9  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0685  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.2 
 
 		 883 aa  49.3  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0022  tetratricopeptide TPR_2  22.07 
 
 		 442 aa  48.9  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0148  TPR repeat-containing protein  27.13 
 
 		 619 aa  48.9  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1288  sulfotransferase  30.43 
 
 		 636 aa  48.9  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.494721  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4803  tetratricopeptide TPR_3  31.25 
 
 		 340 aa  48.1  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3221  hypothetical protein  25.55 
 
 		 395 aa  48.5  0.0003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.978135  normal  0.653443 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2322  TPR repeat-containing protein  30 
 
 		 935 aa  48.5  0.0003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0205826 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3148  Protein involved in cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  27.17 
 
 		 377 aa  48.5  0.0003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.61677  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1187  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.17 
 
 		 293 aa  48.1  0.0004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0548059  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1094  TPR repeat-containing protein  23.02 
 
 		 685 aa  47.8  0.0004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24161  hypothetical protein  26.09 
 
 		 661 aa  48.1  0.0004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0961  glycosyl transferase, group 1  24.28 
 
 		 358 aa  47.8  0.0005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>